عنوان پایان‌نامه
تنوع ژنتیکی اکوتیپ های ماش (Vigna radiata) بر اساس صفات مورفولوژیک، نشانگرهای بیوشیمیایی و مارکر SSR
- رشته تحصیلی
- مهندسی کشاورزی-اصلاح نباتات
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 7188;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 78076;کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 7188;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 78076
- تاریخ دفاع
- ۰۵ مرداد ۱۳۹۵
- دانشجو
- مسعود شاهسواری
- استاد راهنما
- سیدعلی پیغمبری
- چکیده
- جهت ارزیابی و شناخت تنوع ژنتیکی و تعیین روابط ژنتیکی اکوتیپ های ماش، تعیین رابطه فنوتیپی و رابطه عملکرد دانه در بوته با سایر صفات مورد بررسی، 406 اکوتیپ ماش مربوط به بخشی از کلکسیون ماش پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران در قالب یک طرح آگمنت در مزرعه تحقیقاتی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی تهران در سال 1393 مطالعه شد. نتایج تجزیه های آماری نشان داد که بین اکوتیپ ها از نظر صفات مورد بررسی اختلاف معنی داری وجود دارد که نشان دهنده وجود تنوع ژنتیکی بین اکوتیپ ها می باشد. با توجه به نتایج حاصل از همبستگی های ساده فنوتیپی، همبستگی جزئی، رگرسیون مرحله ای و تجزیه علیت می توان نتیجه گرفت صفات تعداد غلاف در بوته، وزن 100 دانه، تعداد بذر در غلاف و عملکرد بیولوژیکی از جمله صفات مهم و تاثیرگذار بر عملکرد دانه می باشند. بر اساس تجزیه به عامل ها، 5 عامل دخالت داشتند که در مجموع 89/76 درصد از کل تغییرات را توجیه کردند و عامل های اول، سوم و چهارم به عنوان عامل های مربوط به عملکرد و اجزای عملکرد معرفی شدند. تجزیه خوشه ای به روش Ward و با استفاده از فاصله اقلیدوسی انجام شد که بر این اساس اکوتیپ های مورد بررسی در 6 گروه طبقه بندی شدند. نتایج حاصل از تجزیه واریانس فعالیت آنزیم های CAT، SOD،APX و GPX نشان داد که بین اکوتیپ ها و سطوح تنش اختلاف معنی داری وجود داشته است. فعالیت همه آنزیم ها از سطح 100 درصد ظرفیت زراعی تا سطح تنش 75 درصد ظرفیت زراعی و همچنین از سطح تنش 75 درصد ظرفیت زراعی تا سطح تنش 50 درصد ظرفیت زراعی افزایش داشت که این میزان افزایش برای آنزیم های CAT،APX و GPX معنی دار بود. با توجه به نتایج بخش مولکولی میانگین محتوای اطلاعات چندشکلی (PIC) برای 11 جفت آغازگر مورد استفاده 40/0 بود و آغازگرهای VrSSR61، VrSSR68 و G1242 محتوای اطلاعات چندشکلی بالایی را نشان دادند. ضریب تمایز ژنی بین جمعیت (GST) به طور متوسط برابر 128/0 و مقدار جریان ژنی (Nm) برای تمامی آغازگرها برابر 4/3 محاسبه شد. تجزیه واریانس مولکولی نشان داد ?? درصد از کل تنوع محاسبه شده مربوط به تنوع درون جمعیتی می باشد. نتایج حاصل از شاخص های بین جمعیتی و تجزیه واریانس داده ها حاکی از تشابه بین جمعیت ها و از طرف دیگر تنوع ژنتیکی بالا در داخل هر جمعیت بود. تجزیه به مولفه های اصلی و مختصات اصلی نشان داد که تنوع زیادی در پراکنش افراد جمعیت های مختلف وجود دارد و اکوتیپ های مورد بررسی به طور کامل تحت تاثیر تنوع جغرافیایی نبوده و ممکن است بین این مناطق جا به جا شده باشند. در شناسایی نشانگرهای آگاهی بخش بیشترین تعداد نشانگر برای صفت عملکرد بیولوژیکی با 6 نشانگر و کمترین تعداد برای صفت های تعداد روز تا 90 درصد رسیدگی و تعداد گره در بوته با 1 نشانگر شناسایی شد. نشانگرهای G3424، G401، VrSSR62و VrSSR50 در بیشتر صفات مورد بررسی وارد مدل رگرسیونی شده و درصد نسبتا بالایی از تغییرات مربوط به صفات را توجیه کردند.
- Abstract
- In order to assessment of genetic and phenotype diversity and relationship among traits of 406 ecotypes of Mung Bean a Augment design in a field of college of agriculture and natural resources, University of Tehran, Karaj, Iran, was used. The result showed that there was a high genetic diversity among the ecotypes. According to the result of simple phenotypic correlations, stepwise regression and path analysis, it can be conclude that the following traits were most important traits to effective on the seed yield: number of pod in a plant, 100 seeds weight, number of seed in a pod and biological yield. Therefore, we can increased the seed yield per plant favorably with select and breed for the traits. Factor analysis (FA) showed that the first five factors confirmed more than 76.89% of total variance. First, second and forth factors were introduced as a related factors on yield and yield components. The cluster analysis was performed using Ward’s minimum variance method and Euclidean distance. From this analysis the ecotypes were categorized into six groups. All the enzymes activity from 100% of field capacity to the stress level of 75% field capacity as well as stress levels of 75% to 50% of field capacity increased that this rate of increase for enzymes CAT, APX and GPX were significant. According to the molecular results the average polymorphism information content (PIC) for 11 primers used was 0/40 and primers VrSSR61, VrSSR68 and G1242 showed high polymorphism information content. The mean coefficient of gene differentiation (Gst) and the amount of gene flow (Nm) was 0/128 and 3/4 Respectively. Analysis of molecular variance revealed that 95% of the total variation calculated by the variation within the population. The results of between population indicators and AMOVA showed similarity between the population and on the other hand high genetic diversity within each population. The Principal component and principal coordinates analysis showed that there is great variation in the distribution of various populations and studied ecotypes completely not influenced by the geographical diversity and may be displaced between these areas. The maximum number of informative markers was for biological yield with 6 markers and the lowest number for the number of days to 90% maturity and number of nodes per plant was identified with 1 marker. Markers G3424, G401, VrSSR62 and VrSSR50 were in most traits regression model and relatively high percentage of variance was explained by these traits.
