عنوان پایان‌نامه
« مطالعه تنوع بیماریزایی و ساختار ژنتیکی جمعیت های Wilsonomyces carpophilus در استان آذربایجان غربی »
- رشته تحصیلی
- مهندسی کشاورزی - بیماری شناسی گیاهی
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 5700;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 61993
- تاریخ دفاع
- ۰۹ شهریور ۱۳۹۲
- دانشجو
- الناز سرابی
- استاد راهنما
- محمد جوان نیکخواه
- چکیده
- لکه¬غربالییکی از بیماری¬های مهم و اقتصادی درختان میوه هسته¬دار در استان آذربایجان غربی و نقاط دیگر ایران است که توسط قارچ Wilsonomyces carpophilusایجادمی¬گردد. این بیمارگر گونه¬های مختلف جنس Prunusرا آلوده می¬کند و موجب کاهش کمی و کیفی محصولات می¬گردد. به دلیل اهمیت این بیماری، در این تحقیق،تنوع بیماری¬زایی28 جدایه و تنوع ژنتیکی 71 جدایه از گونه¬ی W. carpophilusبه¬دست آمده از درختان میوه¬ی هسته¬دار مختلف (زردآلو، هلو، بادام، آلبالو، گیلاس و آلو)در شهرستان¬های خوی و ارومیه در سال-های نمونه¬برداری 1378 و 1391، با استفاده از نشانگر مولکولی URP-PCR و چهار آغازگر 38F، 2F، 2R و 17R مورد مطالعه قرار گرفت. در بررسی¬ بیماری¬زایی، اختلاف معنی¬داری بین شدت بیماری¬زایی جدایه¬های مورد بررسی مشاهده گردید ولی ارتباطی بین نوع میزبان، منطقه جغرافیایی و سال نمونه¬برداری با شدت بیماری¬زایی این جدایه¬ها مشاهده نگردید. تجزیه و تحلیل الگوی انگشت¬نگاری DNA و مقایسه جدایه¬ها بر اساس 51 باند DNA چند شکل تکثیر شده، بر اساس ضریب تشابه دایس و روش UPGMA و با کمک نرم¬افزار NTSYSpc.2.02e انجام گرفت. طبق دندروگرام¬های رسم شده، در تمام حالات مورد بررسی (گروه¬بندی بر اساس میزبان¬های مختلف درختان میوه هسته¬دار و مناطق جغرافیایی و سال نمونه¬برداری، فقط بر اساس سال نمونه¬برداری، فقط بر اساس میزبان زردآلو و فقط بر اساس منطقه¬ی نمونه¬برداری)، نتایج نشان داد که جدایه¬های قارچ بر مبنای مناطق جغرافیایی از یکدیگر تفکیک نشدند. همچنین جدایه¬ها بر اساس میزبان و سال نمونه¬برداری نیز از یکدیگر تفکیک نشدند. شاخص¬های تنوع ژنتیکی شامل تنوع ژنی (h) و شاخص شانون (I) و فاصله ژنتیکی بین جمعیت¬ها بر اساس ضریب Nei، با استفاده از نرم افزار PopGen 32 برای دو جمعیت [جغرافیایی (خوی و ارومیه)، سالیانه¬ی (1378 و 1391) و سالیانه¬ی میزبان زردآلو] و چهار جمعیت جغرافیایی و زمانی محاسبه شدند و بر این اساس تنوع ژنتیکی نسبتاٌ زیادی درون جمعیت¬های گونه¬ی W. carpophilus در تمام حالات مورد بررسی، مشاهده شد. تنها سهم کوچکی از تنوع در بین جمعیت-ها وجود داشت. نتایج تجزیه واریانس مولکولی AMOVA که به کمک نرم¬افزار GenALEX version 6.1 محاسبه شد، نشان داد که تنوع درون جمعیت¬های مورد بررسی، بالای 98% از سهم کل تنوع ژنتیکی جمعیت¬ها را شامل می¬شود، در حالی¬که زیر3% از تنوع ژنتیکی بین جمعیت¬های مختلف وجود دارد که نشان دهنده¬ی عدم تمایز بین گروه¬های مختلف است. تنوع ژنتیکی زیاد در درون جمعیت¬ها و تنوع کم موجود بین جمعیت¬ها که در آزمون URP-PCR مشاهده شد، نشان¬دهنده¬ی یک جریان ژنی فعال بین جمعیت¬های این مناطق می¬باشد.
- Abstract
- Shot hole disease that caused by Wilsonomyces carpophilus is one of the most economically important diseases of stone fruit trees in west Azerbaijan province and other stone fruit cultivating areas of Iran. The fungal pathogen attacks Prunus spp. and reduces the quality and quantity of products. Due to importance of disease, in this study, genetic diversity was analyzed for seventy one isolates of W. carpophilus collected from stone fruit trees (apricot, peach, almond, sour cherry, cherry and plum) at two areas, Khoy and Uremia in the spring of two years 2007 and 2012. The isolates were subjected to pathogenicity tests and DNA fingerprinting analysis through URP-PCR by using four primers (38F, 2F, 2R and 17R).In pathogenicitystudy,significant differencebetween thedegreesofpathogenicity in the isolates was observed.Communicationbetweenthe hostandgeographic region and sampling time (year)with pathogenecity were notobserved. Molecular data analysis was performed based on 51 polymorphic DNA bands by using PopGen 32, GenALEX version 6.1and Nei coefficient. Dendrogram was degenerated by NTSYSpc.2.02software program using UPGMA method and Dice coefficient.In phenetic analysis, inallthe cases(grouped according to differenthosts of stone fruittreesandgeographic areas and years of sampling, only on the basis ofyearof sampling,onlyonthe basishostapricot and only on thebasis sampling areas), isolates of W. carpophilus were not separated into distinct groups according to geographic region, host plant and sampling time (years). Indices of population genetic structure including: gene diversity (h), Shannon’s index (I) and genetic distance between two geographical populations (Khoy and Urmia populations), two sampling time populations (2007 and 2012) andFourgeographically and temporallypopulations were analyzed based on Nei coefficient by using PopGene 32software. According to the results, high genetic diversity was observed within different populations. In general, based on AMOVA analysis, up to 98% of observed molecular variance was related to within geographic populations and below 2% was found among them. High genetic diversity within populations and low diversity between them indicates the existence of active gene flow between fungal populations in sampling areas.
