عنوان پایان‌نامه
بررسی چند شکلی ژن کاندیدا و ارتباط آنها با صفات اقتصادی بلدرچین ژاپنی
- رشته تحصیلی
- ژنتیک و اصلاح نژاد دام
- مقطع تحصیلی
- دکتری تخصصی PhD
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 7157;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 77995;کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 7157;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 77995
- تاریخ دفاع
- ۲۸ شهریور ۱۳۹۵
- دانشجو
- هما اعرابی
- استاد راهنما
- محمد مرادی شهربابک
- چکیده
- به منظور بررسی وجود چند شکلی تک نوکلئوتیدی در نواحی پروموتر ژن فاکتور رشد شبه انسولینی 1 (IGF1)، اینترون 2 ژن IGFBP2 و اینترون 2 ژن UCP3 و ارتباط آن با صفات رشد و اجزای لاشه در بلدرچین، از جمعیت حاصل از تلاقی 8 جفت بلدرچین سفید و وحشی به عنوان جمعیت پایه برای تولید افراد نسل اول (F1) استفاده شد. از تلاقی بین 34 قطعه در نسل F1، 422 قطعه در نسل F2 ایجاد شد. رکوردهای وزن بدن در سنین مختلف و اجزای لاشه در نسل دوّم ثبت شد. با استفاده از روش PCR-SSCP یک چند شکلی جدید تک نوکلئوتیدی G?A در ناحیه پروموتر ژن IGF1 در 472 قطعه بلدرچین در سه نسل تشخیص داده شد. فراوانی ژنوتیپ های AA، AG و GG به ترتیب 0/05، 0/62و 0/33 و فراوانی آلل های A و G به ترتیب 0/36 و 0/64 محاسبه شد. از لحاظ آماری ارتباط معنی داری بین این چند شکلی با صفات رشد و لاشه در بلدرچین ژاپنی مشاهده نشد. در جایگاه اینترون 2 ژن IGFBP2، 10 SNP مشاهده شد که همگی از نوع جهش های جانشینی بود. از روی ژنوتیپ مشاهده شده والدین و فرزندان در جمعیت، 6 هاپلوتیپ مختلف در جمعیت به دست آمد و ژنوتیپ های موجود در ساختار جمعیت با وزن بدن در هفته های مختلف پرورش، زمان کشتار و نیز اجزای مختلف لاشه نظیر لاشه گرم، لاشه سرد، وزن قلب، سنگدان، کبد، بورس فابرسیوس، ران و سینه ارتباط معنی داری داشت (P<0.001). همچنین در اینترون 2 ژن UCP3، 12 SNP مشاهده شد که یکی از جهش ها به صورت درج و بقیه به صورت جانشینی بودند. 4 هاپلوتیپ مختلف با فراوانی بالاتر از 1 درصد در جمعیت شناسایی شد و ژنوتیپ های مشاهده شده از این هاپلوتیپ ها در جمعیت با اغلب صفات نظیر وزن بدن در سن یک و 21 روزگی و زمان کشتار و وزن اجزای لاشه نظیر وزن روده، کبد، طحال، قلب، سنگدان، پیش معده، سر، چربی لاشه، گردن و بال ارتباط معنی دار داشتند (P ?0.05). نتایج ارایه شده در این پژوهش در مقایسه با گزارشات دیگر در مرغ، نشان دهنده یک چند شکلی جدید در ناحیه پروموتر ژن IGF1 و جهش های زیادی در نواحی اینترون 2 ژن IGFBP2 و UCP3 بود که قبلا در مرغ بررسی شده بود اما در بلدرچین بررسی نشده بود. بنابراین با توجه به وجود مشاهده ارتباط بین چند شکلی های مشاهده شده در ژن های IGFBP2 و UCP3 با برخی از صفات رشد در این پژوهش، ژن های مذکور می توانند به عنوان ژن های کاندیدا برای بررسی صفات مزرعه ای و اقتصادی در بلدرچین مورد استفاده قرار بگیرند.
- Abstract
- The aim of this research was to identify polymorphisms of the promoter of IGF1gene, the itron2 of IGFBP2 gene and the intron2 of UCP3 gene and their association with growth and Carcass traits in Japanese quail. Eight pairs of white and wild quails were crossed reciprocally as a base population to produce F1 generation. A total of 34 quails were produced in F1 generation and 422 quails were generated by intercrossing the F1 population. Body weight changes in different ages were measured in the birds of second generation. A novel single nucleotide polymorphism (SNP) G?A was identified in IGF1 promoter region in 472 birds of three generations using PCR-SSCP assay and sequencing. Genotypic frequencies of AA, AG and GG were 0.05, 0.62 and 0.33, respectively for all generations. No significant associations were observed between IGF1 genotypes and growth and carcass traits. A ten substitution mutation in intron 2 of IGFBP2 gene was detected. A six different haplotypes were obtained from the genotypes of parents and progeny’s in the population. The results showed that the IGFBP2 SNP was associated with multiple traits, including body weights(BW) at the time of hatching and different weeks until slaughtering ,hot carcass weight, cold carcass, heart , gizzard, liver, bursa of fabricius, femur, and breast weights (P?0.01). Using PCR-SSCP assay and sequencing, the twelve SNPs including one insertion polymorphisms, and eleven intronic substitutions were discovered. Four different haplotypes, with the minor allelic frequencies of above 1%, were identified based on these 12 SNP. Results showed significant association of diplotypes with most traits including BW at the time of hatching and three weeks, and carcass traits such as intest?, liver, spleen, heart, pro-stomach, head, Carcass fat, neck and wing weights (P?0.05). Comparison the detected allele in the present study with reported allele in chickens revealed a novel SNP in promoter of IGF1 gene in Japanese quail, with associ
