عنوان پایان‌نامه
شناسایی لوچ ماهیان حوضه آبخیز رودخانه چومان بانه - استان کردستان با استفاده از تکنیک DNA barcoding
- رشته تحصیلی
- مهندسی منابع طبیعی- بوم شناسی آبزیان شیلاتی
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 5210;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 57398
- تاریخ دفاع
- ۲۵ شهریور ۱۳۹۱
- دانشجو
- ادریس قادری
- استاد راهنما
- حمید فرحمند, محمدعلی نعمت الهی
- چکیده
- فوق‌خانواده Cobitoidea بعد از کپور ماهیان متنوع‌ترین گروه ماهیان آب شیرین می‌باشد. این گروه از ماهیان در آبهای شیرین اوراسیا و شمال آفریقا پراکنش دارد. بر خلاف تنوع بسیار بالایشان مطالعات بسیار کمی روی این گروه از ماهیان انجام گرفته است. گونه‌های زیادی از این گروه از ماهیان دارای اسامی علمی متنوعی می‌باشند و هنوز اکثر ماهی‌شناسان در مورد طبقه‌بندی آنها اتفاق نظر ندارند که همین امر مطالعه آنها را بسیار پیچیده نموده است. در ایران، خصوصا غرب ایران تنوع لوچ ماهیان بالاست اما اکثر گونه‌های این مناطق ناشناخته مانده‌اند و یا به دلیل ضعف در روشهای مبتنی بر ریخت‌شناسی شناسایی آنها با مشکل مواجه شده است. روش DNA barcoding یکی از نوین‌ترین روشهای شناسایی است که از DNA میتوکندری برای شناسایی موجودات استفاده می‌نماید. این روش بسیار دقیق بوده و قدرت تفکیک بالایی دارد و از آن به عنوان ابزاری مفید برای شناسایی و همچنین بررسی روابط تبارشناسی استفاده می‌شود. در این مطالعه سعی شده است تا با استفاده از این روش و توالی ژن cytochrome b، لوچ ماهیان رودخانه چومان شناسایی و با استفاده از توالی سایر لوچ ماهیان مربوط به فوق‌خانواده Cobitoidea طبقه‌بندی جامع و کلی برای این گروه از ماهیان ارائه شود. نتاج این بررسی نشان می‌دهد که شباهت درون گونه‌ای این ژن در میان لوچ ماهیان مورد مطالعه بسیار بالا بوده، بطوریکه کمترین مقدار K2P در این چهار گونه برابر با 18/0%، مربوط به گونهO. zagrosensis و بیشترین مقدار برابر با 67/0% در گونه T. kosswigi بوده است. همچنین با استفاده از این ژن درخت تبارشناسی فوق‌خانواده Cobitoidea ترسیم شده و نتایج آن نشان داد که رابطه این فوق‌خانواده به صورت(Vaillantellidae + ((Gyrinocheilidae + Botiidae) + Ellopostomidae)) + (Catostomidae + (Balitoridae + (Cobitidae + Nemacheilidae)))) می‌باشد.
- Abstract
- Fishes of the superfamily Cobitoidea are part of a major lineage of freshwater fishes in the Asia, Europe and northe-east Africa. This group has the most complicated identification and phylogenetic relationship which are confused yet. Morphological identification of loaches has always been a problem; hence the development of reliable molecular tools for species distinction is a priority for these fishes. The aim of this study was identification of 4 loach species from Choman river basin and reconstructs the phylogenetic relationships of Cobitodea on the base of the DNA barcoding and mitochondrial cytochrome b gene sequencing. The result of this study demonstrate that the DNA barcoding is a rapid and accurate mean of identifying loach fishes to a species level. According to the results, average Kimura-2-parameter (K2P) distance of within species in Choman loaches was 0.47%, whereas average within species, genus, and family in Cobitoidea superfamily were 0.3%, 8.76%, and 14.78% respectively. Sequence of superfamily Cobitoidea cytochrome b in GENE BANK was used to estimate the phylogenetic relationship of these fishes by minimum evolution, and neighbour-joining method. Our result showed that the phylogentic relationship of this group is (Vaillantellidae + ((Gyrinocheilidae + Botiidae) + Ellopostomidae)) + (Catostomidae + (Balitoridae + (Cobitidae + Nemacheilidae)))). This classification is in agreement with proviusly propose on phylogenic position of this group by molecular method which placed thier members into 8 distinct families.
