عنوان پایان‌نامه
مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیت های شاهدانه جمع آوری شده از نقاط مختلف جهان با استفاده از نشانگرهای مولکولی
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 7144;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 77773;کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 7144;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 77773
- تاریخ دفاع
- ۲۹ شهریور ۱۳۹۵
- دانشجو
- سمانه برازنده
- استاد راهنما
- سیدعلیرضا سلامی
- چکیده
- اولین گام در هر برنامه به نژادی و اصلاح گیاهان به منظور شناسایی و معرفی ژنوتیپ های برتر، تعیین سطح تنوع ژنتیکی است. نشانگرهای SSR به دلیل چندشکلی بالا و وراثت هم بارز، نشانگرهای ایده آلی برای رسیدن به این هدف می باشند. شاهدانه(Cannabis sativa L.) یکی از مهم ترین گیاهان دارویی است که کاربرد های فراوانی در داروسازی و صنایع روغن و فیبر دارد. در این تحقیق، 39 جمعیت از این گیاه از نقاط مختلف جهان جمع آوری و توسط شش نشانگر SSR ارزیابی شدند. در کل 26 جایگاه چندشکل مشاهده شد که بیشترین تعداد آن مربوط به نشانگر D02-CANN2 با شش جایگاه و کمترین مربوط به نشانگر B02-CANN2 با سه جایگاه بود. همچنین بیشترین و کمترین مقدار در بررسی شاخص های مبتنی بر فراوانی جایگاه ها از جمله میزان هتروزیگوتی مشاهده شده و مورد انتظار و شاخص شانون برای این دو نشانگر ثبت شد. بالا بودن تمام این شاخص ها نشان می دهد که نشانگر D02-CANN2 بیشترین میزان تنوع را در بین جمعیت ها دارد. اطلاعات حاصل از تجزیه خوشه ای این جمعیت ها را در چهار گروه قرار داد، هم چنین تجزیه به مولفه های هماهنگ اصلی (PCoA) نشان داد که دو عامل به ترتیب 23/59 و 22/99 درصد و در مجموع 46/58 درصد از تغییرات را در بین جمعیت ها توجیه کرد. طبق نتایج حاصل از بررسی مقادیر فاصله ژنتیکی بین جمعیت های شاهدانه به روش نی بیشترین فاصله (0/756) بین جمعیت های شماره 901072 و 45 CAN و کمترین فاصله (0/233) مربوط به جمعیت¬های 880828 و 883172 و همچنین بین جمعیت های 880825 و 55 CAN می باشد. به طور کلی می توان گفت نشانگرSSR می تواند چندشکلی بالایی در بین جمعیت های شاهدانه نمایان سازد. نتایج تحقیق حاضر می تواند در مدیریت ژرم پلاسم شاهدانه مؤثر واقع شود.
- Abstract
- Appointment of genetic variety in order to identity and introduce superior genotype is first step in a plan of plant breeding. Cannabis sativa is one of important cultivated medicinal plants, that is being used for its fiber, medicinal and nutritional properties.This study was conducted genetic evaluation of 39 Cannabis from different region of world by six SSR primer. According the result 56 multishape place absorved that the most number was related to primer of D02-CANN2 with six places and the least number was for primer of B02-CANN2 with three places. In addition, in evaluation of abundance based indices places including absorved (Ho) and expected (He) heterozygosity and shannon index registered for these two primer. Transcend of these indices, demonstrates the most variation in population is related to primer. Cluster Analyze results showed that the populations were separated in four groups. Principal Coordinates Analysis (PCoA) showed that two first agent justifyed respectively 23/59 and 22/99 and overall 46/58 percent of changes in these populations. According results of genetic distance evaluation between populations of Cannabis with Nei method, most distance is between CAN45 and 901079 and least of distance are between 880828 and 883172 and also CAN55 and 880825. Generally SSRs marker can shows high multishape between Cannabis papulations and Resuts of this investigation can use in management of Cannabis germplasm. Keywords: Genetic variety, SSRs markers, Cannabis sativa
