عنوان پایان‌نامه
بررسی پلی مورفیسم نشانگرهای میکروساتلیت کروموزوم ....
- رشته تحصیلی
- زیست‌شناسی-علوم‌سلولی‌مولکولی
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه پردیس علوم شماره ثبت: 3721;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 40438
- تاریخ دفاع
- ۲۹ بهمن ۱۳۸۷
- دانشجو
- فرهاد خسروی
- استاد راهنما
- علی فرازمند
- چکیده
- توالی¬های تکراری کروموزوم Y (Y-STRs) نشانگرهای مورد استفاده در پزشکی قانونی ،آزمایش تعیین پدر و همچنین در مطالعات جمعیت و دودمان¬های انسان هستند.کروموزومY به دلیل انتقال اختصاصی آن از پدر به پسر از اتوزوم¬ها متفاوت است.در بیشتر طول کروموزوم Y نوترکیبی صورت نمی¬گیرد، بنابراین از تعداد زیادی نشانگر اختصاصی Y-STR برای هر فرد تشکیل می¬شود که برای اهداف پزشکی قانونی به کار می¬رود.به دلیل نداشتن نوترکیبی هر پسر هاپلوتایپ Y-STR مشابه پدرش را دارا می¬باشد بجز مواردی که جهش رخ می¬دهد. هدف از این مطالعه به دست آوردن توزیع 20 نشانگر Y-STR : DYS392 ، DYS393،DYS391 ،DYS390 ،DYS389l/ll ،DYS385a/b ، DYS19، DYS426،DYS388،DYS448، DYS447، DYS439،DYS438، DYS437،GATA A7.1،GATA H4 و تنوع هاپلوتایپی در یک جمعیت تصادفی از مردان تهران بود.DNA از خون محیطی 100 مرد به روش رسوب نمک استخراج شد.PCR در یک دستگاه ترموسایکلر گرادیانت انجام شد. تکثیرY-STRها در مجموعه¬ای از دو واکنش تریپلکس و شش واکنش دوبلکس صورت گرفت.محصولات PCR به¬وسیله الکتروفورز روی ژل آگارز %2 و با تفکیک بیشتر روی ژل پلی آکریل¬آمید جدا شدند.در جمعیت تهران تعداد الل¬های لوکوس¬های مربوطه بین دو تا هشت الل، متفاوت بود.تنوع ژنی بین 5638/0 (DYS388) و 9554/0 (DYS385) متغیر بود و تعداد94 هاپلوتایپ مختلف یافت شد و تنوع هاپلوتایپی 9995/0 به دست آمدپنج هاپلوتایپ بیش از یک بار وجود داشت، در حالیکه 89 هاپلوتایپ در بین افراد مورد مطالعه منحصر به فرد بود.
- Abstract
- Y-chromosomal short tandem repeats (Y-STRs) are useful markers in forensic medicine and paternity testing as well as in population and lineage studies. The Y chromosome differs from the autosomes in that it is transmitted only from father to son, and escapes recombination over most of its length, so consists largely of male specific markers individuals Y-STRs used for forensic purposes. Due to the lack of recombination, a son carries the same Y-STR haplotype as his father except when mutations occur. The aim of this study was to assess the distribution of 20 Y-STR markers,thatisDYS390,DYS389I/II,DYS385a/,DYS19,DYS391,DYS393,DYS392,DYS426,DYS448,DYS437,DYS447,DYS439,H4,YCAIIa/b, DYS438, DYS460(A7.1), DYS388, and haplotype diversity in a random sample of males in tehran population. DNA extracted from peripheral blood 100 males with salting-out method. PCR was carried out in mastercycler Gradient thermocycler. The products were separated electrophorectically on 2% agarose gel, followed by polyacrylamid gel electrophoresis for further resolution. PCR amplification were performed in a series of two triplex and six duplex reactions. In Tehran population respective loci showed between 2 and 8 different alleles. Gene diversity ranged between 0.5638 (DYS388) and 0.9554(DYS385).A total of 94 different haplotypes were found and the haplotype diversity was 0.9995. five haplotypes occurred more than once, while 89 haplotypes were unique among individuals studied.
