عنوان پایان‌نامه
مطالعه شکلی ژن fgf۲در گاوهای نر آزمون نتایج شده هلشتاین ایرانی
- رشته تحصیلی
- علوم دامی - ژنتیک و اصلاح نژاد دام
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 45149;کتابخانه پردیس ابوریحان شماره ثبت: 357
- تاریخ دفاع
- ۱۵ تیر ۱۳۸۹
- دانشجو
- روح اله سبحانی
- استاد راهنما
- عبدالرضا صالحی
- چکیده
- ژن FGF2 در کروموزوم 17 بین دو ژن BBS12 و NUDT6 قرار دارد. طول این ژن حدود kb59 و دارای 3 اگزون می¬باشد. اگزون¬های این ژن یک پروتئین با 156 اسید آمینه را کد می¬کنند. ژن FGF2 در غده پستان گاو حضور دارد و در طی چرخه فحلی در بافت مخاطی رحم فعال می¬باشد. این ژن مسئول بیان اینترفرون-t می¬باشد. اینترفرون-t یک عامل مهم برای تشخیص و ادامه آبستنی در نشخوارکنندگان است. علاوه بر این، ژنهایی که توسط اینترفرون-t فعال می¬شوند با صفات تولید و ترکیبات شیر همبستگی دارند. در این مطالعه 101 اسپرم از گاوهای نر هلشتاین ایران مورد استفاده قرار گرفت. بعلت ارتباط فیزیولوژیک ژن FGF2 با مسیر بیولوزیک اینترفرون-t و ژنهای موجود در این مسیر این ژن برای این تحقیق انتخاب گردید. همچنین بر اساس مطالعات قبلی این ژن بعنوان یک ژن کاندید موثر بر برخی از صفات شیر معرفی شده بود. یک قطعه 710 جفت باز با استفاده از آغازگرهای رفت و برگشت تکثیر و سپس تمام 101 نمونه برای شناسایی جهش¬ها توالی¬یابی گردید. سه SNP در موقیت¬های (C/G)11474، (C/G)11513 و (A/G)11646 برای بررسی مورد توجه بودند. آلل¬های A، C و C آلل¬های نوع وحشی در موقیت¬های فوق محسوب می¬شوند. در این مطالعه تمام حیوانات مورد بررسی دارای آلل¬های A، C و C بودند و هیچ یک از این جایگاه¬ها چند شکل نبودند. یک جهش جدید در موقعیت 11863 که در آن باز تیمین به سیتوزین تبدیل می-شود، در یکی از نمونه¬ها مشاهده گردید. یک شکل بودن موقعیت 11646 در این جمعیت مورد مطالعه احتمالا می¬تواند نشان دهنده جهت¬گیری این جامعه بسمت حذف آلل G می¬باشد. در طی سال¬های گذشته نیز در ایران انتخاب بنفع افزایش مقدار تولید بوده است و این صفت نیز با صفت درصد چربی همبستگی ژنتیکی منفی دارد. کلمات کلیدی: ژن FGF2، هلشتاین ایرانی، چند شکلی، ژن کاندید
- Abstract
- ABSTRACT The fibroblast growth factor 2 (FGF2) gene is located on chromosome 17 between BBS12 and NUDT6 genes and it is about 59kb in length comprising 3 exons encode a 156-amino-acid protein. Fgf2 gene serves in the uterine endometrium during estrous presenting in the bovine mammary gland. It is responsible to express interferon-? (IFNT), which is an important factor to encourage the continuation of pregnancy in the ruminants. Significant association have been found between genes affected by IFNT and milk production traits. 101 semen samples of Iranian Holstein bulls were used in this study. FGF2 gene selected for this study as a candidate gene, because of its biological relationship with IFNT, STAT1 (Signal Transducer And Activator of Transcription), STAT2, OPN (Osteopontin) and UTMP (Uterine Milk Protein). A 710 base paire fragment in intron 1 amplified using forward and reverse primers. To find out single nucleotide polymorphism (SNP), all of samples were sequenced. Three positions including 11474 (C/G), 11513 (C/G) and 11646 (A/G) were attended to research. The C, C and A are known as wild type allels. In this study, All of investigated animals were distinguished as C, C and A alleles and there was no any polymorphism. Also we looked through for new SNPs and there was only one new SNP at position 11863 changing thymine to cytosine. The position 11646 was shown to be monomorph in the studied population which seems the pressure has been done on the elimination of the allele G. Moreover, in the two last decades in Iran selection was in favor of increasing milk yield which has negative genetic correlation with fat percentage. ¬ Key words: FGF2 gene, Iranian Holstein, polymorphism, candidate gene.
