عنوان پایان‌نامه
بررسی مولکولی حضور ژنهای stx وeae در جدایه های انتروپاتوژنیک و شیگاتوکسیژنیک اشرشیاکلی در نمونه های مدفوعی حیوانات موجود در تعدادی از باغ وحش های ایران و ارزیابی ارتباط ژنتیکی آنها
- رشته تحصیلی
- باکتری شناسی
- مقطع تحصیلی
- دکتری تخصصی PhD
- محل دفاع
- کتابخانه دانشکده دامپزشکی شماره ثبت: 632 ت;کتابخانه دانشکده دامپزشکی - مخزن مرد آباد شماره ثبت: 632 ت;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 72661;کتابخانه دانشکده دامپزشکی شماره ثبت: 632 ت;کتابخانه دانشکده دامپزشکی - مخزن مرد آباد شماره ثبت: 632 ت;
- تاریخ دفاع
- ۱۹ بهمن ۱۳۹۴
- دانشجو
- علیرضا کوچک زاده
- استاد راهنما
- تقی زهرائی صالحی
- چکیده
- اهمیت بیماری زایی سویه های STEC و EPEC برای انسان کاملا مشخص است. نشخوارکنندگان به عنوان حاملین اصلی این سویه ها شناخته می شوند اگرچه حضور این سویه ها بعضا در دیگر گونه های حیوانی نیز گزارش شده است. هدف از انجام تحقیق پیش رو بررسی حضور و یا عدم حضور این سویه ها بویژه سروتیپ O157:H7 در حیوانات وحشی موجود در برخی باغ وحش های ایران بود، چرا که در مطالعات به انجام رسیده در این زمینه کمبود اطلاعاتی شدیدی احساس می گردد. لذا از 274 حیوان مختلف نمونه گیری انجام شد و حضور سویه های STEC و EPEC و سروتیپ O157:H7 و درصد حضور ژن های stx1 و stx2 و تعیین تیپ ژن eae و بررسی الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی جدایه های مذکور و بررسی ارتباط اجدادی آنها به روش RAPD-PCR و ERIC-PCR در دستور کار قرار گرفت. درصد حضور جدایه های واجد ژن stx در علفخواران و گوشتخواران و میمون ها به ترتیب عبارت بود از: 8.3%، 12.3% و 22.7% که در کل ژن stx1 از فراوانی بیشتری نسبت به ژن stx2 برخوردار بود. همچنین در صد فراوانی ژن eae میان علفخواران و گوشت خواران و میمون ها به ترتیب 9% و 1.03% و 22.7% بود. که از این بین تنها تیپ eae تتا و گاما مورد شناسایی قرار گرفت. همچنین لازم به ذکر است که سروتیپ O157:H7 تنها از میمون رزوس و شامپانزه و بابون جداسازی شد. نتایج حاصل از RAPD و ERIC نیز دال بر کارایی نسبی این روش ها در شناسایی و دسته بندی سویه های EPEC و STEC می باشد.
- Abstract
- This study aimed to evaluate prevalence, characteristics, genotypic diversity and antibacterial susceptibility of Escherichia coli encoding Shiga toxin and intimin in wild captive animals in different zoos of Iran. A total of 274 faecal samples were collected from herbivores, carnivores and monkeys and then subjected to molecular detection of stx1, stx2 and eae genes. Also Non-sorbitol fermenting (NSF) Escherichia coli isolates and positive strains for virulence factors were subjected to serogroup specific PCR for rfb O157 gene. Besides, all E. coli isolates which had been positive for the virulence genes were subjected to ERIC and RAPD-PCR. The presence rates of stx gene in carnivores, herbivores and monkey were 12.3, 8.3 and 22.7%, respectively. In comparison, the presence rates of eae gene in carnivores, herbivores and monkey were 10.3, 9 and 22.7%, respectively. After typing of the eae genes, it became clear that all eae genes were belonged to gamma and theta types. It is necessary to mention that E. coli O157:H7 was only detected from monkeys including a baboon, three rhesus monkeys and a chimpanzee. The results of RAPD and ERIC-PCR showed low diversity of the STEC and EPEC strains.
