عنوان پایان‌نامه
مطالعه ارتباط چند شکلی اگزون ۱ ژن کاندید GDF۹ با صفت چند قلوزایی در نژادهای رومانف، لری بختیاری، کرمانی و آمیخته مربوطه
- رشته تحصیلی
- مهندسی کشاورزی - علوم دامی - اصلاح نژاد دام
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 69126
- تاریخ دفاع
- ۲۶ بهمن ۱۳۹۳
- دانشجو
- حامد رضائی
- استاد راهنما
- محمد مرادی شهربابک
- چکیده
- ژن GDF9 از جمله ژنهای موثر بر چندقلوزایی وکنترل کننده نرخ تخمکریزی در گوسفند میباشد. در این پژوهش برای مشخص کردن جهشهای تک نکلئویدی و چند شکلی اگزون1 ژن GDF9 با روش تفاوت چندشکلی فضایی تک رشتهها ((SSCP و توالییابی DNA در 230 راس گوسفند نژاد رومانف، کرمانی، لریبختیاری و آمیختههای رومانف با لریبختیاری و کرمانی انجام پذیرفت. DNAبا روش استخراج نمکی استخراج شد. کمیت و کیفیت DNA استخراج شده توسط الکتروفورز و اسپکتروفتومتر مورد ارزیابی قرار گرفت. 447 جفت باز، شامل اگزون 1ژن GDF9 با استفاده از واکنشهای زنجیرهای پلیمراز (PCR) تکثیر گردید. سه جهش تک نوکلئوتیدی در چهار الگوی باندی شناسایی شد (ژنوتیپ¬های TT ، AA، AG و GG) که منجر به تغییر در دو اسیدآمینه شده بود. بررسی ارتباط بین الگوهای ژنوتیپی با صفت چندقلوزایی در گوسفندان مورد مطالعه نشان داد که سطوح مختلف ژنوتیپ‌های اگزون یک ژن GDF9 بر این صفت اثر معنیداری دارد (P<0.05).
- Abstract
- GDF9 geneis well known to have important effectson litter size and ovulation rate in sheep. In the present study,single nucleotide mutations and polymorphisms of GDF9 gene exon 1 were detected by single strand conformational polymorphism (SSCP) analysis and DNA sequencingmethods in 230 Romanov, Kermani, Lori-Bakhtiari sheep breeds and their Romanov crossbreds. DNA was extracted by salting out method. Quality and Quantity of those extracted hereditary materials were evaluated using electrophoresis and spectrophotometer. 447-bp fragments including exon 1 of GDF9 gene were amplified usingPCR reaction. Three SNPS were identified in four different SSCP patterns of GDF9 gene (TT,AA, AG and GG genotypes) in which deducedtwo amino acids exchanges. The evaluation of theassociation between the SSCP patterns with litter sizetrait revealedthat GDF9 exon 1 genotypes have significant effect on this trait (P<0.05). Keywords: Sheep,Litter Size,polymorphisms, GDF9.
