عنوان پایان‌نامه
ردیابی ژن مقاومت به سفیدک پودری (Erysiphe necator) در ژنوتیپهای انگور ایرانی (Vitis vinifera L)
- رشته تحصیلی
- مهندسی کشاورزی -بیوتکنولوژی کشاورزی
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 6660;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 71858
- تاریخ دفاع
- ۳۰ شهریور ۱۳۹۴
- دانشجو
- نازیلا کوچکیان
- استاد راهنما
- منصور امیدی
- چکیده
- Vitis vinifera L. یکی از گونه¬های زراعی مهم و اقتصادی میوه¬های دائمی در دنیا است. سفیدک پودری انگور مهم¬ترین بیماری قارچی انگور در سراسر مناطق انگورخیز جهان است. بیماری توسط یک آسکومایست اجباری Erysiphe necator (یا Uncinula necator)، ایجاد می¬شود. گیاهان از لایه¬های دفاعی متعددی برای ممانعت از نفوذ توسط پاتوژن برخوردار هستند. در مسیر پاسخ به پاتوژن عوامل مختلفی برای مقاومت به سفیدک پودری نقش دارند از جمله: اکتین سیتواسکلتون، پروتئین¬های leucine-rich repeat و پروتئین¬های PentatricoPeptide Repeat. در این مطالعه از سه مارکرهای پیوسته به مقاومت به سفیدک پودری CS25997، CS25333 و STS-AA6 استفاده شد تا این مکان ژنی در ارقام ایرانی ردیابی شود. به کمک مارکر CS25997 توالی پروتئین¬ PPR، از نوع MEF1 به عنوان پروتئین پیوسته با مارکرهای سفیدک پودری شناسایی شد. هم¬چنین مارکر STS-AA6 به عنوان بخشی از کمپلکس پروتئینی در منفذ هسته شناسایی شد که به آنالوگ خود در آرابیدوپسیس به عنوان زیر واحد مجموعه رونویسی شباهت داشت. بر اساس مکانیسم دفاعی انگور در برابر سفیدک پودری انگور و تغییر بیان ژن¬ها در اثر القاء این پاتوژن، شبکه پاسخ به پاتوژن رسم شد. ارتباط پروتئین PPR و زیر واحد مجموعه رونویسی با شبکه پاسخ¬گویی به بیماری سفیدک پودری انگور بررسی شد. به نظر می¬رسد پروتئین¬های PPR با قابلیت اتصال به RNA و پردازش، پیرایش و ویرایش RNA می-توانند در مرحله پس از رونویسی در پاسخ گیاه به پاتوژن مؤثر باشند. پیوستگی زیر واحد مجموعه رونویسی با مقاومت به سفیدک پودری نیز بیان¬گر نقش تنظیم کننده¬های ترجمه در مقاومت به سفیدک پودری است. تفاوت رقم مقاوم با ارقام حساس به سفیدک پودری نیز به کمک مارکر sequence-related amplified polymorphism ارزیابی شد. این نوع مارکر نواحی کدکننده را تکثیر نموده و مشخص شد رقم مقاوم با ارقام حساس از نظر قسمت¬های کدشونده ژنوم متفاوت است.
- Abstract
- Abstract One of the most important economic crop world-wild species is Vitis vinifera L.. The most important fungal disease of grapevines is powdery mildew across the world. The disease is caused by an obligate biotrophic ascomycete, Erysiphe necator (or Uncinula necator). Plants have multiple layers of defense for preventing the infiltration and colonization by pathogens. On the way to respond to Powdery mildew pathogens different factors are involved for resistance, such as actin Sytoskeleton, leucine-rich repeat protein and PentatricoPeptide Repeat proteins. In this study, three markers linked to powdery mildew resistance CS25997, CS25333 and STS-AA6 was used to detect this locus in Iranian cultivares. CS25997 marker was identified as a PPR protein sequence, type of MEF1. Also, STS-AA6 marker was identified as a sub-unit of nuclear pore complex protein that have similarity to its analog in Arabidopsis as a transcription complex. In base of defense mechanism against powdery mildew in grapes, and grape genes expression changes induced by this pathogen, Response Network to pathogen was drawn. We surveyed the interaction of PPR protein and subunit of protein complex with response network to grape powdery mildew disease. It seems that PPR proteins with ability to bind to RNA and processing, splicing and editing RNA can be effective at post-transcription in the plant response to pathogens. The linkage between subunit of transcription complex and powdery mildew resistance shows the role of translation regulators in powdery mildew resistance. Differences between susceptible and resistant cultivar were evaluated with sequence-related amplified polymorphism markers. This type of marker amplified coding regions and shows that resistant and susceptible cultivars have different coding regions in their genome. Key words: PPR proteins, SRAP, LRR, MEF1, Chitin.
