عنوان پایان‌نامه
مطالعه دو بیماری مخرب دستگاه عصبی : گلوکوم ؛بررسی اثر فاکتورهای رونویسی FOXC۱و PITX۲ بر راه انداز ژن های هدف پارکینسون غربالگری جهش در ژن PARK۷ ( DJ-۱) در بیماران مبتلا با بروز اولین علائم در بازه ی سنی ۳۱ تا ۴۰ سال
- رشته تحصیلی
- زیست شناسی - علوم سلولی وملکولی
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه پردیس کیش شماره ثبت: 1088;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 58912;کتابخانه پردیس کیش شماره ثبت: 1088;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 58912
- تاریخ دفاع
- ۳۱ شهریور ۱۳۹۱
- دانشجو
- احمد صدیقی گیلانی
- استاد راهنما
- الهه الهی
- چکیده
- هدف این پژوهش بررسی برخی ژن‌های مرتبط با دو بیماری دستگاه عصبی بود. در بخش نخست قصد داشتیم تأثیر دو فاکتور رونویسی FOXC1 و PITX2 را بر راه‌انداز هفت ژن هدف بسنجیم. این فاکتورهای رونویسی از جمله عوامل ژنتیکی بیماری گلوکوم بوده و در نتیجه ژن‌هایی که بیانشان توسط آن‌ها تنظیم می‌گردد می‌توانند در تکوین چشم مؤثر باشند. انتخاب هفت ژن ALDH1A1، LDLRAD2، NOMO2، PLEKHG5، GNG5، PLP2 و AUH به واسطه‌ی مطالعات ریزآرایه و سپس بررسی‌های بیوانفورماتیک دیگران بود که به ترتیب منجر به شناسایی تعدادی از ژن‌های هدف این دو فاکتور رونویسی و سپس تعیین تخمینی بهترین ژن‌هایی شد که این دو فاکتور می‌توانستند به راه‌اندازشان اتصال یابند. ما از آزمون راه‌انداز برای سنجش اتصال دو فاکتور رونویسی به راه‌اندازها استفاده کردیم و در نهایت موفق شدیم بررسی بیان سه ژن LDLRAD2، GNG5 و PLEKHG5 را به پایان برسانیم. نتیجه‌ی حاصل این بود که FOXC1 اثری روی راه‌انداز LDLRAD2 نداشته اما فعالیت راه‌انداز دو ژن GNG5 و PLEKHG5 را افزایش می‌دهد. همچنین PITX2 فعالیت راه‌انداز LDLRAD2 را کاهش داده، روی راه‌انداز GNG5 اثر نکرده و فعالیت راه‌انداز PLEKHG5 را افزایش می‌دهد. در بخش دوم قصد ما غربالگری جهش‌های ژن PARK7 در ?? بیمار ایرانی بود. این ژن از جمله دلایل بروز بیماری پارکینسون است. تکثیر هفت اگزون این ژن در واکنش PCR و سپس توالی‌یابی محصولات منجر به شناسایی یک جهش بیماری‌زا در اگزون پنج و چندین جهش در اینترون‌های مختلف شد که اثری بر اسپلایسینگ نداشتند. به غیر از یک تغییر اینترونی، همگی این جهش‌ها پیش‌تر در جمعیت‌های دیگر گزارش شده بودند.
- Abstract
- The Aim of this thesis was to investigate genetic contribution on two neurodegenerative disorders. In the First part, the effects of FOXC1 and PITX2 on the promoters of their target genes were assessed. Defects in these Transcription factors can cause Glaucoma. 849 and 41 target genes were identified for FOXC1 and PITX2, respectively, by means of microarray. Using Bioinformatics tools, we candidate ALDH1A1, PLP2, LDLRAD2, NOMO2, GNG5, PLEKHG5 and AUH for promoter assay. We then amplified the promoter region of these genes. The resulting amplicons cloned into a firefly luciferase reporter vector. Co-transfection of these constructs along with FOXC1 or PITX2 containing vectors into HeLa cell and using Dual luciferase assay revealed the effects of FOXC1 and PITX2 on promoters of their target genes. FOXC1 increased the promoter activity of GNG5 and PLEKHG5 but had no effect on LDLRAD2 promoter. PITX2 increased the promoter activity of PLEKHG5 and decreased the promoter activity of LDLRAD2. In the second part, we performed a Mutation screening for PARK7 in the patients with age of onset in fourth decade of life. We identified one disease-causing mutation in exon 5 and several neutral mutations in introns. All of these mutations were reported previously. Keywords: FOXC1, PITX2, Glaucoma, Parkinson, PARK7, DJ-1
