عنوان پایان‌نامه
« مطالعه سیستماتیک گونه های جنس Colletotrichum در نواحی جنوبی دریای خزر »
- مقطع تحصیلی
- دکتری تخصصی PhD
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 6991;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 75850;کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 6991;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 75850
- تاریخ دفاع
- ۲۶ تیر ۱۳۹۵
- دانشجو
- علیرضا علیزاده
- استاد راهنما
- محمد جوان نیکخواه
- چکیده
- گونه های جنس Colletotrichum بیمارگرهای مهم گیاهی هستند که باعث ایجاد بیماری در دامنه وسیعی از گیاهان چوبی و علفی می شوند. این تحقیق به منظور مطالعه جامع جنس Colletotrichum در استان های شمالی کشور انجام پذیرفت. در طی سال های 1392-1390 نمونه برداری های وسیعی از استان های شمالی کشور شامل گیلان، مازندران و گلستان از اندام های گیاهان مختلف شامل غلات، علف های هرز باریک برگ، علف های هرز پهن برگ، درختان میوه، درختان غیر مثمر، گیاهان زینتی و آپارتمانی و همچنین برخی جگن ها و سرخس ها که علایم آنتراکنوز، لکه برگی و پوسیدگی در بافت های گیاهی نشان می دادند، انجام شد. در مجموع، تعداد 534 جدایه خالص شده Colletotrichum به دست آمد. جدایه ها تنوع زیادی را در صفات ریخت شناختی و ویژگی های پرگنه روی محیط های غذایی از خود نشان دادند. گروه بندی جدایه ها بر اساس اطلاعات جدایه ها (میزبان و مناطق نمونه برداری)، خصوصیات پرگنه (رنگ، میزان رشد، بافت و رنگ توده ی کنیدیومی)، صفات ریخت شناختی کنیدیوم ها (شکل، اندازه و وجود و یا عدم وجود زواید) و الگوی انگشت نگاری DNA با استفاده از نشانگر مولکولی ISSR صورت پذیرفت. تعداد 199 جدایه برای مطالعات تبارزایی انتخاب شد. برای مطالعات ریخت شناسی ویژگی هایی نظیر مشخصات کنیدیوم، کنیدیوفر، خار، اپرسوریوم، اندام باردهی جنسی و غیر جنسی، وجود و یا عدم وجود سختینه و مشخصات پرگنه قارچی روی محیط های غذایی (potato dextrose agar) PDA، OA (oatmeal agar) و SNA (synthetic nutrient-poor agar) مورد بررسی قرار گرفت. برای مطالعات تبارزایی نیز در مجموع هشت ناحیه ژنومی شامل TUB2، GAPDH، GS، ACT، SOD2، APN2، APN2/MAT و ITS - rDNA تعیین توالی و پس از انجام آزمون های مشابهت یابی تبارنماهای فیلوژنتیکی تک ژنی و چندژنی رسم شد. پس از تلفیق نتایج حاصل از مطالعات تبارزایی و ریخت شناختی اقدام به شناسایی گونه ها شد. تعداد 199 جدایه انتخاب شده، به 11 کمپلکس در جنس Colletotrichum، 27 گونه شناخته شده و 15 کاندیدای گونه جدید تعلق داشتند. گونه های شناسایی شده عبارتند از: C. americae-borealis، C. aenigma، C. camelliae، C. cereale، C. circinans، C. cliviae، C. coccodes،C. dematium ، C. fructicola، C. gigasporum، C. gloeosporioides، C. glycines، C. godetiae، C. kahawae، C. karstii، C. lindemuthianum، C. lini، C. liriopes، C. musae، C. nicholsonii، C. orchidearum، C. siamense، C. spaethianum، C. sublineolum، C. theobromicola، C. trichellum و C. truncatum می باشند. از این تعداد 15 گونه شامل: C. americae-borealis، C. aenigma، C. cliviae، C. gigasporum، C. glycines، C. godetiae، C. kahawae، C. karstii، C. lini، C. liriopes، C. nicholsonii، C. orchidearum، C. siamense، C. spaethianum و C. theobromicola برای میکوبیوتای ایران جدید می باشند. همچنین گیاهان زیادی به عنوان میزبان های جدید برای گونه های جنس Colletotrichum در ایران و دنیا معرفی می شوند.
- Abstract
- Systematic study on Colletotrchum species in the southern Caspian coast Abstract Colletotrichum species are important plant pathogens, causing diseases in a wide variety of woody and herbaceous plants. This investigation was conducted in order to a comprehensive study on the genus Colletotrichum in Northern Iran. During 2011-2013, numerous samplings were conducted from various plants including: cereals, grasses, herbaceous plants, ornamental plants, orchard and forest trees, sedges and ferns that were symptomatic (anthracnose, leaf spots and rots) in Guilan, Mazandaran, Golestan provinces of Iran. A total number of 534 isolates were obtained, purified and stored. The isolates were showing considerable variability in morphological and cultural characteristics on various culture media. Screening of the isolates were performed based on isolates information, colony characteristics, morphology of conidia and DNA fingerprinting patterns using ISSR molecular marker. A total number of 199 isolates were selected for phylogenetic analysis. Various morphological characters including conidia, conidiophores, setae, appressoria, conidiomata, ascomata, sclerotia and cultural characteristics were noted on Potato dextrose agar (PDA), synthetic nutrient-poor agar medium (SNA) and OA (oatmeal agar) culture media. Phylogenetic analysis inferred from sequencing of eight loci including ITS, TUB2, GAPDH, GS, SOD2, APN2, MAT/APN2 and ACT genes. Monogenic and multigenic phylogenetic trees were drawn. The isolates were identified based on combination of phylogenetic analysis and morphological criteria. The isolates belonged to 11 Colletotrichum species complex, 27 named species and 15 new species including: C. nicholsonii, C. spaethianum, C, liriopes, C. aenigma, C. siamense, C. kahawae, C. theobromicola, C. lini. C. godetiae, C. americae-borealis, C. karstii, C. orchidearum, C. cliviae, C. glycines, C. gigasporum, C. fucticola, C. musae, C. gloeosporioides, C. camellaie, C. lindemuthianu
