عنوان پایان‌نامه
بررسی مکانیسم اثرترکیب مشتق شده از سالن ها (EUK-۱۷۲) برروی تجمعات آمیلوئیدی لیزوزیم
- رشته تحصیلی
- بیوشیمی
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 67317;کتابخانه مرکز تحقیقات بیوشیمی و بیوفیزیک شماره ثبت: 11374ب
- تاریخ دفاع
- ۰۲ مهر ۱۳۹۳
- دانشجو
- اطهر شریفی
- استاد راهنما
- بی بی راضیه یزدان پرست
- چکیده
- امروزه مطالعه بر روی چگونگی تشکیل تجمعات غیر طبیعی پروتئین ها در مباحث مختلف مربوط به علوم پزشکی و بیوتکنولوژی بسیار اهمیت یافته است. این تجمعات موسوم به تجمعات آمیلوئیدی با واسطه تشکیل ساختارهای منظم از صفحات بتا در فیبریل هایی با قطری بین 10 تا 20 نانومتر می باشند. بیماری های رو به گسترش و مهمی مانند آلزایمر، پارکینسون و دیابت نوع دو را می توان از جمله شایع ترین بیماری های آمیلوئیدوزیز مرتبط با تجمعات آمیلوئیدی و پیش ساز های آنها به حساب آورد. تجمعات آمیلوئیدی در این قبیل بیماری ها به واسطه عدم وجود فعالیت بیولوژیکی طبیعی پروتئین و یا ایجاد سمیت ، سلامت فرد را به خطر می اندازد. مطالعه بر روی تجمعات آمیلوئیدی می تواند یافته ها را بر روی طریقه تجمع و راه های تخریب آنها گسترش دهد. با توجه به یافته ها و مکانیزم های تشکیل فیبریل ها می توان مهار کننده هایی را در مراحل مختلف فرایند فیبریلاسیون طراحی نمود. از جمله این مهارکننده ها ، ترکیباتی که دارای بخش های هیدروفوب و حلقه های آروماتیک هستند ، بواسطه اندرکنش های هیدروفوب به عنوان عامل موثر در تشکیل تجمعات پروتئینی، مورد توجه قرار گرفته اند. همچنین برای مهار تولید فیبریلها، استفاده از ترکیبات آنتی‌اکسیدانی به عنوان یک راهکار درمانی می تواند مطرح باشد. در این تحقیق از یک ترکیب مشتق شده از خانواده کمپلکس سالن استفاده شده است. بر این اساس ، مطالعه حاضر با هدف بررسی خاصیت ضد آمیلوئیدی بودن این ترکیب انجام گرفت.بدین منظور ، پروتئین لیزوزیم سفیده تخم مرغ به عنوان یک پروتئین مدل مناسب انتخاب گردید.در این مطالعه، خصوصیت ساختاری فیبریل لیزویم بوسیله تکنیک های متفاوتی مانند نشر فلورسانس ThT ، ANS و شدت جذب قرمز کنگو، طیف دورنگ نمایی دورانی مورد بررسی قرار گرفت. نتایج حاصله نشان داد که EUK-172 به صورت وابسته به دوز، باعث مهار تشکیل فیبریل و همچنین بازشدن ساختار فیبریل ازپیش تشکیل شده می گردد. همچنین این ترکیب ، سمیت گونه فیبریلی را به واسطه خاصیت آنتی اکسیدانی مهار می کند. نتایج مربوط به مطالعه داکینگ نیز نشان داد که ترکیب مورد استفاده با ناحیه هیدروفوب پروتئین لیزوزیم از طریق اینتراکشن های وان در والس برهمکنش می نماید.
- Abstract
- Studies on protein misfolding and their unnatural assemblies are important related to various areas of science, including biotechnology and medicine. Amyloids, are protein aggregates consisting of very ordered beta sheet structures, between 10 to 20 nm in length. They represent a larg group of diseases involving protein fibril formation in the body, including Alzheimer’s,parkinson’s and type ? diabetes. Protein aggregates in such diseases may be hazardous to human health through loss of natural biological activity of protein or their toxicity. Study on amyloid aggregates can be found on how to assemble and develop interventions to desrupt them. Regarding several findings on mechanisms of inhibition of fibrils formation, we aimed to study and design agents with the ability to inhibit various stages in the fibrillation process. Among these inhibitors, the compounds with the hydrophobic and aromatic rings have been considered in the presnt study, due to hydrophobic interactions as a main factor in the formation of protein aggregates. Moreover, using antioxidants as a therapeutic strategy have been investigated in th current experiment. In this study, we have used one of the salen-derivative complex. The anti–amyloidogenic property of this compound on hen egg white lysozyme (HEWL) has been investigated. To induce fibrillation, HEWL was used as an in vitro model system. In this study, the structural properties of hen egg white lysozyme fibrils assessed by several techniques such as Thioflavin T (ThT), Anilinonaphthalene-8-sulfonic acid (ANS) fluorescence,Congo red (CR) absorbance and Far-UV circular dichroism (CD). Our results showed that, inhibeted the HEWL aggregate in a dose dependent manner and disrupted the pre-formed fibril. Moreover, EUK-172 may inhibit toxicity of fibril due to its antioxidant properties. The results of Docking also demonstrated that the aromatic rings of EUK-172 interact with the hydrophobic region of lysozyme via Van der Waals interactions.
