عنوان پایان‌نامه
مطالعه ژن گیرنده ملانوکورتین ۱ (MC۱R) و ارتباط آن با رنگ موهر در بزهای مرخز
- رشته تحصیلی
- مهندسی کشاورزی - علوم دامی - اصلاح نژاد دام
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 7166;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 77808;کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 7166;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 77808
- تاریخ دفاع
- ۱۲ دی ۱۳۹۵
- دانشجو
- مجاهد حمه کریم
- استاد راهنما
- سیدرضا میرائی آشتیانی
- چکیده
- چندین نژاد بز برای محصول پوششی آنها پرورش داده می شوند که دو گروه اصلی آنها بز آنقوره و بز کشمیر هستند. موهر تولید شده در دنیا بیشتر به وسیله بز آنقوره میباشد که سویه ای از آن، بز مرخوز نامیده می شود. پرورش بز مرخوز در منطقه خاورمیانه به حدود 10000 سال قبل برمی گردد که در مراتع رشته کوه های زاگرس و دشت های خشک ایران و عراق پرورش داده شده اند. رنگ موهر نقش اساسی در مارکتینگ آن ایفا می کند و معمولا قیمت الیاف سیاه بیش از قهوه ای و نوع قهوه ای بیش از سفید می باشد. در این پژوهش به بررسی ژن MC1R و تاثیر آن بر رنگ کلی الیاف در بز مرخز پرداخته شده است. از 125 راس بز مرخز در کردستان عراق و 21 راس در کردستان ایران نمونه گیری به عمل آمد. استخراج DNA به روش استخراج با فنول انجام شد و پرایمر برای انجام SSCP به گونه ای طراحی شد که در طی دو واکنش PCR این اگزون تکثیر شود. سپس نمونه ها را روی ژل عمودی بردیم و برای قطعه bp 485 دو الگو و قطعه 447bp سه الگوی مختلف مشاهده کردیم. در قطعه bp485 در نقطه 221 از توالی، در یکی از الگوها هموزیگوت CC و در الگوی دیگر هتروزیگوت CT مشاهده کردیم که در آن اسید آمینه پرولین به لوسین تبدیل شده است. فراوانی آللی برای آلل های C و T به ترتیب 8.9 و 91.1 درصد بود. در قطعه 447bp در نقطه 786 از توالی شاهد هتروزیگوت TG در یکی از الگوها و هموزیگوت GG و TT در دو الگوی دیگر بودیم که هیچ تغیری در توالی آمینواسیدها ایجاد نکرده است. فراوانی آللی برای آلل G و T به ترتیب 82.8 و 17.2 بدست آمد. برای هر دو اسنیپ نمونه جامعه در حالت تعادل نبود. با انجام آزمون کایاسکوئر برای بررسی ارتباط ژنوتیپ ها با فنوتیپ بر اساس اطلاعات این پژوهش هیچ ارتباطی بین ژن MC1R و فنوتیپ کلی در نژاد بزهای مرخز تشخیص داده نشد.
- Abstract
- Several breeds of goats are breeding for fiber products, of which two main groups are goats producing cashmere and mohair. The mohair produced in the world is mainly dependent to Angora goat, a strain of that is called Markhoz. Breeding of Markhoz goat in the Middle East goes back to 10000 years ago in the pastures and dry lands of Zagros Mountains of Iran and Iraq. Mohair color plays a key role in marketing and usually price of black fiber is more than brown and brown is also over white. this study is about, MC1R gene and its effect on the coat color of Markhoz goat. Samples were taken from 125 goats in Iraqi Kurdistan region and 21 goats of Kurdistan province of Iran. DNA extraction was performed with phenol extraction and the primers for SSCP were designed in such a way that two PCR reaction, propagate the undelying fragment. Then we took the samples on the gel and observed two different models for 447bp fragment and three different models for 485bp fragment. After sequencing the models in 485bp fragment at point 221, we have seen CC homozygote in one of the models and CT heterozygote in the other one, where it converted Proline amino acid to Leucine amino acid. Allele frequency for C and T alleles where 8.9 and 91.1, respectively. In 447bp fragment at point 786, we have seen TG heterozygote in one of the models and TT , GG homozygotes in the other two models. This SNP has not made any changes in the amino acid sequence. Allele frequencies for G and T alleles were 82.76 and 17.24, respectively. For both SNPs population was not hardy-winberg equilibrium. By doing Chi-square test for the relationship between genotypes and phenotypes, based on data from this study it is concluded that no relationship between MC1R gene and phenotype could be realized in Markhoz goats breed. Key words: Markhoz goat, Mohair fiber, Coat color, MC1R gene
