عنوان پایان‌نامه
ارزیابی چند شکلیهای موجود در جایگاههای ژنی DGAT۱ در نژادهای گاومیش ایران
- دانشجو
- دنیز حیدریان
- استاد راهنما
- سیدرضا میرائی آشتیانی, مصطفی صادقی
- رشته تحصیلی
- علوم دامی -ژنتیک و اصلاح نژاد
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 6005;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 64353
- تاریخ دفاع
- ۲۳ شهریور ۱۳۹۳
- چکیده
- دی‌آسیل‌گلیسرول آسیل ترانسفراز 1 آنزیمی میکروزومی است که کاتالیز کننده‌ی مرحله نهایی سنتز تری‌گلیسیرید است. هدف از این مطالعه شناسایی پلی‌مورفیسم‌های موجود در موقعیت اگزون‌های 7-9 ژن DGAT1ژن کدکننده‌ی آنزیم مذکور، به روش PCR-SSCP در گاومیش‌های آبی ایرانی (Bubalus bubalis) است. مطالعات اخیر نشان داده است که ارتباط موثری بین اسیدآمینه لایزین در موقعیت 232 توالی اسیدآمینه‌ای آنزیم فوق با مقدار چربی شیر بیشتر وجود دارد درحالی‌که اسیدآمینه آلانین در موقعیت مذکور به عنوان نشانگری در ارتباط با مقدار چربی شیر کمتر و مقدار شیر بالاتر است. در این مطالعه نمونه¬های DNAگاومیش‌ها از 5 استان ایران مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند سه الگوی PCR-SSCP یافت شد. تجزیه و تحلیل حاصل از توالی‌یابی DNA نشان دهنده‌ی نوکلئوتید A-A در موقعیت نوکلئوتیدی 6962-6963 (آلل K) کدکننده‌ی لایزین است که مشابه A-A در موقعیت نوکلئوتیدی 10433-10434 در گاو نژاد Bos indicus است. بنابراین اگزون 8 ناحیه‌ای حفاظت شده در نژاد Bos indicus و تمامی نژادهای گاومیش بوده که با چربی بیشتر شیر در ارتباط است. علاوه بر این یک جهش جایگزینی هم‌جنس در موقعیت 7036 C/T شناسایی شد و در این ناحیه علاوه بر افراد هموزیگوت افراد هتروزیگوت CT نیز یافت شدند. این جهش در ناحیه اینترون 8 ژن DGAT1گاومیش‌های ایرانی واقع شده است و یک جهش خاموش (غیرمترادف) است.
- Abstract
- Diacylglycerol acyltransferase 1 is a microsomal enzyme that catalyzes the final step of triglyceride synthesis. The objective of this project was to check out the polymorphisms at the exons 7-9 region of DGAT1 gene using PCR-SSCP technique in Iranian buffaloes (Bubalus bubalis). Recent activities have shown that there is a significant association between lysine at amino acid position 232 with higher milk fat content, whereas an alanine at this position is an indicator for lower milk fat content and higher milk yield. In this study we analyzed buffaloes data from 5 provinces of Iran. Three PCR-SSCP patterns were found. DNA sequencing analysis showed that all of the patterns had the motif “AA” at position 6962-6963 (K allele) encoding lysine, which is similar to “AA” at position 10433-10434 in Bos indicus and also different buffalo breeds at position 6962-6963. Therefore exon 8 is a conservative region in Bos indicus and all buffalo breeds, associated with higher milk fat content. Moreover, we found a base transition at position 7036 C/T and had heterozygosity of both “C and T”, which is located at intron 8 of DGAT1 gene. Thus, this transition is a nonsense mutation which causes no change in amino acid sequence. This mutation has occurred at the intron 8 of DGAT1 in Iranian buffaloes.
