عنوان پایان‌نامه
بررسی تنوع MHC در جمعیتهای طیور بومی ارومیه و سویه تجاری Cobb با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
- دانشجو
- شهرام علی یاری
- استاد راهنما
- حسن مهربانی یگانه
- رشته تحصیلی
- علوم دامی -ژنتیک و اصلاح نژاد
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 5371;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 58142
- تاریخ دفاع
- ۱۵ بهمن ۱۳۹۱
- چکیده
- گزینش ژنتیکی برای افزایش مقاومت ژنتیکی به بیماری¬ها یک روش نوین برای درمان و یا کنترل بیماری¬های دامی محسوب می¬شود. مجموعه سازگاری بافتی(MHC) یکی از مجموعه¬های ژنی است که ارتباط آن با مقاومت یا حساسیتبهبرخیازبیماری-هایخودایمن،ویروسی،باکتریائیوانگلی در گونه¬های مختلف حیوانی و انسان مشخص شده است. البتهبسیاریازخصوصیاتغیروابستهبهسیستمایمنیمانندمیزانتولیدنیزدربرخیحیواناتتوسطخوشهژنیMHCکنترلمی¬شوند. ژن¬هایMHCبهعنوانیکموضوعباارزشبرایتحلیل¬هایمتمرکز درطیور،جهتانتخابجمعیت¬هایمقاومبهبیماری¬هاباویژگی-هایپرورشیموثر،موردتوجهقرارگرفته است. بهطورمعمولMHCطیوربااستفادهازروش¬هایسرم شناسیموردبررسیقرارمی¬گیرد. متاسفانهاینروش¬هامحدودیت-هاومشکلاتزیادیدارند. نشانگر ریزماهواره LEI0258در داخل منطقه MHCو روی کروموزوم 16 طیور واقع شده است. تحقیقان نشان داده است که این نشانگر به دلیل موقعیت فیزیکی مناسب و عدم تعادل پیوستگی بالایی که با آلل¬ها و هاپلوتیپ¬های MHCدارد و همچنین تنوع آللی مناسب، می-تواند به عنوان یک شاخص ژنتیکی برای بررسی تنوع MHCدر طیور مورد استفاده قرار گیرد. از این رو، در این پژوهش تنوع MHCجمعیت¬های طیور بومی ارومیه و تجاری سویه کاب با استفاده از نشانگر¬ ریزماهواره LEI0258مورد مطالعه قرار گرفت. از 133 نمونه بافت طحال مرغان جمعیت بومی ارومیه و96 نمونه بافت طحال مرغان تجاری سویه کابDNAژنومی استخراج شد و این نمونه¬ها برای جایگاه ریزماهواره LEI0258با استفاده از واکنش زنجیره پلی¬مراز و الکتروفورز ژل پلی آکریل آمید، ژنوتایپ شدند. بعد از تجزیه و تحلیل نتایج مشخص شد که در جمعیت بومی ارومیه 24 آلل و در جمعیت تجاری کاب 20 آلل برای این جایگاه شناسایی شده است. فراوان¬ترین آلل¬ در جمعیت بومی ارومیه آلل 264 با فراوانی 9/13 درصد و در جمعیت تجاری کاب آلل 397 با 8/19 درصد مشاهده شد. همچنین میزان هتروزایگوسیتی مشاهده شده برای جمعیت بومی ارومیه 73/0 و برای جمعیت تجاری کاب 78/0 مشاهده شد. یافته¬های این پژوهش بیانگر بالا بودن تنوع MHCدر دو جمعیت مورد مطالعه بود و مقایسه نتایج جمعیت بومی ارومیه با نتایج سایر جمعیت¬هاییکه قبلا در این زمینه مورد مطالعه قرار گرفته¬اند، بیانگر این بود که این جمعیت تا به امروز بالاترین تنوع آللی را برای این نشانگر نشان داده¬ است.
- Abstract
- Genetically selection to enhance resistance against diseases has been considered as a new method to cure or control livestock diseases. Major histocompatibility complex (MHC) is one of the gene sets whose relationship with resistance against or sensitivity to a number of autoimmune, viral, bacterial and parasitic diseases has been identified in different animal species and human. However, in some cases there are non-immune traits such as production rate, which are controlled through MHC gene sets. MHC gene sets has drawn attention as a worthwhile issue in centralized poultry analysis in order to select resistant populations against diseases, which possess effective raising characteristics. Generally, the poultry MHC is investigated through serology methods owning numerous problems and restrictions. Microsatellite LEI0258 markers are located within MHC region on poultry chromosome 16. Researches have shown that this marker can be used as a genetically indicator to explore poultry MHC diversity due to its appropriate physical location, high linkage disequilibrium with alleles and MHC haplotypes as well as its desired allelic diversity. Therefore, in current study, MHC diversity in poultry populations of indigenous Urmia and commercial strain Cobb were studied using LEI0258 microsatellite marker. 133 and 96 genomic DNA samples were extracted from spleen tissues of indigenous Urmia and commercialstrain Cobb respectively, followed by amplifying respective fragments via PCR technic before genotyping by means of polyacrylamide gel electrophoresis. Analysis on results revealed that there were 24 and 20 alleles related to the site in indigenous Urmia and commercial Cobb populations respectively. As regards indigenous Urmia poultry population, the most frequently observed allele was allele 264 with a frequency of 13/9 %, while allele 397 was the most frequently observed allele in commercial Cobb strain population with a frequency of 19/8%. Observed heterozygosity rates for theindigenous Uremia population and the commercial Cobb strain populations were 0/37 and 0/78 respectively. Results of this study implied that MHC diversity level was quite high within the two studied populations and allelic variation for this marker within indigenous Urmia population stood at the highest level compared to results produced through investigating other populations already studied
