عنوان پایان‌نامه
« بررسی مولکولی تنوع ژنتیکی در جمعیتهای مختلف پسیل پسته (Agonoscena pistaciae) در استان کرمان »
- رشته تحصیلی
- حشره شناسی کشاورزی
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 5663;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 60348
- تاریخ دفاع
- ۲۵ شهریور ۱۳۹۲
- دانشجو
- سمیه روح اللهی
- استاد راهنما
- جاماسب نوزری
- چکیده
- درخت پسته با نام علمی Pistacia vera L. (Anacardiaceae) یکی از مهمترین محصولات در ایران، ارمنستان، عراق، ترکمنستان و ترکیه می¬باشد و به طلای سبز معروف است. پسیل معمولی پسته، Agonoscena pistaciae Burckhardt and Lauterer (Hom.: Aphalaridae) به علت گسترش در همه مناطق کاشت پسته در ایران، یکی از مهمترین آفات درخت پسته می¬باشد. در این مطالعه که به منظور بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت-های پسیل پسته در مناطق مختلف جغرافیایی استان کرمان انجام شد، دو نوع مارکر مولکولی مختلف شامل دومین ناحیه جداکننده رونویسی¬شده داخلی ژنوم هسته¬ای (ITS2) و زیرواحد 1 سیتوکروم اکسیداز ژنوم میتوکندریایی (COI) استفاده شدند. پسیل¬ها از 8 شهرستان استان کرمان شامل سیرجان، شهربابک، بردسیر، زرند، راور، بم، رفسنجان و کرمان جمع¬آوری شدند. برای هر جمعیت 3 تکرار در نظر گرفته شد. دی¬ان¬ای حشرات کامل که در الکل 9/99% نگهداری شده بودند، با پروتکل چلکس استخراج و سپس محصولات تکثیر شده با پی¬سی¬آر، روی ژل آگارز 1% الکتروفورز شدند. محصولات پی¬سی¬آر هر 24 نمونه توالی-یابی و داده¬ها با نرم¬افزار MEGA5.1 و روش¬های Neighbor-Joining وUPGMA آنالیز شدند. درخت فیلوژنی 24 نمونه پسیل پسته که با بوت¬استرپ 1000 برای هر دو ماکر COI و ITS2 رسم شد، دو گروه مجزا را نشان داد که اکثر افراد 8 جمعیت در یک گروه قرار گرفتند و تنها یک تکرار بعضی جمعیت¬ها گروه دومی را تشکیل دادند که نشان می¬دهد این افراد در حال جدا شدن یا فاصله گرفتن از بقیه افراد جمعیت خود بوده و احتمالا بیوتیپ جدیدی را تشکیل می-دهند. در بخش دیگری از این مطالعه وجود یا عدم وجود همزیست ولباخیا توسط توالی wsp مورد بررسی قرار گرفت و نتایج، عدم آلودگی جمعیت¬ها به این باکتری را نشان دادند.
- Abstract
- The pistachio, Pistacia vera L. (Anacardiaceae), is one of the most important horticultural products in Iran, Armenia, Iraq, Turkmenistan, and Turkey and is known as the green-gold tree. The common pistachio psylla, Agonoscena pistaciae Burckhardt and Lauterer (Hom.: Aphalaridae), is one of the most significant pests of pistachio trees due to its widespread distribution in all pistachio-producing regions of Iran. In this study to identify genetic differences among psyllid populations from different geographic locations using two different types of markers, nuclear gene internal transcribed spacer 2 (ITS2) and mitochondrial gene cytochrome oxidase subunit genes I (COI). Psyllids were collected from each of eight townships of Kerman province, including Sirjan, Shahrbabak, Bardsir, Zarand, Ravar, Bam, Rafsanjan and Kerman population. Three replicates for each population were considered. DNA was extracted from 99.9% ethanol-preserved adults using the Chelex protocol and then amplified products for each markers by using polymerase chain reaction (PCR), were electrophoresed on 1% agarose gels. PCR products of 24 populations were sequenced and data were analysed using MEGA 5.1 software and Neighbor-Joining and Maximum Parsimony methods. The phylogenetic trees representing 1000 bootstrap replications for ITS2 and COI of these 24 psyllid populations have displayed two distinct groups that most of members of eight populations grouped together and one replication of some population formed another group. It shows that members of this group are separating from others in their population and are forming a new biotype. In another part of this study, absence or presence of Wolbachia symbiont by wsp sequence was investigated. The results revealed that no infection was detected within population. ITS2 sequences of all individuals sampled were very similar indicating that all psyllids were of the same species, regardless of geographic location.
