عنوان پایان‌نامه
مطالعه ترمودینامیکی و نظری برهمکنش آلبومین سرم انسانی با برخی از مشتقات سینامویل کومارین ها
- رشته تحصیلی
- بیوفیزیک
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکز تحقیقات بیوشیمی و بیوفیزیک شماره ثبت: 11316ب;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 64840
- تاریخ دفاع
- ۲۰ بهمن ۱۳۹۲
- دانشجو
- آناهیتا خمری
- استاد راهنما
- علی اکبر صبوری, محمد حسین کریمی جعفری
- چکیده
- سینامویل کومارین های پلی اکسیژنه به عنوان سری جدیدی از ترکیبات ضد سرطان طراحی و ساخته شده و بر سه رده سلولی K562 (لوسمی میلوئیدی مزمن انسان)، MOLT-4 (لوسمی حاد لنفوبلاستیک انسان) و MCF-7 (سرطان پستان انسان) به وسیله MTT (3-(4و5-دی متیل تیازول-2-ایل)2و5-دی فنیل تیرازولیوم) آزمایش گردیدند. برهمکنش دو نمونه از اثربخش ترین ترکیبات فوق، (E)-7-هیدروکسی-3-(3- ]2 و 3[ دی متوکسی فنیل) اکریلیل)-2-کرومن -2-اون (DAC) و (E)-3-(3- بنزو [d]]1 و 3[ دی اکسل-5-ایل) اکریلیل)-6-هیدروکسی2 H- کرومن-2-اون (BAC) بر آلبومین سرم انسان (HSA) مورد بررسی قرار گرفت. آلبومین، فراوان ترین پروتئین حامل پلاسمای خون است که ساختاری کروی و متشکل از آلفا هلیکس دارد و دارای دو جایگاه اتصال دارو برای ترکیبات مختلف می باشد. در این مطالعه تمرکز بر جزئیات برهمکنش در سطوح مولکولی، از طریق مطالعات تئوری و ترمودینامیکی می باشد. تکنیک فلورسانس ذاتی، خاموشی آلبومین توسط لیگاندهای مذکور را نشان داده و برای آن مکانیسم استاتیک را پیشنهاد می کند. تعداد جایگاه های اتصال و پارامترهای اتصال با مطالعات تیتراسیون گرمایی همدما به دست آمد. یافتن جایگاه اتصال، با مطالعات رقابتی بر سیستم های HSA-DAC و HSA-BAC به وسیله وارفارین صورت گرفت. روش انتقال انرژی رزونانسی، فاصله میان دو لیگاند مذکور (DAC و BAC) را از تریپتوفان 214 به ترتیب 2/3 و 9/2 نانومتر محاسبه نمود. اندازه گیری های دو رنگ نمایی دور و نزدیک جهت نشان دادن تغییرات ساختار دوم و سوم آلبومین در غلظت های مختلف مشتقات مورد مطالعه، انجام پذیرفت و مشخص نمود که آلبومین سرم انسان، حامل مناسب و سازگاری برای DAC و BAC می باشد. تحلیل نتایج داکینگ بر مجموعه ای از ساختارهای کریستالوگرافی شده آلبومین سرم انسان، بهترین موقعیت های اتصالی برای DAC و BAC و نیز مهمترین نیروهای اندرکنشی و ریشه¬های اسیدآمینه درگیر در آن را شناسایی نمود.
- Abstract
- A new series of polyoxygenated cinnamoylcoumarins derivatives was synthesized as new anticancer compounds and were tested against the viability of human chronic myelogenous leukemia (K562), human acute lymphoblastic leukemia (MOLT-4) and human breast adenocarcinoma (MCF-7) cell lines by using MTT (3- (4,5- dimethylthiazol -2- yl) -2,5-diphenyl tetrazolium bromide) assay. Among them, the effects of (E) -3- (3- (2, 3- Dimethoxyphenyl) acryloyl) -6-hydroxy- 2H chromen -2-one (DAC) and (E) -3- (3-(Benzo [d] [1,3] dioxol- 5-yl) acryloyl) -6-hydroxy -2H chromen -2-one (BAC) as the potent compounds were investigated on the human serum albumin (HSA). HSA as the major carrier of blood components is the most abundant plasma protein. It is a member of the globular proteins family with an alpha-helical structure and has two sites for binding many various drugs. This study was focused on the interaction details in molecular levels by thermodinamics and theoretical studies. Intrinsic fluorescence technic indicated the interaction between two selected derivatives with HSA and was suggested the mechanism of quenching was static. The number of binding site and the thermodynamic parameters were measured by isothermal calorimetric technic. Competitive studies were performed on the HSA-DAC and HSA-BAC systems by warfarin to find the binding site. By Fluorescence resonance energy transfer study for DAC and BAC, the distance between ligands and Trp214 in the binding site were obtained 3.20 and 2.96 nm, respectively. Far and near circular dichroism studies were performed to measure the changing of secondary and tertiary structures of HSA under the different concentration of DAC and BAC that means HSA can be the compatible carrier for DAC and BAC. The results of docking on the ensemble structures of HSA indicated the best modes of binding ligand conformers in the binding site and identified the important interactions and residues involving in them.
