عنوان پایان‌نامه

بررسی مولکولی ژن های هماگلوتنیین و نورآمینداز تحت تیپ H۹N۲ ویروس آنفلوانزای طیور جدا شده از طیور گوشتی جنوب عراق



    دانشجو در تاریخ ۰۶ بهمن ۱۳۹۵ ، به راهنمایی ، پایان نامه با عنوان "بررسی مولکولی ژن های هماگلوتنیین و نورآمینداز تحت تیپ H۹N۲ ویروس آنفلوانزای طیور جدا شده از طیور گوشتی جنوب عراق" را دفاع نموده است.


    رشته تحصیلی
    ویروس شناسی
    مقطع تحصیلی
    دکتری تخصصی PhD
    محل دفاع
    کتابخانه دانشکده دامپزشکی شماره ثبت: 694 ت;کتابخانه دانشکده دامپزشکی - مخزن مرد آباد شماره ثبت: 694 ت;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 78621;کتابخانه دانشکده دامپزشکی شماره ثبت: 694 ت;کتابخانه دانشکده دامپزشکی - مخزن مرد آباد شماره ثبت: 694 ت;
    تاریخ دفاع
    ۰۶ بهمن ۱۳۹۵

    مقدمه: آنفلوانزای پرندگان (AI)، یک بیماری مهم ویروسی ناشی از ویروس آنفلوانزا تیپ A متعلق به خانواده ویروس‌های اورتومیکسوویریده است. ویروس آنفلوانزای پرندگان (AIV) باعث بروز عفونت مزمن تا حاد در انواعی از پرندگان اهلی و وحشی و نیز پستانداران دیگری همچون انسان می شود. به ترتیب 18 تحت تیپ هماگلوتینین (HA) و 11 تحت تیپ نورآمینیداز (NA) عامل ایجاد عفونت بوده و ویروس ها بر اساس دو گلیکوپروتئین سطحی HA و NA به تحت تیپ های گوناگونی تقسیم می شوند. تا به امروز 16 HA (H1-H16) و 9 NA (N1-N9) از پرندگان وحشی، خصوصاً پرندگان آبزی به‌عنوان مخزن اصلی طبیعی این ویروس جداشده‌اند (کاپلان و Webby، 2013؛ Urbaniak و همکاران، 2014). AIV و خصوصاً تحت تیپ های H5N1 و H9N2 به ‌سرعت به طیور خانگی منتقل‌شده و در مقیاس بالا باعث بروز آسیب حاد به صنعت طیور می شوند. تحت تیپ های AIV بر اساس توانایی آن‌ها در ایجاد بیماری به دو گروه تحت عنوان آنفلوانزای پرندگان کم حدت (LPAI) و پرحدت (HPAI) تقسیم می شوند (الکساندر، 2000). گزارش شده است که برخی از تحت تیپ های AIV (مثل H5, H7 و H9) نیز از سد گونه ای عبور کرده و باعث بروز بیماری یا عفونت های تحت بالینی در انسان و دیگر پستانداران شده اند (الکساندر، 2007). ویروس‌های H9N2 آنفلوانزا به‌عنوان ویروس هایی کم حدت مطرح هستند. آن‌ها در اواسط دهه 1980 در چندین گونه پرندگان در آسیا، خاورمیانه، آفریقا و اروپا پانزئوتیک شدند. ویروس‌های H9N2 عموماً باعث بروز درگیری های جزئی تنفسی می شوند ولی بااین‌حال این روزها مشکلات بارزی را با ایجاد تلفات بالا در طیور ایجاد می نمایند. انتقال زئونوتیک به انسان نیز گزارش شده است (Peiris و همکاران، 1999). به‌علاوه، الودگی H9N2 در طیور شانس زیادی را برای جهش و بازآرایی به وجود میآورد (Capua و الکساندر، 2008؛ وبستر و همکاران، 2007). ویروس آنفلوانزای H9N2 در میان جمعیت طیور بسیاری از کشورهای اوراسیا (اغلب در بنگلادش، هند، پاکستان، ایران، فلسطینی اشغالی ، مصر و امارات متحده عربی) گزارش شده است. چنین گردش ویروسی می تواند منجر به بروز چندین جهش و به دنبال آن تسریع سویه های جدید AIV شود. موارد وقوع AI ناشی از ویروس‌های H9N2 همچنان در عراق، خصوصاً در مرغان تجاری که به لحاظ جغرافیایی در کل این کشور پخش شده و باعث بروز عفونت های تنفسی جدید به همراه تلفات بالا و نتیجتاً ضررهای اقتصادی هنگفت می شود، به چشم می خورند. اهمیت پروژه موارد وقوع AI ناشی از ویروس‌های H9N2 همچنان در عراق رخ داده و ضررهای اقتصادی بارزی را به صنعت طیور وارد می نماید. علیرغم پیشرفتت صنعت طیور در عراق، همچنین تولید طیور عراق قادر به تأمین نیازهای بازار عراق نبوده و بدین ترتیب عراق مجبور به واردکردن این محصولات از کشورهای همسایه و نیز تخم مرغ جنین دار است که سبب افزایش احتمال انتقال ویروس به و از عراق می گردند. صنعت طیور عراق با چالش های بسیاری مواجه است. یکی از مهم ترین تهدیدها، ویروس آنفلوانزای H9N2 است که اثری مخرب بروی سرمایه گذاری و میزان رشد صنعت طیور گذاشته و همچون ایران، بر اساس گزارش‌های متعدد فیلدی به‌عنوان یکی از علل اصلی بیماری های تنفسی مرغ در عراق محسوب می شود. درحالی‌که تکامل ژنتیکی و آنتی ژنی ویروس‌های H9N2 در بسیاری از کشورها به وبی محرز شده است، اطلاعات مربوط به خصوصیات ویروس‌های H9N2 در حال گردش در عراق محدود است. اهداف پروژه اهداف کلی نظارت، بازرسی و تعیین خصوصیات مولکولی پیوسته ویروس آنفلوانزای در گردش اهمیت بالایی دارد. فهم انتشار این ویروس‌های در