عنوان پایان‌نامه
ارزیابی تنوع ژنتیکی برخی از توده های وحشی زعفران Crocuse cancellatus C specious با استفاده از نشانگرهای مورفولوژیکی و مولکولی
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 58700
- تاریخ دفاع
- ۰۷ بهمن ۱۳۹۱
- دانشجو
- بیتا خوانساری نژاد
- استاد راهنما
- محمدرضا حسندخت
- چکیده
- در این پژوهش تنوع ژنتیکی 25 ژنوتیپ زعفران ایرانی از سه گونه زعفران ( C. specious، C. cancellathus و C. sativus) با استفاده از 16 صفات مورفولوژیک و نشانگرهای RAPD، ISSR مورد ارزیابی قرار گرفت. در صفات تعداد برگ در بوته، طول گلبرگ، وزن¬گل، ارتفاع ساقه گل¬دهنده و طول کلاله، گونه زعفران اهلی ( C. sativus) با گونه specious متفاوت بود، ولی با گونه cancellatus تفاوت معنی داری نداشت. از نظر صفات تعداد پوشش بیرونی و وزن خشک کرم¬ها، گونه زعفران اهلی با گونه cancellatus متفاوت و با گونه specious شباهت داشت. 70 آغازگر تصادفی RAPD در انجام واکنش PCR بررسی شدند و 19 آغازگر که به خوبی تکثیر شده بودند، انتخاب شدند. در مجموع 276 باند در کل نمونه¬ها تکثیر یافتند که از بین آنها 261 باند چندشکل بودند و ضریب کوفنتیکی بین ماتریس تشابه و دندروگرام در حد 96/0 r=بدست آمد. تجزیه کلاستر نمونه¬ها براساس نوارهای چندشکل و با استفاده از ضریب تشابه جاکارد و به روش UPGMA انجام گرفت و نمونه ها در حد تشابه 36/0 به چهار گروه مجزا تقسیم شدند. در این روش هم مانند صفات مورفولوژیک گونه C. specious از دو گونه دیگر جدا شد. زعفران اهلی در حد تشابه 28/0 به خوبی از دو گونه cancellatus و specious جدا شد. در مورد نشانگر ISSR از 22 آغازگر مورد استفاده، 13 آغازگر انتخاب شد. در مجموع 161 باند در کل نمونه¬ها تکثیر یافتند که از بین آنها 153 باند چندشکل بودند و تجزیه کلاستر نمونه¬ها در حد تشابه 40/0 نمونه ها به هشت گروه تقسیم شدند و ضریب کوفنتیکی بین ماتریس تشابه و دندروگرام 84/0 r=به دست آمد. در این روش نیز گونه specious از گونه زعفران اهلی و گونه cancellatus جدا شد. در این روش زعفران اهلی در تشابه 40/0 از گونه های وحشی جدا شد، ولی در حد تشابه 36/0 به C. cancellatus شباهت داشت. که در بررسی مورفولوژیک نیز زعفران اهلی به توده اراک متعلق به گونه C. cancellatus شباهت داشت. کلمات کلیدی: تنوع ژنتیکی، دندروگرام، ضریب کوفنتیکی
- Abstract
- In the present study, the genetic diversity of 25 Iranian saffron genotypes from three species (C. specious, C. cancellatus & C. sativus) has been evaluated using 16 morphologic traits, ISSR and RAPD markers. Domestic saffron species (C. sativus) was different with specious in the leaf number, petal length, flower weight, flowering stem height and the stigma length, but had no significant difference with cancellatus species. Meanwhile, considering such traits as the number of outer cover and the corm dry weight, domestic saffron species was different with cancellatus and similar to specious. A set of 70 RAPD random primers have been investigated in PCR reactions and 19 primers being well propagated have been selected. A total number of 276 bands have been amplified from all the samples, out of which there were 261 polymorphic bands and the coefficient between similarity matrix and dendrogram was about r=0.96. The samples' cluster analysis was done on the basis of polymorphic bands and using Jaccard's similarity coefficient and by UPGMA method and the samples were divided into four groups by the similarity of 0.36. In this method, morphologic traits of C. specious were separated from the other two species. Domestic saffron was well separated from cancellatus and specious by the similarity of 0.28. Regarding ISSR marker, 13 primers have been selected among 22 primers. A total number of 161 bands have been amplified among the whole sample out of which there were 153 polymorphic bands and the samples were divided into eight groups by the cluster analysis similarity of about 0.40. Cophenetic coefficient between similarity matrix and dendrogram was calculated as r=0.84. In this method, specious has been separated from the domestic saffron and cancellatus as well. Meanwhile, domestic Saffron has been separated from the wild species by the similarity of 0.40, but it was similar to C. cancellatus by 0.36. It should be noted that in morphological investigations, domestic saffron was similar to Arak genotype belonging to C. cancellatus. Keywords: Genetic diversity, RAPD, ISSR, UPGMA, Crocus
