عنوان پایان‌نامه
بررسی پلی مورفیسم نشانگرهای میکروساتلیت کروموزوم...
- رشته تحصیلی
- زیست‌شناسی-علوم‌سلولی‌مولکولی
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه پردیس علوم شماره ثبت: 3724;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 40437
- تاریخ دفاع
- ۰۳ اسفند ۱۳۸۷
- دانشجو
- نگاه احمدوند
- استاد راهنما
- علی فرازمند
- چکیده
- توالی¬های تکراری کروموزوم Y (Y-STRs) نشانگرهای مورد استفاده در پزشکی قانونی ،آزمایش تعیین پدر و همچنین در مطالعات جمعیت و دودمان¬های انسان هستند.کروموزومY به دلیل انتقال اختصاصی آن از پدر به پسر از اتوزوم¬ها متفاوت است.در بیشتر طول کروموزوم Y نوترکیبی صورت نمی¬گیرد، بنابراین از تعداد زیادی نشانگر اختصاصی Y-STR برای هر فرد تشکیل می¬شود که برای اهداف پزشکی قانونی به کار می¬رود.به دلیل نداشتن نوترکیبی هر پسر هاپلوتایپ Y-STR مشابه پدرش را دارا می¬باشد بجزء مواردی که جهش رخ می¬دهد. هدف از این مطالعه به دست آوردن توزیع 20 نشانگر Y-STR :DYS392 ، DYS393،DYS391 ،DYS390 ،DYS389l/ll ،DYS385a/b ، DYS19، DYS426،DYS388،DYS448، DYS447، DYS439،DYS438، DYS437،GATA A7.1،GATA H4 و تنوع هاپلوتایپی در یک جمعیت تصادفی از مردان ترکمن ایرانی بود.DNA از خون محیطی 100 مرد به روش رسوب نمک استخراج شد.PCR در یک دستگاه ترموسایکلر گرادیانت انجام شد. تکثیر Y-STRها در مجموعه¬ای از دو واکنش تریپلکس و شش واکنش دوبلکس صورت گرفت. محصولات PCR به¬وسیله الکتروفورز روی ژل آگارز %2 و با تفکیک بیشتر روی ژل پلی آکریل-آمید جدا شدند.در جمعیت ترکمن تعداد الل¬های لوکوس¬های مربوطه بین دو تا هشت الل، متفاوت بود.تنوع ژنی بین 2719/0 (DYS388) و 8996/0 (DYS385) متغیر بود و تعداد 87 هاپلوتایپ مختلف یافت شد و تتنوع هاپلوتایپی 9992/0 به دست آمد.نه هاپلوتایپ بیش از یک بار وجود داشت، در حالیکه 78 هاپلوتایپ در بین افراد مورد مطالعه منحصر به فرد بود.
- Abstract
- Y-chromosomal short tandem repeats (Y-STRs) are useful markers in forensic medicine and paternity testing as well as in population and lineage studies. The Y chromosome differs from the autosomes in that it is transmitted only from father to son, and escapes recombination over most of its length, so consists largely of male specific markers individuals Y-STRs used for forensic purposes. Due to the lack of recombination, a son carries the same Y-STR haplotype as his father except when mutations occur. The aim of this study was to assess the distribution of 20 Y-STR markers ,that is DYS390,DYS389I/II,DYS385a/,DYS19,DYS391,DYS393,DYS392,DYS426,DYS448,DYS437,DYS447,DYS439,H4,YCAIIa/b, DYS438, DYS460(A7.1), DYS388, and haplotype diversity in a random sample of males in Iranian Torkaman population. DNA extracted from peripheral blood 100 males with salting-out method. PCR was carried out in mastercycler Gradient thermocycler. The products were separated electrophorectically on 2% agarose gel, followed by polyacrylamid gel electrophoresis for further resolution. PCR amplification were performed in a series of two triplex and six duplex reactions. In Torkaman population respective loci showed between 2 and 8 different alleles. Gene diversity ranged between 0.2719 (DYS388) and 0.8996 (DYS385).A total of 87 different haplotypes were found and the haplotype diversity was 0.9992. Nine haplotypes occurred more than once, while 78 haplotypes were unique among individuals studied.
