عنوان پایان‌نامه
« مطالعه سیستماتیک گونه های Magnaporth در ناحیه جنوبی دریای خزر »
- دانشجو
- عادل پردل
- استاد راهنما
- محمد جوان نیکخواه
- رشته تحصیلی
- مهندسی کشاورزی - بیماری شناسی گیاهی
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 6138;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 65903
- تاریخ دفاع
- ۲۳ شهریور ۱۳۹۳
- چکیده
- تیره Magnaporthaceae دارای چند جنس مهم می¬باشد که جنس Magnaporthe حائز اهمیت می¬باشد. این جنس شامل تعدادی از قارچ¬های بیمارگر گیاهی می¬باشد که باعث بلاست و لکه¬برگی روی اعضای تیره غلات ، تعدادی از گیاهان زینتی، موز و همچنین باعث پوسیدگی ریشه، طوقه و ساقه روی سایر گیاهان می¬گردد. با توجه به وجود شرایط مساعد آب و هوایی برای گونه¬های Magnaporthe در حاشیه جنوبی دریای خزر، احتمال وقوع بیماری-های مختلف توسط گونه¬های این جنس امکان پذیر می¬باشد که این امر باعث کاهش محصول در گیاهان زراعی، کاهش ارزش گیاهان زینتی و اثر مخرب روی فضای سبز و چمن¬کاری¬ها می شود. طی بهار، تابستان و پاییز سال¬های 1391 و 1392 از مزارع برنج، گندم، جو، ذرت، سورگوم و باغات مرکبات، چای و جنگل¬های نواحی جنوبی دریای خزر ( از آستارا تا گنبد کاووس) از روی گیاهان مختلف نمونه¬برداری به عمل آمد. در مجموع 137 جدایه از جنس Magnaporthe از نمونه¬های دارای علائم بلاست و لکه¬برگی جداسازی و با روش تک¬اسپور خالص¬سازی گردید. مطالعه صفات مورفولوژیک جدایهها شامل رنگ پرگنه، شکل، رنگ و ابعاد کنیدیوم¬ها و کنیدیوفور¬ها نشان داد که جدایه¬ها به شش گونه M. oryzae (80 جدایه)، M. grisea (30 جدایه)، M. salvinii (5 جدایه)، Pyricularia higginsii (8 جدایه)، Pyricularia sp. ck1 (10 جدایه) و16d Pyricularia sp. (4 جدایه) تعلق دارند. آزمون بیماریزایی گونه M. oryzae روی بوته¬های برنج، ذرت، سوروف، چسبک انجام گرفت. نتایج بدست آمده نشان داد که گونه M. oryzae روی میزبان¬های جدا شده به جزء برنج به شدت بیماری¬زا می¬باشد. برای ارزیابی روابط فیلوژنتیکی جدایه¬ها، ناحیه ITS از DNA ریبوزومی برای 13 جدایه، ناحیه LSU از DNA ریبوزومی برای 6 جدایه و ناحیه ژنی کالمودولین برای 6 جدایه از بین 137 جدایه تکثیر و تعیین توالی شد. پس از رسم درخت فیلوژنتیکی به روش Neighbor-Joining و Maximum Parsimony چهار کلاد اصلی در کلادوگرام حاصل از ناحیه ژنی ITS و سه کلاد در کلادوگرام حاصل از کالمودولین شناسایی شدند. کلاد اول شامل گونه¬های M. oryzae و M. grisea، که به لحاظ مورفولوژی و میزبان نیز متفاوت می-باشند. کلاد دوم شامل Pyricularia higginssi، Pyricularia sp. ck1 و Pyricularia sp. 16d را شامل می¬شود. این چهار گونه به لحاظ مورفولوژیکی نیز با یکدیگر متفاوت¬اند. گونه M. salvinii، کلاد پایه را تشکیل می¬ دهد. این کلاد ارتباط نزدیکی با گونهGeaumanomyces graminis نشان داد و به لحاظ شکل آنامورفی و فیلوژنتیکی از گونه¬های Magnaporthe متفاوت است. ناحیه ژنی LSU گونه¬ها را به خوبی از یکدیگر تفکیک نکرد. در این تحقیق مشخص شد که جدایه¬های Pyricularia sp. ck1 و Pyricularia sp. 16d برای اولین بار در دنیا جداسازی شده و گزارش می شوند، که کارهای تکمیلی برای تعیین گونه آنها در حال انجام است. همچنین مقایسه توالی ناحیه ژنومی ITS و کالمودولین برای تفکیک گونههای مختلف جنسMagnaporthe مناسب است.
- Abstract
- Magnaporthaceae family contains important fungal genera including the genus Magnaporthe which is one the most important genus in this family. Magnaporthe causes blast on rice plant and leaf spot on some other graminaceous species, ornamental plants,banana and stem, root and crown rot on other plant in the world. Southern of Caspian Sea region provide favorable climatic conditions for diseased caused by Magnaporthe species. Magnaporthe species causes lose to crop, ornamental devaluation and destructive effect on lawn. Sampling was conducted from rice, corn, sorghum, barley and wheat cultivation regions, tea, citrus orchards and jungels in southern of Caspian Sea (Astara to Gonbad-e Qabus) during spring, summers and fall of 2012 and 2013. 137 isolates of the genus Magnaporthe were isolated from samples with blast and leaf spot symptoms and purified by monoconidial isolation. Study on the morphological characteristics such as color of the colony, shape, color and size of conidia and conidiophores, showed that, the isolates collected belonged to six species including M. oryzae (80 isolates), M. grisea (30 isolates), M. salvinii (5 isolates), Pyricularia higginsii (8 isolates), Pyricularia sp. ck1 (10 isolates) and Pyricularia sp. 16d (4 isolates). Pathogenicity test of M. oryzae species were applied on corn (susceptible line B73), rice, barnyard grass and foxtail in greenhouse. The results showed that this species cause blast and leaf spot symptoms on these plants except on rice. In order to investigation of phylogenetic relationships of studied isolates, ITS region of ribosomal DNA was amplified and sequenced in 12 isolates, LSU region of ribosomal DNA was amplified and sequenced in 6 isolates and calmodulin region was amplified and sequenced in 6 isolates out of 137 isolates. After drawn Neighbor-Joining and Maximum-Parsimony phylogenetic trees, four major clades in cladogram of ITS and three major clades in cladogram of calmodulin were identified. Species of the M. oryzae and M. grisea put in clade one. Species that stand into this group have phylogenetic, morphology and host differences. Condiophores and conidia sizes are different in two species. Species of the P. higginsii, Pyricularia sp. ck1, Pyricularia sp. 16d and Pyricularia juncicola put in clade two. This four species have differences in morphological characteristics. M. salvinii isolates made the basal clade. This species is diffrenet from the Magnaporthe genus in both the anamorph and phylogenetic charactrestics. In this study some isolates of Pyricularia including Pyricularia sp. ck1 (on Cyperus alternifolius) and Pyricularia sp. 16d (on juncus sp.) was found to be new taxa for the word and could be described as new species, and also was found comparative genomic sequencing of ITS region and calmodulin region that a good way to separate the different species of the genus Magnaporthe.
