عنوان پایان‌نامه
جداسازی و شناسایی قارچ های مرتبط با پوسیدگی طوقه و ریشه ی طالبی در جنوب شرق استان تهران
- رشته تحصیلی
- مهندسی‌کشاورزی-بیماری‌شناسی‌گیاهی
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه پردیس ابوریحان شماره ثبت: 925;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 75953;کتابخانه پردیس ابوریحان شماره ثبت: 925;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 75953
- تاریخ دفاع
- ۲۷ تیر ۱۳۹۵
- دانشجو
- امین شیرعلی
- چکیده
- پوسیدگی طوقه و ریشه یکی از مهم‌ترین و مخرب‌ترین بیماری‌های طالبی می‌باشد. در سال‌های اخیر، این بیماری در مزارع طالبی واقع در جنوب شرق استان تهران، خسارت‌های اقتصادی فراوانی وارد نموده است. به منظور شناسایی عوامل این بیماری، در خرداد ماه سال‌های 1393 و 1394 از مزارع طالبی شهرستان‌های ورامین و پیشوا بازدید به عمل آمد و از بوته‌های دارای علائم کاهش رشد، زردی، پژمردگی و پوسیدگی در ریشه و طوقه نمونهبرداری انجام گرفت. بافت های ریشه و طوقه‌ی گیاهان بیمار پس از شستشو در زیر جریان ملایم آب و ضدعفونی سطحی با محلول هیپوکلریت‌سدیم نیم درصد به مدت یک تا دو دقیقه، در محیط PDA اسیدی کشت گردیدند. پس از خالص‌سازی جدایه‌ها به روش تک اسپور یا نوک ریسه، شناسایی مورفولوژیکی قارچ‌ها با استفاده از منابع معتبر و بر اساس خصوصیات ماکروسکوپی و میکروسکوپی انجام گرفت. در مجموع، 95 جدایه از قسمت‌های ریشه و طوقه‌ی طالبی به دست آمد که از این تعداد، 58 جدایه Fusarium solani، 18 جدایه Macrophomina phaseolina، شش جدایه F. equiseti، چهار جدایه F. oxysporum، سه جدایه F. proliferatum، دو جدایه F. incarnatum، دو جدایه R. solani (AG-4)، یک جدایه F. delphinoides و یک جدایه Geotrichum candidum شناسایی گردیدند. آزمون بیماری‌زایی جدایه‌ها در شرایط گلخانه با دمای 2 ± 25 درجه‌ی سانتی‌گراد، روی گیاهچه‌های طالبی رقم سمسوری (نیاگارا) که رقم رایج در منطقه می‌باشد، انجام شد. همه‌ی جدایه‌ها توانستند سبب بروز علائم بیماری در گیاهچه‌های طالبی شوند، اما بین جدایه‌ها از نظر درصد بیماری‌زایی اختلاف معنی‌دار وجود داشت. برای تأیید شناسایی مورفولوژیکی گونه‌های قارچی، یک یا دو جدایه به عنوان نماینده‌ی هر گونه انتخاب شده و نواحی ITS1-5.8S-ITS2 در دی ان ای ریبوزومی آن‌ها با استفاده از آغازگرهای جهانی ITS1 و ITS4 تکثیر و توالی‌یابی گردید. توالی به دست آمده برای هر جدایه‌ی منتخب با توالی جدایه‌های گونه‌ی مربوطه موجود در بانک ژن (GenBank) مقایسه و با آن‌ها به میزان 99% همسانی نشان داد. سپس آنالیز فیلوژنتیکی جدایه‌ها با استفاده از نرم‌افزارهای Chromas 2.5.1، BioEdit 7.2.5 و Mega 5.05 انجام و درخت‌های مربوطه به روش حداکثر پارسیمونی (صرفه‌جویی) ترسیم شدند. به طور کلی نتایج تجزیه با استفاده از این روش منجر به تفکیک جدایه‌های مورد بررسی و مؤید ماهیت گونه‌ی آن‌ها بود. گونه‌های F. solani، F. equiseti، F. proliferatum، F. incarnatum، F. delphinoides، R. solani (AG-4) و G. candidum برای اولین بار از مزارع طالبی واقع در منطقه‌ی جنوب شرق استان تهران گزارش می‌گردند. با توجه به نتایج به دست آمده گونه‌ی F. solani از تمامی نقاط نمونهبرداری شده جداسازی گردید و همچنین فراوانی این گونه بیش از سایرین بود. بنابراین به نظر می‌رسد که این گونه نقش مهمی در کاهش عملکرد محصول طالبی در منطقه‌ی جنوب شرق استان تهران داشته باشد.
- Abstract
- Crown and root rot is one of the most destructive diseases of cantaloupe. The disease has been observed in cantaloupe growing farms in the south east of Tehran province, causing heavy damages each year. To study disease etiology, cantaloupe farms of Varamin and Pishva counties were surveyed during June 2014 and 2015 and samples were obtained from plants showing reduced growth, yellowing and wilting of foliage, accompanied by root, crown or stem rot. Samples were washed with tap water, and the infected root and crown tissues were surface sterilized with 0.5% sodium hypochlorite for 1 to 2 min and cultured onto acidified PDA. Morphological identification of single spore or hyphal tip isolates was performed based on macroscopic and microscopic characters, using authentic keys. Of a total of 95 isolates obtained, 58 were identified as Fusarium solani, 18 as Macrophomina phaseolina, 6 as F. equiseti, 4 as F. oxysporum, 3 as F. proliferatum, 2 as F. incarnatum, 2 as Rhizoctonia solani (AG-4), 1 as F. delphinoides and 1 as Geotrichum candidum. Pathogenicity tests were conducted under greenhouse conditions at 25±2°C on cantaloupe seedlings, cultivar Samsouri (Niagara), which is commonly grown in the region. All isolates induced disease symptoms in cantaloupe seedlings; however, significant differences in disease incidence rates were observed. To further confirm species identification, one or two representative isolates were selected for each species, and the internal transcribed spacer regions (ITS1-5.8S-ITS2) of the ribosomal DNA were amplified using universal primers ITS1 and ITS4. The resulting sequences showed 99% identity with those of corresponding species submitted to GenBank. Phylogenetic analyses were performed using the Mega 5.05 program software and the phylogenetic trees were constructed using the maximum parsimony method. The results successfully confirmed morphological identification of the species. To the best of our knowledge, this is the first report of F. solani, F. equiseti, F. proliferatum, F. incarnatum, F. delphinoides, R. solani (AG-4) and G. candidum as causal agents for crown and root rot of cantaloupe in south east of Tehran province. F. solani was obtained from all sampling areas with the highest frequency as compared to other species obtained. This species seems to have an important role in reducing cantaloupe production yield in south east of Tehran province. Key words: cantaloupe, crown and root rot fungi, rDNA ITS regions, Tehran province.
