عنوان پایان‌نامه
بررسی چند شکلی زن و ارتباط آن با صفات تولید شیر در گاوهای شیری هلشتلین ایران
- رشته تحصیلی
- علوم دامی - ژنتیک و اصلاح نژاد دام
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 47925;کتابخانه پردیس ابوریحان شماره ثبت: 486
- تاریخ دفاع
- ۱۵ اسفند ۱۳۸۹
- دانشجو
- احد یوسفی
- استاد راهنما
- عبدالرضا صالحی
- چکیده
- پروتئین UTMP یکی از مهم¬ترین پروتئین¬های عضو خانواده بزرگ بازدارنده¬های سرین پروتئاز (Serine protease inhibitor super¬family) می¬باشد. این پروتئین تحت تاثیر پروژسترون توسط اندومتریوم در طی آبستنی ترشح می¬شود. از وظایف آن می¬توان به بازدارندگی پروتئاز، کنترل رشد، تغذیه رویان و سرکوب موضعی سیستم ایمنی مادری برای حفظ وتداوم آبستنی از طریق ممانعت از تکثیر و فعالیت لیمفوسیت¬ها و سلولهای کشنده طبیعی می¬باشد. ژن UTMPبر روی کروموزم شماره 21 قرار دارد و با 8639 جفت باز دارای 4 اگزون می¬باشد. این مطالعه به منظور بررسی چند شکلی ژن UTMP و ارتباط آن با صفات تولید شیر در جمعیت گاوهای هلشتاین ایران انجام شد. استخراج DNA از تعداد 105 نمونه اسپرم مربوط به گاوهای نر هلشتاین تایید شده توسط مرکز اصلاح نژاد دام کشور با روش نمکی بهینه شده و همچنین کیت استخراج انجام شد. یک جفت آغازگر رفت و برگشت با استفاده از نرم¬افزار Oligo طراحی شد و یک قطعه 568 جفت بازی شامل بخش¬هایی از اینترون 3، اگزون 4 و قسمت¬های پایین دستی ژن UTMP با استفاده از واکنش زنجیره¬ای پلیمراز تکثیر گردید. جهت هضم آنزیمی قطعه تکثیر شده از آنزیم BsrI استفاده شد. نتایج بیانگر وجود سه آلل A، B و C با فراوانی¬های 135/0، 69/0 و 175/0 در جمعیت مورد مطالعه می¬باشد. فراوانی ژنوتیپی مشاهده شده برای ژنوتیپ¬های AB، BB، BC و CC به ترتیب 27/0، 49/0، 13/0 و 11/0 بود و همچنین ژنوتیپ¬های AA وAC مشاهده نشد. جمعیت مورد نظر در تعادل هاردی- واینبرگ قرار نداشت. به منظور برآورد پارامترهای ژنتیکی صفات تولیدی جمعیت گاوهای هلشتاین ایران، از اطلاعات موجود در مرکز اصلاح نژاد دام کشور، مربوط به گاوهای هلشتاین زایش اول بین سالهای 1372 تا 1387 استفاده گردید. اجزاء واریانس و پارامتر¬های ژنتیکی با استفاده از روش حداکثر درستنمایی محدود شده و الگوریتم میانگین اطلاعات در قالب مدل حیوانی توسط نرم افزار ASREML برآورد گردید. وراثت¬پذیری (h2)صفات تولید شیر، مقدار چربی، مقدار پروتئین، درصد چربی و درصد پروتئین با استفاده از مدل تک صفتی به ترتیب 279/0، 21/0، 22/0، 32/0 و 34/0 برآورد گردید. ارتباط معنی¬داری بین ژنوتیپ¬های ژن UTMP با صفات تولید شیر، مقدار چربی و مقدار پروتئین مشاهده شد. حیوانات با ژنوتیپ CC دارای عملکرد بهتری برای صفات تولید شیر، مقدار چربی و مقدار پروتئین نسبت به سایر ژنوتیپ¬ها می¬باشد. واژه¬های کلیدی: چند¬شکلی، ژن UTMP، وراثت¬پذیری، گاو هلشتاین، تولید شیر
- Abstract
- Uterine Milk Proteins (UTMP) are member of serine protease inhibitor super¬family and is renamed SERPINA14. This protein secreted from uterine endometerium under influ-ence of progesterone during pregnancy. Specific functions of UTMP include protease inhibition, growth control, direct nutrition of the conceptus and suppression of local ma-ternal immune system for sustaining pregnancy. UTMP gene has 8639 base pair with 4 exon wich located is chromosome 21. This investigation was performed in order to study polymorphism of UTMP gene and its association with milk production and com-ponent traits in Hostein bulls of Iran. Genomic DNA was extracted from 105 semen samples of proven bulls using High pure PCR template preparation kit and also modified Saltig-Out method. A pair of Primer was designed by Oligo software in order to amplify 568bp-fragment including same part of intron 3, whole exone 4 and down stream of UTMP gene. PCR products were digested with BsrI enzyme. The frequencies of alleles a, b and c were 0.135, 0.69 and 0.175, respectively in studied population. Four genotypes AB, BB, BC and CC were observed with frequencies of 0.27, 0.49, 0.13 and 0.11 respectively. Genotypes AA and AC were not observed in this study. The chi-squer(x2) test revealed deviation from Hardy-Weinberg equliberium. Data related to first lactation during years 1993-2008 were obtained from Animal Breeding Center of Iran. Genetic parameters were estimated by Average Information Restriction Maximum like-lihood procedure using univariate animal model of ASREML Software. Heritability of milk yield, fat yield, protein yield, fat percent and protein percent were 0.28, 0.21, 0.22, 0.32 and 0.34, respectively. Results indicated significant association between UTMP Genotypes and milk, fat and protein yield traits. Meanwhile, Bulls with CC Genotype had higher milk, fat and protein yield traits compard to other genotypes (p<0.05).. These results suggeste that UTMP as a major gene influencing milk production traits might be implemented in breeding programmes to improve the production performance of Iranian Holstein cattle. Key words: UTMP gene, Heritability, polymorphism, Holstein cattle
