عنوان پایان‌نامه
بررسی ارتباط چندشکلی ژن پروتئین متصل شونده به اسید چرب ۳- (H-FABP) گوسفندی با صفات عملکردی در نژادهای لری - بختیاری و زل
- دانشجو
- سحر جوادی نوشنق
- استاد راهنما
- محمد مرادی شهربابک
- رشته تحصیلی
- علوم دامی -ژنتیک و اصلاح نژاد
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 5664;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 60424
- تاریخ دفاع
- ۳۰ بهمن ۱۳۹۱
- چکیده
- صفات رشد و لاشه از صفات اقتصادی مهم در صنعت پرورش گوسفند می¬باشد. میزان و نوع چربی گوشت مصرفی دارای اهمیت فراوان از لحاظ سلامت تغذیه بوده و با رشد روز¬افزون آمار بیماران مبتلا به امراض قلبی-عروقی، توجه جامعه پزشکان، کارشناسان تغذیه و متخصصان اصلاح نژاد دام بیش از پیش به این بحث جلب شده است. FABP3 عضو یک خانواده بزرگ پروتئین¬های داخل سلولی متصل¬شونده به لیپید می¬باشند و تا کنون نه عضو از این خانواده شناسایی شده است که همگی آن¬ها در بافت¬های خاصی حضور دارند. FABP3 یا H-FABP به عنوان پروتئین قلبی متصل-شونده به اسید چرب شناخته شده است که به طور عمده در سلول-های ماهیچه¬ای قلبی و اسکلتی بیان می¬شود. علاوه بر آن در چندین بافت دیگر از جمله بافت¬چربی نیز حضور دارد. ژن FABP3 گوسفندی در کروموزوم شماره 2 قرار داشته و به عنوان ژن کاندیدای عملکردی برای صفات میزان تولید شیر و چربی شیر شناخته شده است. با توجه به شناخته شدن ژن FABP3 به عنوان ژن کاندیدای صفات چربی لاشه در خوک و نتایج مطالعات پیشین مبنی بر تایید اثر معنی¬دار پلی¬مورفیسم¬های مختلف این ژن بر صفات رشد و لاشه و هم¬چنین با توجه به عملکرد فیزیولوژیکی و بیولوژیکی آن، هدف از انجام این تحقیق، بررسی اثر دو پلی-مورفیسم اگزون 2(BsaJI) و اینترون 3(BanII) بر صفات رشد و لاشه و هم¬چنین فراسنجه ¬های خونی در 239راس گوسفند متشکل از 4 جمعیت شامل 2 نژاد لری-بختیاری و زل و آمیخته¬های زل-آتابای و مقایسه جمعیت¬های مورد مطالعه ونهایتا معرفی ژنوتیپ¬های مطلوب برای جایگاه¬های مذکور برای استفاده در برنامه¬های انتخاب حیوان برتر ازطریق MAS بود. برای استخراج نمونه¬های DNA از خون، از روش کلروفورم استفاده شد. واکنش زنجیره¬ای پلی¬مراز برای تکثیر قطعات با طول 222 جفت باز جهت بررسی جایگاه اگزون 2(BsaJI) و 357 جفت باز جهت بررسی جایگاه اینترون 3 (BanII) با استفاده از آغازگرهای اختصاصی انجام گرفت. محصولات PCR با استفاده از روش RFLP و آنزیم¬های برشی BsaJIو BanII مورد هضم قرار گرفتند. گرچه هر سه ژنوتیپ AA، AG و GG در مورد جایگاه اگزون 2 در جمعیت¬های تحت بررسی مشاهده شد، اما در مورد جایگاه اینترون 3 تمامی جمعیت¬ها حالت مونومورف را نشان دادند. فراوانی ژنوتیپ¬های AA، AG و GGبه ترتیب در جمعیت گوسفندان لری-بختیاری ایستگاهی 17/0، 44/0 و 39/0، جمعیت گوسفندان لری-بختیاری کشتارگاهی15/0، 52/0 و 33/0، جمعیت گوسفندان زل ایستگاهی 19/0، 48/0 و 33/0 و جمعیت گوسفندان آمیخته زل-آتابای 04/0، 63/0 و 33/0 بود. اثر پلی-مورفیسم ژنتیکی جایگاه اگزون 2 بر صفات میزان کلسترول و تری¬گلیسرید خون، وزن 3 ماهگی و وزن دنبه حیوانات کشتارگاهی معنی¬دار بود، اما بر صفات وزن تولد، وزن زنده قبل از کشتار، وزن لاشه، وزن دنبه گوسفندان ایستگاهی و وزن چربی محوطه شکمی معنی¬دار نبود. اثر نژاد بر صفات بررسی شده هنگامی که نژاد زل با نژاد لری-بختیاری و آمیخته زل-آتابای با نژاد لری-بختیاری مقایسه شد، معنی¬دار بود. تعادل هاردی-واینبرگ به غیر از جمعیت گوسفندان آمیخته زل-آتابای با 27 نمونه، برای جمعیت گوسفندان لری-بختیاری ایستگاهی با 77 نمونه، جمعیت گوسفندان لری-بختیاری کشتارگاهی با 54 نمونه و جمعیت گوسفندان زل با 81 نمونه برقرار بود.
- Abstract
- Growth and carcass traits are economically of great importance in sheep industry. Scientists believe that the quality and quantity of the meat fat consumed by consumers is one of the important issues in the domain of health, and with the ever-increasing number of people suffering from cardiovascular disease, more and more attention of the societies of physicians, food experts and animal breeding experts has been attracted to the issue. FABP3 gene is located in sheep chromosome 2, and has been introduced as a candidate gene for milk and fat yield. The objective of this study was to investigate two previously described single nucleotide polymorphisms in exon 2 (RFLP BsajI) and intron 3 (RFLP BanII) of H-FABP gene in four sheep samples ( 239 head) including Lori-Bakhtiari and Zel breeds and Zel- Atabay crossbred using PCR-RFLP approach. Then the association between the observed polymorphisms and growth traits and blood parameters were explored. The chloroform method was used to DNA extraction. In order to multiply the fragments of 222 and 357 bps to investigate exon 2 (BsaJI) and intron 3 (BanII), respectively, Polymerase Chain Reaction applied. The PCR products were digested through RFLP method and restriction enzymes of BanII and BasJI. The results of this study revealed that the exon 2 generated 3 genotypes including AA, AG, and GG. Being slightly different among the four samples, the genotypic frequencies for AA, AG and GG were respectively 0.17, 0.44 and 0.39 in the Lori-Bakhtiari sample of the breeding station, 0.15, 0.52, 0.33 in the Lori-Bakhtiari sample of the slaughter house, 0.19, 0.48 and 0.33 in the Zel sample of the breeding station and 0.04, 0.63 and 0.33 in zel-Atabay sample in the slaughter house. The effect of the polymorphism on the blood cholesterol and triglyceride, weaning weight and fat tail weight(of slaughter house) traits was significant while there was no significant effect on birth weight, pre slaughter live weight, fat tail weight (of the station) and abdominal fat weight traits. When comparing the Zel with Lori-Bakhtiari breeds (both of the stations) and the Lori-Bakhtiari breed with Zel-Atabay crossbred (both of the slaughter houses), the breed effects on traits were statically significant. The HW equilibrium, with exception of the Zel-Atabay sample with 27 animals, for the other three samples of station Lori-Bakhtiari (77 animals), slaughter house Lori-Bakhtiari (54 animals) and Zel (81 animals) was observed. The intron 3-situated site was
