عنوان پایان‌نامه
شناسایی بیوانفورماتیکی جایگاه اتصال عوامل رونویسی در برخی ژنهای کاندیدا در دامهای اهلی
- رشته تحصیلی
- مهندسی کشاورزی - علوم دامی - اصلاح نژاد دام
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 6165;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 66051
- تاریخ دفاع
- ۲۶ آبان ۱۳۹۳
- دانشجو
- آیدا نیک بخش
- استاد راهنما
- حسین مرادی شهربابک, اردشیر نجاتی جوارمی
- چکیده
- هدف از مطالعه حاضر بررسی بیان ژن¬های مرتبط با مرحله جایگزینی و قبل از جایگزینی رویان در بافت اندومتریوم گاو و همچنین شناسایی ژن¬ها و فاکتورهای رونویسی کاندیدا و درگیر در مراحل ذکر شده با استفاده از تکنیک¬های بیوانفورماتیکی بود. برای شناسایی ژن¬هایی که به طور اختصاصی در بافت اندومتریوم بیان می¬شوند، از مرور منابع و مطالعات قبلی در این زمینه در چهار گونه پستاندار شامل انسان، موش، خوک، گاو استفاده شد. سپس بیان ژن¬های شناسایی شده در بافت اندومتریوم گونه گاو بررسی شد و شبکه تنظیمی رونویسی این ژن¬ها در بافت اندومتریوم توسط آنالیز پروموتور بررسی گردید. طبق بررسی¬های انجام شده در نهایت 13 ژن با بیان بالا و عملکرد شناخته شده در دو مرحله از آبستنی (جایگزینی رویان و قبل از آن) به عنوان ژن¬های کاندیدا در مراحل مربوط به فرآیند پاسخ ایمنی به منظور آنالیز پروموتور انتخاب شدند. با این فرضیه که تغییرات در سطوح رونویسی ژن¬های هم بیان و با عملکرد مشابه ممکن است در هماهنگی فعالیت تعداد محدودی از فاکتورهای رونویسی اثر گذار باشد، جایگاه¬های اتصال فاکتورهای رونویسی روی پروموتورهای این ژن¬ها برای درک بهتر شبکه تنظیمی ژن¬های مورد نظر در سقط رویان مورد توجه قرار گرفتند. بررسی شبکه تنظیمی درگیر در مراحل مد نظر منجر به شناسایی چندین فاکتور رونویسی (TFs) شامل TFهایی که قبلا به عنوان فاکتورهای درگیر در این مراحل شناخته نشده بودند، گردید. نتایج نشان می¬دهد که فاکتورهای جدید شناخته شده احتمالا دارای نقش تنظیمی در مراحل ذکر شده در اوایل آبستنی می-باشند. همچنین شناسایی این فاکتورها بر روی نواحی پروموتوری ژن¬های هم بیان و هم عملکرد و در کنار فاکتورهای تایید شده در این مبحث، احتمال عملکردی بودن آنها را تقویت می¬کند.
- Abstract
- ندارد
