عنوان پایان‌نامه
بررسی چندشکلی ناحیه مجموعهزنهای اصلی سازگار بافتی در طیور بومی استان خراسان
- رشته تحصیلی
- علوم دامی - ژنتیک و اصلاح نژاد دام
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 47810;کتابخانه پردیس ابوریحان شماره ثبت: 483
- تاریخ دفاع
- ۱۵ بهمن ۱۳۸۹
- دانشجو
- آناهیت نظری قادیکلائی
- استاد راهنما
- عبدالرضا صالحی, غلامرضا نیکبخت بروجنی
- چکیده
- در طیور مجتمع عمده¬ی سازگاری بافتی (MHC) شامل پروتئین¬های غشایی هترودیمر است که برای عرضه¬ی آنتی ژن به لمفوسیت¬های T ضروری می¬باشند و از سه ناحیه¬ی کلاس یک (BF) ، کلاس دو (BL) و کلاس چهار (BG) تشکیل شده است. این نواحی بخصوص کلاس یک و دو به شدت متنوع و در بین افراد متفاوت هستند. مجموعه¬ی ژنی B بر روی میکروکروموزوم 16 قرار گرفته است و در مقایسه با MHC پستانداران کوچکتر و ساده تر است ، بطوریکه تنها شامل 92 جفت باز و 19 ژن می¬باشد. اگزون دو از BF بخشی از مولکول MHC را رمز می¬کند که در ارتباط نزدیک با ساختار آنتی ژن¬های عرضه شده است و از تنوع قابل توجهی برخوردار است. انتخاب به کمک نشانگرها (MAS) توسط معرفی جایگاه¬های ژنی کمّی مرتبط با مقاومت (QTL) ازجمله MHC رویه¬ی بسیار جذابی به منظور توسعه¬ی مقاومت ژنتیکی است. MHC در طیور با تفاوت¬های مقاومت و یا حساسیت نسبت به بیماری¬های ویروسی ، باکتریایی ، پارازیتی و خود ایمنی مرتبط بوده و به عنوان یک موضوع با ارزش برای تحلیل¬های متمرکز در جهت انتخاب لاین¬های مقاوم و انتخاب صفات تولیدی نظیر تولید تخم مرغ مورد توجه قرار گرفته است. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی ناحیه¬ی MHC (BF) در مرغ بومی خراسان مرکزی ، DNA ژنومی از 140 نمونه خون طیور که شامل 59 نمونه جوجه¬ها و 81 نمونه والدین بود ، به روش رسوب نمکی استخراج شد. واکنش زنجیره¬ای پلی¬مراز به منظور تکثیر قطعه¬ی 186 جفت بازی اگزون دو کلاس یک MHC (BF) صورت گرفت. چند شکلی با استفاده از نشانگر چندشکلی فضایی رشته های منفرد (SSCP) تعیین گردید. از مجموع 140 نمونه ، هفت الگو مشاهده شد. چهار الگو مشابه با مطالعات قبلی بودند و سه الگو-ی b)، dو f) جدید به نظر می¬رسد. در میان هفت الگو ، الگوی a بیشترین فراوانی (1/47%) و الگوی f کمترین فراوانی (9/2%) را در کل جمعیت داشتند ، همچنین پنج الگوی a ، b ، d ، e وg در دو جمعیت مشابه بودند. این نتایج نشان داد که طیور بومی خراسان مرکزی از تنوع ژنتیکی MHC برای ناحیه¬ی BF برخوردار می¬باشد که می¬تواند ارتباط آن با صفات مقاومت به بیماری¬ها ، پاسخ به واکسن¬ها ، صفات پرورشی و ایمونولوژیکی مورد استفاده قرار گیرد. کلمات کلیدی: مجتمع عمده¬ی سازگاری بافتی ، انتخاب به کمک نشانگرها، مرغ بومی خراسان مرکزی، ساختار فضایی رشته¬های منفرد
- Abstract
- The MHC in the chicken is composed of heterodimeric transmembrane glycoproteins that are essential in the presentation of antigens to T-lymphocytes and contains three regions class I (BF), class II (BL) and class IV (BG). These regions especially class I and II are extremely polymorph and are distinct between individuals. The B-Complex is located on chromosome 16 and compared to the mammalian MHC is simpler and smaller and includes only 92 bp with 19 genes. The exon II of BF region encodes a portion of the class I antigen binding region and has a significant polymorphism. A marker assisted selection (MAS) by introducing of the resistance (QTL) including MHC is the attractive approach to develop the genetic resistance. Chicken MHC is associated with differences in resistance or susceptibility to viral, bacterial, ectoparasitic and autoimmune diseases and is considered as a valuable candidate for intensive analysis for resistance lines selection and effective breeding traits such as egg production. In order to study polymorphism at the MHC (BF) in Khorasan ecotype chicken, genomic DNA of 140 blood samples including 59 chicks and 81 parents, was extracted using salting-out method. PCR was carried out in order to amplify 186 bp fragment of target gene that covered exon II of MHC (BF). Polymorphism was detected using Single Strand Conformation Polymorphism (SSCP). Seven different patterns were observed from total of 140 samples. Four patterns were similar to the other studies and three patterns (b, d, and f) seem to be novel. Pattern a (47.1%) has the most and pattern f (2.9%) has the least frequency in the whole population. Five a, b, d, e and g patterns were similar in both chicks and parents populations. The results demonstrated that MHC (BF) diversity exists within Khorasan ecotype chicken that might be useful to investigate its association with resistance to disease, vaccines responsiveness, breeding and immunological traits. Key words: MHC, MAS, Khorasan ecotype chicken, SSCP
