عنوان پایان‌نامه
شناسایی جدایه های مختلف قارچ Penicillium عامل کپک آبی سیب با استفاده از نشانگر های مولکولی
- رشته تحصیلی
- مهندسی‌کشاورزی-بیماری‌شناسی‌گیاهی
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 42026;کتابخانه پردیس ابوریحان شماره ثبت: 266
- تاریخ دفاع
- ۲۶ اسفند ۱۳۸۷
- دانشجو
- شیرین عربی
- استاد راهنما
- رضا امیری
- چکیده
- چکیده کپک آبی سیب که توسط Penicillium spp. ایجاد می شود مهم ترین بیماری پس از برداشت سیب در دنیا می باشد. در این تحقیق ابتدا تعداد 30 جدایه پنی سیلیوم از سطح میوه سیب جداسازی و خالص سازی شد. ارزیابی میزان بیماریزایی جدایه ها با اندازه گیری قطر لکه ایجاد شده روی میوه سیب پس از تلقیح زخم صورت گرفت. سپس جدایه ها از لحاظ مورفولوژیک با استفاده از کلید شناسایی پیت و هوکینگ شناسایی شدند. شناسایی مولکولی جدایه ها نیز با استفاده از روش PCR-RFLP مبتنی بر ناحیه ITS (ITS1 و ITS2 و ژن 5.8SRNA) با استفاده از دو آنزیم ? Hinf و ?Taq صورت گرفت. هم چنین تعیین توالی ناحیه ITS برای برخی جدایه ها انجام پذیرفت و سپس این توالی ها توسط نرم افزار Blast در بانک ژن با توالی های موجود در بانک ژن مقایسه شدند. شناسایی اختصاصی شبه گونه P.expansum نیز با استفاده از PCR اختصاصی این شبه گونه صورت پذیرفت. در این PCR از یک جفت پرایمربه نام هایPER و PEF که بر اساس ژن پلی گالاکتروناز P.expansum طراحی شده اند، استفاده شد و یک باند bp404 در شش جدایه P.expansum مشاهده شد که در جدایه های دیگر این باند مشاهده نگردید. در نهایت در 6 جدایه از 30 مورد بررسی P.expansum بوده و 24 جدایه دیگر تحت عنوان شبه گونه P.commune شناسایی شدند. در اینجا شبه گونه P.commune برای اولین بار در ایران به عنوان عامل بیماری زای سیب گزارش می شود. کلمات کلیدی: کپک آبی سیب، شناسایی مولکولی، Penicillium
- Abstract
- Abstract Blue mold on apple caused by Penicillium spp. is the most important postharvest disease of apple worldwide. Thirty isolates of Penicillium spp. were collected from the surfaces of apple fruit. Aggressivenes of native strains was determined by measuring the diameter of lesions induced on apple fruit after wound inoculation. Penicillium isolates were identified with the aid of keys developed by Pitt. Molecular characterization of the isolates was performed with restriction fragment length polymorphism (RFLP) of the internal transcribed spacer (ITS) ITS1 and ITS2 and the 5.8SrRNA gene (ITS1-5.8SrRNA gene-ITS2) rDNA region with two enzymes and rDNA internal transcribed spacer (ITS1-5.8SrRNA gene-ITS2) sequencing was performed for some strains. Comparisons with sequences in the GenBank were performed by using the Blast program. Also detection of Penicillium expansum was performed with specific polemerase chain reaction. In this PCR we used utilizing primers, PER and PEF, based on the polygalactrunase gene of P.expansum. The PCR amplified a 404-bp DNA product from all the six P.expansum isolates tested, but not in the other isolates. In conclusion, 6 isolates were identified as P.expansum and 24 isolates were identified as penicillium commune. This is the first report of P.commune as an apple pathogen in Iran. Keywords: Blue mold, Molecular identification, Penicillium