حال گردش ضروری است. به‌علاوه، گزارش سویه های جدیداً در حال گردش و فهم پتانسیل پاندمیک آن‌ها ضروری است. تعیین خصوصیات پیشین، جداسازی مؤثر و شناسایی مؤثر ویروس‌های آنفلوانزای پرندگان از نمونه های نظارتی از چالش های اساسی محسوب می شوند. بدین ترتیب، مطالعه حاضر با توجه به اهداف اصلی زیر طراحی شده است: 1) تشخیص مولکولی ویروس آنفلوانزای تحت تیپ H9 در حال گردش در بخش های مرکزی و جنوبی عراق 2) تحلیل ژنتیکی ویروس آنفلوانزای تحت تیپ H9N2 در عراق و بررسی روابط ویروس‌های عراق با جدایه های دیگر کشورها، ازجمله کشورهای مجاور و تحت مجموعه های اروپایی، به‌منظور تشریح مبدأ جدایه های ویروسی پرندگان (H9N2) در سالیان اخیر. اهداف اختصاصی 1- تعیین خصوصیات زیستی ویروس‌های در حال گردش آنفلوانزا به ‌منظور دانستن مجموعه میزبان، بیماری‌زایی و خصوصیات گیرنده حائز اهمیت است زیرا می تواند منجر به تولید واکسنی موفق گردد. 2- تبیین شبکه منطقه ای برای انجام مطالعات مشارکتی و استفاده از اطلاعات مطالعه کنونی به‌منظور تعریف قوانین بهداشتی پیشگیری از تحت تیپ خطرناک H9 بین کشورهای همسایه عراق
    Abstract
    H9N2 avian influenza viruses (AIVs) infection in Iraq has brought about remarkable economic losses to the poultry industry, especially in broiler flocks during the past decade, and is still continuing. The current study is aimed at describing the molecular detection and genetic analysis of AIV subtype H9N2 circulating in poultry population of middle and southern parts of Iraq during the course of 2014-2015. Out of the examined 100 broiler flocks with respiratory signs, 16% of studied flocks were found positive for H9 subtype viruses by real-time PCR screening. The statistical analysis of the results revealed a significant difference (P<0.05) in the infection rate of AIV among the broiler flocks of Al-Basra, Al-Qadisyia and An- Najaf provinces (14.28%, 20% and 23.80% respectively) as compared to other provinces, while the results of the current study showed that the An-Najaf province had the highest infection rate (23.80%) than all other provinces. The range of mortality in the infected flocks was between 25%–70%. In the present study, H9 subtype of AIV reported for the first time in broiler flocks of Wasit and Al-Basra provinces. The positive H9N2 cases recorded during cold months was 12/16 cases, while the other 4 positive cases were reported in warm months. So, the annual rate of positive cases increased in winter (75%) and decreased generally in summer (25%). Genetic comparison of the partial sequences of HA gene indicated that all Iraqi viruses are related to each other and could be divided into two subgroups. Viruses of the first and the second subgroups demonstrated a high similar identity with Pakistani and Iranian viruses, respectively. The nucleotide sequences of the NA protein of the all studied Iraqi viruses were very similar (95.2-100% identity), and shared high nucleotide sequence identity with Iranian, Pakistani, and Lebanese strains. All 6 recent viruses possessed histidine, alanine, and Lucien at positions 183, 190 and 226 respectively, which are the key residues in receptor-binding sites, it can be predicted that the Iraqi viruses have a weaker affinity binding to a human-like receptor, but it seems that the potential of Iraqi AIVs to infect human should be considered, in particular the deduced amino acid sequences showed the presence of Lucien at position 226 in all viruses which indicates the preference of ? 2-6 sialic acid at the binding site of the receptors. This study indicated the endemic situation of H9N2 with broad geographical distribution in the broiler flocks of Iraq. Also the Iraqi viruses were closely related to viruses of G1-like lineage isolated from poultry flocks of Iran and Pakistan, suggesting that possible epidemiological links could be derived from a common origin.