عنوان پایان‌نامه
” شناسایی قارچ‌های عامل کپکهای سیاه (دوده‌ای) خوشه‌های گندم و جو دراستان‌های گلستان، البرز و قزوین”
- رشته تحصیلی
- مهندسی کشاورزی - بیماری شناسی گیاهی
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 7158;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 77771;کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 7158;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 77771
- تاریخ دفاع
- ۲۸ شهریور ۱۳۹۵
- دانشجو
- علیرضا پورصفر
- استاد راهنما
- محمد جوان نیکخواه
- چکیده
- غلات شامل گروهی از گیاهان متعلق به تیره Poaceae می‌باشند که سطح زیر کشت قابل توجهی را در دنیا به خود اختصاص می‌دهند. دانه این گروه از گیاهان به عنوان محصول اصلی برای تغذیه اکثر مردم جهان، تغذیه حیوانات و پرندگان و همچنین در صنعت مورد استفاده قرار می‌گیرد. در بین غلات، گندم و جو از اهمیت ویژه‌ای برخوردار هستند و به دلیل اهمیت آن‌ها، بیشترین منابع و امکانات کشاورزی دنیا برای افزایش تولید و بهبود کیفیت محصولات تولید شده توسط آن‌ها مورد استفاده قرار می‌گیرد. تعدادی از عوامل بیماریزا با کشت، تولید و کیفیت فراورده‌های این گیاهان مداخله می‌کنند. از مهم‌ترین بیماریهای گندم و جو می‌توان به بیماریهای ریشه و طوقه، مرگ گیاهچه، سفیدک‌های پودری و کرکی، لکه برگی‌ها، انواع زنگ‌ها، سیاهک‌ها و بیماریهای خوشه اشاره کرد که هریک در مراحلی از رشد و نمو گندم و جو باعث ایجاد خسارت می‌شوند. واژه‌ی کپک دوده‌ای عموما برای عوامل قارچی اطلاق می‌شود که دارای میسلیوم‌های تیره رنگ بوده و بصورت ساپروفیت و یا انگل ضعیف گیاهان را مورد حمله قرار می‌دهند. به منظور شناسایی قارچ‌های همراه با علائم کپکهای دوده‌ای خوشه‌ی گندم و جو، نمونه برداری‌های متعددی طی سال‌های 1393 و 1394 از مزارع گندم و جو با نشانه‌های متداول بیماری در استان‌های گلستان، البرز و قزوین صورت گرفت. جداسازی قارچ‌ها با استفاده از روش کاغذ صافی مرطوب به دو صورت کشت بدون ضدعفونی سطحی و کشت با ضدعفونی سطحی انجام گرفت. در مجموع 565 جدایه از جنس‌های Alternaria، Bipolaris، Cladosporium، Curvularia، Epicoccum، Harzia و Stemphylium بدست آمد. شناسایی گونه‌ها به روش‌های ریخت‌شناختی و مولکولی با استفاده از ترادف‌های نواحی ناحیه ITS-rDNA هستهای، بخشی از ژن گلیسرآلدهید-3-فسفات دهیدروژناز و ژن کد کننده پروتئین پمپ پروتونی غشا پلاسمایی انجام گرفت. تجزیه و تحلیل‌های تبار‌شناختی با استفاده از روش‌های Neighbor Joining، و Maximum Parsimony انجام گرفت. در مجموع، تعداد 38 گونه قارچی شناسایی شد. در بین گونه‌های شناسایی شده، تعداد 28 گونه شامل Alternaria alternata، A. arborescens، A. arbustii، A. atra، A. cantlous، A. chlamydospora، A. consortialis، A. cucurbitae، A. destruens، A. ethzedia، A. incomplexa، A. malorum، A. tenuissima، A. triticimaculans، A. turkisafria، Bipolaris cookei، B. cynodontis، B. sorokiniana، Cladosporium cladosporioides، C. macrocarpum، Curvularia lunata، C. spicifera، Epicoccum nigrum، Harzia acremonioides، Stemphylium alfalfae، S. eturmiuna، S. lycii و S. vesicarium. قبلا در منابع قارچ‌شناسی ذکر و توصیف شده‌اند، که تعداد هفت گونه از آن‌ها شامل Alternaria cucurbitae، A. ethzedia، A. incomplexa، A. triticimaculans، Harzia acremonioides، Stemphylium eturmiuna و S. lycii گونه‌های جدیدی برای بیوتای قارچی ایران می‌باشند. علاوه بر این، ویژگی‌های ریخت‌شناختی و داده‌های ترادف بدست آمده از سه ژن در تعدادی از جدایه‌های متعلق به جنس Alternaria با توصیفات هیچ کدام از گونه‌های قارچی توصیف شده مطابقت نداشتند و لذا به عنوان گونه‌های جدید برای بیوتای قارچی دنیا مشخص و توصیف می‌شوند. از این 10 گونه، تعداد 9 گونه از آن‌ها در بخش Infectoriae و یک گونه در بخش Pseudoalternaria از جنس Alternaria، قرار می‌گیرند. در این مطالعه، بیشترین تنوع گونه‌ای در جنس Alternaria و با تعداد 25 گونه مشخص گردید.
