عنوان پایان‌نامه
بررسی مولکولی مقاومت به استرس شوری در باکتری اسموتولرانت نسی بومی ایران
- رشته تحصیلی
- زیست‌شناسی-علوم‌سلولی‌مولکولی
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه پردیس علوم شماره ثبت: 3908;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 42768
- تاریخ دفاع
- ۱۸ مهر ۱۳۸۸
- دانشجو
- حسین برزنونی
- استاد راهنما
- مهران حبیبی رضائی
- چکیده
- چکیده از این نظر که کشور ما ایران جزء یکی از مناطق خشک و کویری جهان به حساب می¬آید، بررسی در زمینه خزانه ژنتیکی میکروارگانیسم¬ها و گیاهان بومی که نسبت به شوری و خشکی مقاوم هستند از اهمیت زیادی برخوردار است. در این تحقیقات سعی بر آن است که این منابع را به خوبی شناخته و امکان انتقال آنها را به محصولات کشاورزی استرات‍ژیک در جهت افزایش رشد اقتصادی , و نیز پیشرفت هر چه بیشتر در زمینه¬های مطالعاتی و تحقیقاتی مهندسی ژنتیک و بیولوژیک میسر سازد. یکی از راه¬های دستیابی به این خزانه ژنتیکی شناسایی و استخراج ژن¬های کد کننده پروتئین¬های محافظ اسمزی در باکتری¬های هالوتولرنت منطقه است. برای رسیدن به این هدف، به مطالعه توانایی مقاومت اسمزی در باکتری هالوتولرنت استخراج شده از معدن نمک واقع در شهرستان نیشابور برای جداسازی باکتری هالوتولرنت کار را شروع کردیم. در این رابطه پس از کشت¬های مکرر باکتری¬ها در محیط¬هایی با غلظت متفاوت نمک NaCl ، سرانجام گونه باکتری را بعنوان نمونه اصلی مورد مطالعه در جهت تحقیقات آینده برای شناسایی ژن¬های دخیل در مقاومت و سازگاری، انتخاب نمودیم. در ادامه برای شناسایی تغییرات پروتئینی ایجاد شده تحت شرایط متفاوت اسمزی محیط از تکنیک¬های پروتئومیکسی از جمله SDS-PAGE، IEF electrophoresis و IPG electrophoresis استفاده نمودیم. بعداز این مرحله برای شناسایی و تشخیص تفاوت بیان پروتئینی بین نمونه باکتری کشت داده و لکه¬های پروتئینی را که میزان بیان آنها در بین نمونه¬های مختلف تغییر نموده را بعنوان پروتئین¬های موردنظر انتخاب نمودیم.
- Abstract
- Abstract The study of molecular aspect of osmotic stress in certain Iranian endemic moderately osmotolerant bacteria. Our country, Iran, is located in droughty region in the worth, so it is important to study the genetic pool of microorganisms and local plants which are tolerated to salinity and droughty. In this study, we would like to study these sources to provide economical progress by transferring them to strategic agricultural products and also to progress in genetic engineering and biological studies. One of the ways to obtaining these genetic pools identify and isolating genes which expressed osmoprotector proteins from local halo-tolerant bacteria. To achieve this goal, we study the halo-tolerance ability in halo-tolerant bacteria which isolated from salt mine located in Neishabour and identify it by 16S-rRNA identification method. Therefore, at first we started our research by sampling soil from mine. After rapidity bacterial culture in media with difference salt concentration (0%-15%), finally we studies to identify genes which important in salt tolerance. To identify protein changes under difference environmental osmotic conditions, we applied proteomic techniques such as SDS-PAGE, IEF electrophoresis, IPG electrophoresis. To identify proteins spots which expressed under osmotic stress, we compare protein profiles together and selected proteins spots which up or down their expression. To future studies, we can identified these proteins spots by Mass-spectrometry and sequencing and used them to identify and isolate gene sequences which expressed them and use them to genetically manipulating in other microorganisms plants such as rice to provide economical progress. Key words: osmotic stress, osmotolerant bacteria, osmoprotector proteins, halo tolerant bacteria, SDS-PAGE, IEF electrophoresis, IPG electrophoresis, genetic pool, Mass-spectrometry
