اثر نانو ذره Tio۲ بر بیان برخی ژن های دخیل در تحمل سرما در نخود
- رشته تحصیلی
- مهندسی کشاورزی -بیوتکنولوژی کشاورزی
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 6064;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 64885
- تاریخ دفاع
- ۲۳ شهریور ۱۳۹۳
- دانشجو
- سعید امینی
- استاد راهنما
- رضا معالی امیری
- چکیده
- نخود زراعیCicer arietinum L. دومین لگوم از نظر سطح زیر کشت در جهان است.تنش سرما یکی از عوامل اصلیخسارتدر این گیاه است.سازگاریبه تنش سرماهمراه باتیمار نانوذرات TiO2فرایندی است که، تحمل سرما را در گیاهان بهبود میبخشد.در این آزمایش بیان ژنهای موثر در تحمل سرما تحت تیمار نانوذره TiO2در دو ژنوتیپ متحمل (SEL 1143)و حساس (ILC533 ) یک روز و شش روز پس از آغاز تنش سرمای چهاردرجه سانتیگراد از طریق تکنیکcDNA-AFLP مورد بررسی قرار گرفت. در مجموع 2000TDF ،، با 36 ترکیبآغازگر ایجاد شد. 100TDF، با الگوی بیان متفاوت از ژلجداسازیشده ومجدداتوسطPCR تکثیر شد. توالییابی10 قطعه کلون و جستجویBLAST در NCBIنشان داد که 8 رونوشت به توالی های شناخته شده با عملکردهای وابسته به متابولیسم،اپی ژنتیک، آنتی اکسیدان، مسیر انتقال پیام، بازسازی غشا، حفظ ساختار پروتئین و فاکتورهای رونویسی تعلق داشت. آخرین گروه رونوشتهای بیان شده ژنهای با عملکرد ناشناخته بودند. پاسخهای متمایز زودهنگام و دیرهنگام ژنوتیپها تحت تیمار TiO2بیانگر استراتژی چندگانه دفاعی سلول نخود به تنش سرما است. همچنین cDNA-AFLPیکی از تکنیکهای قدرتمند در جستجو الگوی بیان ژنهایتحمل سرما تحت اثر نانوذره TiO2بوده به طوری که می تواند در کشف تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های نخود در پاسخ به تنش سرما کمک کند. خصوصیات مولکولی قطعات شناسایی شده به درک بهتر سازوکارهای بیوشیمیایی بین نخود، تنش سرما و تیمار نانوذره کمک کرده و در آینده به اصلاح ژنوتیپ های نخود کمک زیادی خواهد کرد.
- Abstract
- Chickpea (Cicer arietinum L) ranks 2nd among the world. Low temperature stress is one of the most significant causes of crop damage worldwide. Cold acclimatization With TiO2 NPs treatment processes improve the freezing tolerance of plants. In this experiment, the expression of genes involved in cold tolerance in TiO2 nanoparticle-treated tolerant (SEL1143) and sensitive (ILC533) a day and six days after the beginning of cold stress C were studied by cDNA-AFLP technique.In total, we generated 2000 transcript-derived fragments (TDFs) using cDNA-AFLP in conjunction with 36 primer combinations. Of these, 100 TDFs with differential expression patterns were excised from gels and re-amplified by PCR. Ten fragments were then cloned and sequenced. BLAST search of the GenBank non-redundant (nr) sequence database demonstrated that eight TDFs belonged to known sequences with putative functions related to metabolism, epigenetic, antioxidant, signal transduction pathways, reconstruction of membrane, protection of protein structure and transcription factors. The last group of genes with unknown function were expressed transcripts. Distinctive responses of early and late genotypes treated TiO2 suggests multiple cellular defense strategy peas to cold stress.also cDNA-AFLP is a powerful technique for investigating the expression pattern of chickpea cold tolerant genes under TiO2 NPs. So that we can discover the genetic diversity of chickpea in response to cold stress help.Molecular characterization of the identified components to better understand the biochemical mechanisms of peas, cold stress and helped nanoparticle treatment and correction of chickpea in the future will be a lot of help.