- Abstract
- Cereals are a group of herbaceous plants that are widely cultivated for food production around the world. Their main crop, seeds, are consumed either by human or other animals as feedstuff. Also, their crops may have industrial importance as a part of beverages industry. Among the cereals, wheat and barley are the most important field crops that many of agricultural resources were employed to their cultivation. These crops are affected by many biotic and abiotic factors that may result in reduced crop yields. Among these affecting factors, biotic agents such as plant pathogenic fungi especially those affect the heads and seeds, are directly related to crop production. The term ‘sooty mold’ has been used in a general sense for many saprophytic or weakly parasitic fungi, usually with dark coloured hyphae, which produce black colonies superficially on plant tissues. In order to study the black (sooty) head mold fungi of wheat and barley, samples were collected from different regions of Golestan, Alborz and Qazvin provinces during the spring and summer of 2014 and 2015. Isolation of the fungi was done using blotter method with and without surface sterilization. Many isolates from the different genera including Alternaria, Bipolaris, Cladosporium, Curvularia, Epicoccum, Harzia and Stemphylium were obtained. Species identification was done Based on morphological characteristics and data obtained from three loci, ribosomal ITS-rDNA, gelyceraldehyde-3- phosphate dehydrogenase and plasma membrane ATPase. Phylogenetic analyzes were done by using Neighbor Joining (NJ) and Maximum Parsimony (MP) methods. Totally, 31 species Viz, Alternaria alternate, A. arborescens, A. arbustii, A. atra, A. cantlous, A. chlamydospora, A. consortialis, A. cucurbitae, A. destruens, A. ethzedia, A. incomplexa, A. malorum, A. tenuissima, A. triticimaculans, A. turkisafria, Bipolaris cookei, B. cynodontis, B. sorokiniana, Cladosporium cladosporioides, C. macrocarpum, Curvularia lunata, C. specifera, Epicoccum nigrum, Harzia acremonioides, Stemphylium alfalfae, S. eturmiuna, S. lycii and S. vesicarium were identified. Among the identified species ten species Viz. A. cucurbitae, A. ethzedia, A. incomplexa, A. triticimaculans, Harzia acremonioides, S. eturmiuna and S. lycii are the new records for mycobiota of Iran. Also based on morphological comparisons and multigene phylogenetic analyzes, ten isolates including, ALT-2, BG1-4, BT2-6, FA3-2, JS4-21, B6-25, B6-29, FA7-1, H7-2 and KQ20 are the candidate of new species from sections Infectoriae and Pseudoalternaria (genus Alternaria), respectively. Keywords: Disease, Morphology, Phylogeny, Distribution, Multigene
