عنوان پایان‌نامه
ارتباط چند شکلی ژنهای کاندیدای لپتین و DGAT۱ با صفات رشد، شیر و برخی از پارامترهای خونی در بزهای نژاد مهابادی
- دانشجو
- زهرا عزیزی
- استاد راهنما
- محمد مرادی شهربابک, حسین مرادی شهربابک
- رشته تحصیلی
- علوم دامی -ژنتیک و اصلاح نژاد
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 4957;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 54221
- تاریخ دفاع
- ۲۹ شهریور ۱۳۹۱
- چکیده
- این پژوهش با هدف مطالعه چند شکلی یک جایگاه ژن کاندید DGAT1 و دو جایگاه ژن کاندید لپتین و ارتباط تغییرات این چند شکلی ها با صفات رشد و تولید شیر در بز نژاد مهابادی انجام شد. برای این منظور از تعداد 150 راٌس از بزها و بزغاله های مهابادی موجود در مزرعه آموزشی و پژوهشی گروه علوم دامی دانشگاه تهران با استفاده از ونوجکت های 5mL حاوی ماده ضد انعقاد EDTA از سیاهرگ وداج خونگیری به عمل آمد. پس از استخراج DNA با استفاده از روش نمکی تعیین کمیت و کیفیت آن توسط اسپکتروفتومتر و ژل آگارز1% بررسی شد. تکثیر قطعه اختصاصی بخشی از اگزون سوم ژن لپتین با 471 جفت باز و بخشی از اگزون و اینترون دوم ژن لپتین با 271 جفت باز و بخشی از اگزون 17 ژن DGAT1 با 309 جفت باز به کمک واکنش های زنجیره ای پلیمراز انجام شد. برای بررسی چند شکلی این بخش از روش چند شکلی فضایی تک رشته ای )DNA SSCP) استفاده شد. در کل برای دو جایگاه ژن لپتین الگوهای باندی یکسان بوده و چند شکلی بین این 150 نمونه مشاهده نشد. اما مطالعه اگزون سه، شش جهش مشاهده شد که پنج جهش قبلاً در بز گزارش شده بود ولی جهشی که در موقعیت نوکلئوتیدی 3145(تغییرآدنین به گوانین) رخ داده بود، فقط در گاو گزارش شده است. برای اگزون و اینترون دو هفت جهش مشخص شد که این جهش ها نیز قبلاً در بز گزارش شده بود. در ژن DGAT1 نیز پس از بررسی ژل ها چهار الگوی باندی متفاوت با فراونی 45/0 (الگوی4)، 25/0(الگوی 3)، 24/0(الگوی 2)، 06/0 (الگوی 1) مشاهده شد. در این جایگاه شش جهش مشاهده شد که چهار جهش بین الگوهای مشاهده شده یکی بوده و قبلاً هم در بز گزارش شده است ولی دو جهش دیگر یکی در موقعیت8290 ( حذف و درج سیتوزین )، که الل C با فراوانی 308/0 و فراوانی حذف برابر با 692/0 بود. جهش دیگر در موقعیت 8384 (تبدیل تیمین به سیتوزین)که اللC با فراوانی 054/0 و الل تیمین با فراوانی 946/0که پیش از این در هیچ کدام از بررسی¬ها گزارش نشده و جهش اول در الگوی یک و جهش دوم در الگوی سه مشاهده شد. نتیجه این جهش¬ها سه ژنوتیپ در این جایگاه بود. ژنوتیپ یک (الگوی دو) با فراوانی 69/0، بیشترین فراوانی را داشته و ژنوتیپ سه(الگوی سه) با فراوانی 06/0، کمترین فراوانی، و ژنوتیپ دوم(الگوی یک) با فراوانی25/0 ، فراوانی حد واسط را داشت. نتایج ارزیابی ها گویای این بود که بین ژنوتیپ ها و صفات تولید شیر(p<0/01)، درصد چربی(p<0/05) و درصد پروتئین(p<0/05) شیر ارتباط معنی¬داری وجود داشته، و ژنوتیپ سه علیرغم فراوانی کم، بیشترین تآثیر را روی تولید شیر داشت. ولی بین ژنوتیپ¬ها و صفات رشد از قبیل وزن تولد، وزن از شیرگیری، وزن نهایی و مقدار خوراک مصرفی تفاوت معنی داری وجود نداشت.
- Abstract
- Abstract The aim of this research was to study polymorphism of two loci of leptin gene and exon 17 DGAT1 gene and their associations with growth and milk production traits in mahabadi goat. Blood sample were collected from150 Mahabadi goat belong to the Department of Animal Science the University of Tehran (Karaj). DNA was extracted using chloroform method, DNA quality and quantitative determined with spectrophotometer and 1% agarose gel. A fragment of third Exon and exon and intron 2of leptin gene and exon 17 DGAT1 gene was amplificated using the polymerase chain reaction. SSCP (single strand conformation polymorphism) technique was used to study polymorphism of this fragment of DNA.Developing pattern show the same pattern for leptin gene in all animals and was monomorph.and for DGAT1 gene, A total four SSCP patterns band were observed with frequency patterns of 1-4, were 0/37, 0/19, 0/21 and 0/23 respectively. After the sequencing were observed 6 mutations in exon 3 and 7 mutations in exon and intron 2 of leptin gene. The results of this research were showed the mahabadi goat breed for these mutations are monomorph and this mutations ordinary was reported in another breeds of goats except one mutation in exon3 on 3145(A/G) nucleotides that was reported in Ovis areis and Bos Taurus.for DGAT1 gene were observed 6 mutations that 4 mutations in all patterns were observed and was reported formerly in another breed of goats. But we were detection two new SNPs in nucleotides 8290(-/C), C allel with frequency 0/308 and deletion frequency was 0/692 in 1 pattern, and 8384(T/C), C allel with frequency 0/054 and T allel was 0/946 in 3 pattern. The results of these mutations were 3 genotype for this locus. genotype 1 with 69 frequency percent was the most frequency and genotype 3 with 6 frequency percent was the least frequency and genotype 2 with 25 frequency percent was the Intermediate frequency.The results of this research were showed between genotypes and traits such as milk production (p<0/01), fat percent (p<0/05) and protein percent(p<0/05), there is a significant relation that genotype 3 had a significant effect on milk production and on the other between genotypes and traits such as body weight, weaning weight, the final weight and average feed intake, there is not a significant relation.
