عنوان پایان‌نامه
بررسی چند شکلی موجود در اگزون ۱ ژن ACACA و ارتباط آن با برخی صفات مرفولوژی در شترهای مناطق بندرعباس، یزد و خوزستان
- دانشجو
- مهدی ایمانی
- استاد راهنما
- محمد مرادی شهربابک, حسین مرادی شهربابک
- رشته تحصیلی
- علوم دامی -ژنتیک و اصلاح نژاد
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 6432;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 69520
- تاریخ دفاع
- ۳۱ شهریور ۱۳۹۳
- چکیده
- استیل کوآ کربوکسیلاز آلفا، یک آنزیم کلیدی در تنظیم سنتز اسیدهای چرب در بافت¬های حیوانی می¬باشد که به طور غالبی در بافت کبد و چربی بیان می¬شود. هدف از این مطالعه، بررسی چندشکلی اگزون 1 ژن ACACA در سه نژاد شتر هرمزگانی، یزدی و خوزستانی و ارتباط آن با صفات فنوتیپی بود. بدین منظور نمونه گیری خون و دادهای فنوتیپی از 280 شتر متعلق به استان¬های ذکر شده شامل 120 نفر بندری (شهرهای سیریک، میناب و جاسک)، 80 نفر خوزستانی (شهرهای شوش و هویزه) و 80 نفر یزدی (شهرهای بافق و طبس) انجام شد. در این مطالعه از 23 صفت شامل غلظت¬های کلسترول، HDL، LDL، سدیم خون، سدیم پلاسما، منیزیم، کراتین، پتاسیم خون، پتاسیم پلاسما، کلسیم و اوره بعنوان پارامترهای بیوشیمیایی خون، و وزن، طول و ارتفاع بدن، دور سینه و شکم، طول و دور گردن، طول و دور صورت و همچنین بیومتری ابعاد کوهان به عنوان صفات فنوتیپی استفاده گردید. همچنین جهت مطالعه ساختار جمعیتی شترهای کشور، داده¬های بیومتری طول بدن، ارتفاع جدوگاه، ارتفاع کپل، دور سینه و شکم 1650 نفر شتر از 13 استان گردآوری شد. استخراج DNA ژنومی به روش بهینه یافته نمکی انجام و پس از تکثیر قطعه 390 جفت بازی که اگزون اول ژن ACACA را دربر می¬گرفت، تعیین ژنوتیپ محصولات PCR با روش SSCP و سپس توالی یابی انجام شد. نتایج انالیز SSCP و توالی یابی بترتیب پنج الگو و چهار SNP شاملC49T ،C122G ،A144G ،C213A را نشان داد. همچنین نتایج بخش تجزیه کلاستر نشان داد که، 13جمعیت مورد بررسی در 11 کلاس دسته بندی شدند و همچنین نژاد بندری و یزدی در یک کلاس قرار گرفتند.
- Abstract
- Acetyl-CoA carboxylase-a (ACACA) is the main regulatory enzyme of fatty acid biosynthesis in animal which predominantly expressed in the liver and adipose tissue. The aims of this study were to assessment polymorphism at ACACA gene in three camel breeds of Hormozgan, Khuzestan and Yazd province and its association with phenotypic traits. For this purpose, blood sampling and phenotypic data from 280 camels belonging to above mentioned provinces including 120 (Cyric, Minab and Jasb cites), 80 (Shosh and Hoveyzeh cites) and 80 (Bafgh and Tabas cites) individuals respectively were collected. In this study, 23 traits including the concentrations of cholesterol, HDL, LDL, Na and K of blood and plasma, Mg, Ca, Urea and keratin as biochemical parameters of blood, and also weight, length and height of body; the circuit of breast and abdomen; length and circuit of neck and face as well as the biometric of dimension hump as biometric traits were used. Moreover, to study of population structure of Iranian camels, biometric data of length of the body; height of the Wither, height of the rump, girth of breast and abdomen from 1650 individual camels of 13 provinces were gathered. DNA extraction of Genomic DNA by the optimized salting-out method was performed and after propagation of 390 bp fragment that comprises exon 1 of ACACA gene, the genotyping of PCR products were conducted via SSCP mode and subsequently by Sequencing. The results of SSCP analysis and sequencing respectively revealed five patterns and four mutations including C49T; C122G; A144G and C213A. Likewise, the results of cluster analysis indicated that the 13 studied populations were categorized in 11 classes and furthermore Bandary and Yazdi breeds were categorized in same group.
