عنوان پایان‌نامه
تخمین فراورانی حاملین جهش حذفی ژن شیوع بیماری و فراوانی هاپلوتیپ منسوب به جهش میان ایرانیان با استفاده از ریز آرایه ها
- رشته تحصیلی
- زیست‌شناسی-علوم‌سلولی‌مولکولی
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه پردیس علوم شماره ثبت: 3758;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 41033
- تاریخ دفاع
- ۳۰ شهریور ۱۳۸۷
- دانشجو
- حسین نظاری
- استاد راهنما
- الهه الهی, سیدجلال زرگر
- چکیده
- خلاصه سیستیک فیبروزیز(CF ) شایع ترین بیماری اتوزومی مغلوب در بسیاری از جوامع اروپایی است. تقریباً یک در 2500 تولد جمعیت اروپا مبتلا به این بیماری هستند، میانگین فراوانی حاملین آن برابر با 1:25 می باشد. علت این بیماری جهش در ژن CFTR می باشد. از میان بیش از 1500 جهش شناخته شده، آلل حذفی F508 شایع ترین این جهش ها ومهمترین علت بروز بیماری CF در دنیا می باشد. فراوانی این جهش با شیب کاهشی از شمال غرب اروپا ( دانمارک 88% ) به جنوب شرق اروپا ( ترکیه، ایران 16% ) گزارش شده است. در این تحقیق به منظور بدست آوردن فراوانی حاملین جهش حذفی F508، این جهش در1200 نمونه فرد سالم با استفاده از تکنیک ARMS-PCR مورد بررسی قرار گرفت. ایران به پنج منطقه جغرافیایی تقسیم شد و افراد سالم از این مناطق انتخاب شدند، به دنبال آن، با توجه به اهمیت این جهش و این مطلب که تقریباَ همه آللهای حذفی F508 شناخته شده در بیماران CF با هاپلوتیپ یکسانی پیوستگی دارند، برآن شدیم که هاپلوتیپ آللهای حذفی F508 را در میان افراد سالم جامعه با استفاده از تکنیک ریز آرایه و با کمک نشانگرهای دو آللی(SNPها) شناسایی کنیم. پنج فرد حامل جهش حذفی F508 شناخته شد که با احتساب فراوانی این جهش میان انواع جهش های بیماری زا در ژن CFTR میان بیماران ایرانی شیوع حاملین 1 در 35 تخمین زده شد. آلل جهش یافته در پنج فرد حامل همواره با هاپلوتایپ TGAGCGG پیوستگی داشت. قابل توجه بود که همین هاپلوتیپ، هاپلوتیپ نسبتاً شایعی میان افراد سالم برخی مناطق ایران بود. با توجه به نتایج بدست آمده احتمال می رود منشاء جهش حذفیF508 در همان منطقه ای که هاپلوتیپ مذکور شایع است بوده باشد.
- Abstract
- Cystic fibrosis is the most common life-threatening autosomal recessive disease in many Caucasian populations. Approximately one in 2500 newborns in populations of European ancestry are affected, wherein the average carrier frequency is 1:25. The disease is caused by mutations in CFTR gene. Among the more than 1500 mutations identified in the CFTR gene, the p.F508del allele is the most common worldwide. Its frequency exhibits a northwest to southeast gradient, ranging from a high of 88% in Denmark to a low of approximately 16% in Iran. We have now experimentally determined the frequency of p.F508del carriers among 1200 normal randomly selected Iranians from five geographical regions by ARMS-PCR technology, and Because of all delta F508 mutations were found on the same SNP haplotype background, we have developed a microarray system which we expect can be used for interrogating tens of questions simultaneously for tens of samples. This platform has been used to determine the frequency of the CFTR intragenic SNP haplotype associated with the common delF508 mutation in hundreds of Iranians. Based on the number of carriers identified and the observation that this allele accounts for of the CFTR mutated alleles of the Iranian population, the frequency of carriers of CFTR mutations was calculated to be 1/35, and all heterozygous for the delta F508 mutation in this report consistent with its association with haplotype TAAGCGG.
