عنوان پایان‌نامه
جداسازی و شناسایی پروکاریوت های هتروترف قابل کشت چشمه بادآب سورت، کیاسر- مازندران
- رشته تحصیلی
- زیست شناسی علوم میکروبیولوژی
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 63954;کتابخانه پردیس علوم شماره ثبت: 5410
- تاریخ دفاع
- ۲۵ تیر ۱۳۹۳
- دانشجو
- جواد خنشا
- استاد راهنما
- محسن رنجبران, محمدعلی آموزگار
- چکیده
- این پژوهش با هدف بررسی تنوع زیستی پروکاریوت ها از روش مبتنی بر کشت استفاده شد و هم چنین تاثیر میکروارگانیسم ها بر رسوبگذاری کربنات کلسیم در چشمه با استفاده از روش های میکروسکوپی و کشت استفاده شد. میکروارگانیسم ها و محیط در تکامل همدیگر نقش دارند که این مورد توجه اکولوژیست ها است و باکتری های جدید جدا شده می توانند کاربردهای تکنولوژیک داشته باشند خصوصاً باکتری هایی که توانایی رسوب کربنات کلسیم را دارند می توانند در کاهش سختی آب و بازیابی محیط های کربناته از کارافتاده مورد استفاده قرار گیرند. چشمه بادآب سورت در جنوب شهر کیاسر و روستای سورت قرار گرفته و دومین اثر طبیعی ملی ایران شناخته می شود. به دلیل رسوبات آهن، زیبایی منحصر به فردی در نسبت با تراورتن موجود در جهان دارد. این چشمه دارای سه سرچشمه با خصوصیات مختلف است. نمونه برداری از این سه نقطه صورت گرفت. از محیط تغییر یافته نوترینت آگار با ماده غذایی کم برای افزایش میزان جداسازی و مقدار نمک متناسب با محیط استفاده شد. سویه ها بر اساس واکنش گرم، ویژگی کلنی و آزمایش های بیوشیمیایی (کاتالاز، اکسیداز و KOH) و تحمل پذیری به نمک دسته بندی شدند، از میان 174 سویه، 44 سویه برای مرحله شناسایی مولکولی انتخاب شدند. ترادف یابی ژن 16S rRNA نشان داد که سویه ها به 21 جنس Roseovarius، Rhodovulum، Labrenzia، Erythrobacter، Erythromicrobium، Massilia، Marinobacter، Halomonas، Shewanella، Pseudomonas، Basillus، Brevibacterium، Staphylococcus، Pontibacillus،Microbacterium، Kocuria، Streptomyces، Flavobacterium، Psychroflexus، Gracilimonas و Halorubrum، و 8 رده Alphaproteobacteria، Betaproteobacteria، Gammaproteobacteria، Firmicutes، Actinobacteria، Flavobacteriia، Sphingobacteria و Halobacteriales و 5 شاخه Proteobacteria، Actinobacteria، Firmicutes، Bacteroidetes و Euryarchaeota تعلق دارند. در میان سویه های شناسایی شده 6 سویه Bsw-2b، Bsw-39a، Bsw-35a ، Bsw-70b، Bsw-35c2 و Bsw-36a به دلیل داشتن شباهت کمتر از 97% پتانسیل بودن یک تاکسون جدید را داشتند. بررسی میکرسکوپی لایه های سنگی چشمه نشان داد که میکرارگانیسم ها در رسوبگذاری تاثیر دارند و در بررسی کشت نشان داده شد که 5 سویه Bss-11a، Bss-3، Bsw-1c1، Bsw-28d و Bsw-39b توانایی رسوب کربنات کلسیم در محیط B4 دارند که به ترتیب نزدیک به تاکسون های Bacillus cohenii DSM 6307T، Labrenzia aggregate IAM 12614T، Bacillus safensis FO-036bT، Marinobacter flavimaris SW-145T و Marinobater adhaerens HP15T بودند.
- Abstract
- In this study the biodiversity of prokaryotes was investigated by culture dependent methods inaddition, the effect of microorganisms on calcite deposition in the spring was investigated using microscopic and culture methods. Microorganisms and the environment have role in each other's evolution and this is of the ecologist's interest. The newly isolated bacteria can have technological applications, especially those capable of precipitating calcium carbonate, can be used in the reduction of water hardness and the recovery of disabled carbonate environment. Badab Sourt spring is located in Sourt village, Kiasar, Iran and is known as the second national natural places in Iran. Spring has unique beauty because of iron deposits in comparison with other travertine springs in the world. This spring has three different springheads with distinct characteristics. Microbial sampling was done in these springheads. Modified nutrient agar with low nutrient to increase the rate of isolation and appropriate salt was used as the culture medium. Isolates were classified based on Gram reaction, colony characteristics and biochemical tests (catalase, oxidase and KOH) and salt tolerance. Within 174 isolates 44 of them were selected for molecular identification. 16S rRNA gene sequencing of isolates showed that isolates were belonged to 21 genera Roseovarius, Rhodovulum, Labrenzia, Erythrobacter, Erythromicrobium, Massilia, Marinobacter , Halomonas, Shewanella, Pseudomonas, Basillus, Pontibacillus, Brevibacterium, Staphylococcus, Microbacterium, Kocuria, Streptomyces, Flavobacterium, Psychroflexus, Gracilimonas and Halorubrum and 8 Classes Alphaproteobacteria, Betaproteobacteria, Gammaproteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria, Flavobacteriia, Sphingobacteria and Halobacteriales and 5 Phyla Proteobacteria, Actinobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes and Euryarchaeota . Among the strains that identified six strains including Bsw-2b, Bsw-39a, Bsw-35a, Bsw-70b, Bsw-35c2 and Bsw-36a show less than 97 % sequence similarity to the closest known strains and were representative of new endemic species of Badab Sourt spring. Microscopic studies of rock layers of the spring showed microorganism affect sedimentation in the spring, and culture methods showed that 5 strains Bss-11a, Bss-3, Bsw-1c1, Bsw-28d and Bsw-39b had the ability to precipitate calcium carbonate in B4 medium, and were close to the Bacillus cohenii DSM 6307T, 731 Labrenzia aggregate IAM 12614T, Bacillus safensis FO-036bT, Marinobacter flavimaris SW-145T and were Marinobater adhaerens HP15T taxa, respectively.
