عنوان پایان‌نامه
بررسی تغییرات توال یافت شده در اگزون های....
- رشته تحصیلی
- زیست‌شناسی-علوم‌سلولی‌مولکولی
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه پردیس علوم شماره ثبت: 3924;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 43157
- تاریخ دفاع
- ۱۵ مهر ۱۳۸۸
- دانشجو
- زینب فضلعلی
- استاد راهنما
- الهه الهی
- چکیده
- چکیده در این مطالعه ژن PRKN در 93 بیمار ایرانی مبتلا به پارکینسون با میانگین سنی 2/42 سال که رابطه ی خویشاوندی با هم نداشتند، مورد مطالعه قرار گرفت. بررسی تغییرات تک نوکلئوتیدی با توالی یابی مستقیم همه ی اگزون ها و بررسی بازآرایی های آن با روش PCR نیمه کمی انجام گرفت. این ژن قبلاً در جمعیت ایرانی مطالعه نشده بود و نتایج ما تکمیل کننده مطالعه قبلی روی ژن LRRK2 در بیماران ایرانی بود. هفت جهش متفاوت در ژن PRKN شناسایی شد. یکی از این ها، IVS9+1A>G، جایگاه پیرایش را تحت تأثیر قرار داده و جدید است. در شش بیمار که حامل دو الل بیماری زا بودند، سن بروز بیماری (7/25 سال) به طور قابل توجه ای پایین تر از میانگین سن بروز 93 بیمار مورد مطالعه بود. از میان بیماران حامل جهش تنها یک بیمار با یک الل بیماری زا بود که سن بروز آن 41 سال گزارش شده بود. این داده ها بیان کننده ی این نکته است که 30% بیمارانی با سن بروز زیر 30 سال حامل جهش در ژن PRKN هستند، در حالیکه تنها 7/2% از بیماران با سن بروز 30 سال به بالا حامل جهش در این ژن بوده اند. هاپلوتایپ جهش های ژن PRKN با کمک شش SNP شایع درون ژنی تعیین شدند تا هاپلوتایپ های شایع که با هر یک از جهش ها همراه است، مشخص شود. به طور کلی جهش های ژن PRKN در درصد قابل توجهی از بیماران ایرانی با سن بروز پایین یافت نشدند. برای تأیید بازآرایی های شناخته شده در روش PCR نیمه کمی، از روش RT-PCR استفاده شد. اگرچه این بازارایی ها با این روش تأیید نشد ولی منجر به شناخت رونوشت جدیدی از mRNA پارکین شناخته شد. این رونوشت جدید بین اگزون 9 و 10، تعداد 86 نوکلئوتید اضافی دارد. این 86 نوکلئوتید به عنوان یک اگزون جدید طی مکانیسم دگر پیرایش وارد mRNA شده است. این اگزون جدید در چهارچوب نبوده و سبب می شود که ترجمه پروتئین بعد از ساخت اگزون 9 و اضافه کردن دو اسیدآمینه به پروتئین پارکین پایان پذیرد. این پروتئین جدید قسمتی از دومین IBR و تمام دومین RING2 را ندارد. این رونوشت جدید 363 اسیدآمینه ای که در خون یافت شد، در بیشتر بیماران مورد مطالعه و افراد کنترل قابل تشخیص بوده و احتمال این وجود دارد که عملکرد متفاوتی در خون داشته باشد.
- Abstract
- Abstract We present results of mutation screening of PRKN gene in 93 unrelated Iranian Parkinson’s disease patients with average age at onset of 42.4 years. The gene was screened by direct sequencing and by a semiquantitative PCR protocol that allowed detection of sequence rearrangements. This gene has not previously been studied in the Iranian population, and the results complement our previous results on LRRK2 mutations. Seven different PRKN mutations were found. One of these, IVS9+1A>G, affects splicing and is novel. Two mutated PRKN alleles were observed in each of six patients and their average age at onset (25.7 years) was notably younger than the cohort at large. Only one patient carried a single mutated allele and his age at onset was older (41 years). These figures show that 30% of patients with age at onset of less than 30 years had two mutated alleles, and only 2.7% with age at onset of 30 years or later carried a PRKN mutation. Haplotypes defined by six common intragenic SNPs were described for the PRKN mutation harboring alleles. Disease associated mutations in genes so far screened have not been identified in the majority of Iranian PD patients studied. We found a new isoform for PARKIN protein in peripheral blood by RT-PCR. The new mRNA has an additional 86 bases between exons 9 and exon 10. The new protein has 363 amino acids. This insertion is out of frame; hence translation has been stopped after 7 bases in this fragment. The new protein has not RING 2 domain and its IBR domain is not complete. This new protein may have new function in the blood.
