عنوان پایان‌نامه
بهینه سازی عمل جذب مولکول انسولین به گیرنده های سطحی سلول در بیماری دیابت نوع دو
- رشته تحصیلی
- مهندسی شیمی-داروسازی
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه پردیس یک فنی شماره ثبت: 1821.;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 79368;کتابخانه پردیس یک فنی شماره ثبت: 1821.;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 79368
- تاریخ دفاع
- ۳۱ مرداد ۱۳۹۵
- دانشجو
- منیر شیبانی
- استاد راهنما
- فرهنگ جلالی فراهانی, رضا ضرغامی
- چکیده
- در این پایان نامه تلاش شد تا گامی در جهت تکمیل مدل شبکه ی پیچیده ی پیام رسانی انسولین برداشته شود. برای نیل به این هدف در ابتدا مطالعه ی گسترده ای بر روی مدل های پیشین صورت گرفت و پس از بررسی دقیق مدل های پذیرفته شده در این زمینه، مدل برنمارک به عنوان مدل پایه ای و به عنوان هسته و اسکلت اولیه ی مدل نهایی انتخاب گردید. در گام بعد بخش هایی از مدل صداقت مانند زیرمدل PI3K و PKC و نیز بخش هایی از مدل کارلون مانند زیرمدل AMPK و TSC به مدل پایه (برنمارک) افزوده شد. پس از ایجاد مدل نهایی که در مقایسه با نمونه های پیشین جامع تر می باشد، اطلاعات مربوط به مکانیسم تولید گلیکوژن از مراجع معتبر استخراج و به مدل وارد گردید. لازم به ذکر است که بخش مربوط به تولید گلیکوژن برای نخستین بار، در این پروژه به شبکه ی پیام رسانی انسولین وارد گردید و مدل های پیشین فاقد این بخش می باشند. پس از تکمیل مدل نهایی بهینه سازی مدل با استفاده از الگوریتم ژنتیک صورت گرفت و سازگاری قابل قبولی با داده های تجربی بدست آمد. در نهایت به منظور اعتبارسنجی مدل نهایی از حدود 20 درصد داده های تجربی استفاده و نتایج مربوط گزارش گردید.
- Abstract
- In this thesis we tried to complete the model of insulin signaling network. In this regard first of all, we had a comprehensive review on previous models in this field and finally Branmark model (2013) was choosen as basic model. At next step to development of comprehensive final model, important parts of Sedaghat model (2002) like PI3K and PKC submodels and Carlon model (2014) like AMPK and TSC submodels added to basal model (Branmark). At next step gelycogen synthesis mechanisms was added to this new model. It should be noted that gelycogen synthesis part considered in this model for first time and in previous models this part was neglected. After completing of final model, we optimized the new model parameters by means of Genetic Algorithm and great fitness was obtained. Finally for validation of complete model, 20 percent of experimental data were used and final results were reported. Keywords: Modeling, insulin signaling network, Genetic Algorithm, Optimization
