عنوان پایان‌نامه

بررسی برخی الگوهای تغییر DNA گیاه نخود در واکنش به تنش سرما



    دانشجو در تاریخ ۲۰ بهمن ۱۳۹۲ ، به راهنمایی ، پایان نامه با عنوان "بررسی برخی الگوهای تغییر DNA گیاه نخود در واکنش به تنش سرما" را دفاع نموده است.


    محل دفاع
    کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 62493;کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 6049
    تاریخ دفاع
    ۲۰ بهمن ۱۳۹۲
    دانشجو
    آیدا راکعی
    استاد راهنما
    رضا معالی امیری

    تنش¬های محیطی غیرزنده، از عوامل محدود کننده¬ رشد و عملکرد محصولات زراعی بوده و نقش مهمی در توزیع و پراکنش اکولوژیکی گیاهان دارند. در سازگاری گیاه به تنش، مکانیسم¬های متعددی در سطوح مولکولی، بیوشیمیایی و فیزیولوژیکی فعال شده که به بقا و پایداری عملکرد کمک می¬کند. توانایی سازگاری بین گونه¬های گیاهی متفاوت بوده و نیاز به برنامه¬ریزی مجدد تظاهر ژن دارد که تنظیم آن بخشی وابسته به تغییرات اپی¬ژنتیکی شامل تغییر در الگوی متیلاسیون DNA است. در این تحقیق تغییر میزان متیلاسیون DNA تحت تیمارهای سرما پس از یک، سه و شش روز در ژنوتیپ متحمل(11439) و حساس (ILC533) نخود کابلی به موازات برخی پاسخ‌های بیوشیمیایی مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که الگوی متیلاسیون در ژنوتیپ‌های متحمل و حساس با یکدیگر تفاوت معنی داری دارند. با طولانی‌تر شدن دوره تنش میزان متیلاسیون DNA در ژنوتیپ متحمل کاهش و در ژنوتیپ حساس افزایش یافت. متیلاسیون سیتوزین تحت تنش سرما اغلب در سیتوزین خارجی هر دو رشته DNA ژنومی اتفاق افتاد. دمتیلاسیون در ارقام متحمل بیشتر از ارقام حساس بوده و به نظر می‌رسد که تغییر الگوی متیلاسیون در ژنوتیپ متحمل در جهت افزایش بیان و در ژنوتیپ حساس در جهت کاهش فعالیت ژن‌ها بود. همراه با تغییر الگوی متیلاسیون، تغییرات شاخص‌های دفاع (آنزیم آنتی اکسیدان) و خسارت (MDA) نیز در ژنوتیپ‌ها اتفاق افتاد که تایید کننده نتایج فوق در سطح بیوشیمیایی و فیزیولوژی می‌باشند. بررسی چنین شاخص‌هایی ممکن است در ارزیابی ژنوتیپ‌ها در تنش‌های محیطی و شناسایی ژن‌های تحمل به سرما در نخود مورد استفاده قرار گیرد.
    Abstract
    Abiotic stresses are the important limiting factors of growth and crop production. They have crucial role in the ecological disperse of plants. All living organisms specially plants have developed many different mechanisms on physiological, biochemical and molecular levels for the purpose of adaptation to stresses. Ability to response under environmental stresses can be different among genotypes and even species within genus. This phenomenon needs a vast reprogramming of gene expression that its regulation is in part dependent on epigenetic modifications including alternations in histones and DNA methylation. n this study, changes in DNA methylation under cold stress teratment after one , three and six days in two genotype resistant(11493) and sensitive (ILC533) along with some biochemical responses were studied . The results showed that methylation patterns in tolerant and sensitive genotypes differed significantly, with long-term stress loss of DNA methylation in tolerant and sensitive genotypes increased. Cytosine methylation under cold stress often occurs in external cytosine in both strand of pea genome. Demethylation is often occure in tolerant genotype and seems to change methylation patterns in tolerant genotypes moves to increased expression and in sensitive genotype moves to decrease in activity of genes. Along with changes in methylation patterns, changes in the parameters (antioxidant enzyme) and damage (MDA) occurred in the genotypes that confirming these results in biochemical and physiologocal states. Study in this parameteres can be use to the study in genotypes in enviromentes stress and cold stress tolerent genes in pea. Keywords: Adaptation, DNA methylation, epigenetic, Gene expression, Stress