عنوان پایان‌نامه
تنوع ژنتیکی سویه های ویروسی عامل بیماری لکه سفید میگو براساس Orf۷۵ در مراکز تکثیر و پرورش میگوی کشور
- رشته تحصیلی
- بهداشت آبزیان
- مقطع تحصیلی
- دکتری تخصصی PhD
- محل دفاع
- کتابخانه دانشکده دامپزشکی شماره ثبت: 720 ت;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 81419;کتابخانه دانشکده دامپزشکی - مخزن مرد آباد شماره ثبت: 720 ت;کتابخانه دانشکده دامپزشکی شماره ثبت: 720 ت;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 81419;کتابخانه
- تاریخ دفاع
- ۱۰ تیر ۱۳۹۶
- دانشجو
- مظاهر زمانی گندمانی
- استاد راهنما
- مهدی سلطانی, علی طاهری میرقائد
- چکیده
- ویروس لکه سفید میگو یک DNA ویروس دو رشته ای است که باعث وارد کردن بیشترین خسارت اقتصادی به صنعت پرورش میگو در ایران و جهان شده است. اولین شیوع بیماری در ایران در سال 1380 در آبادان اتفاق افتاد و سپس مزارع تکثیر و پرورش میگوی استان های ساحلی خلیج فارس و دریای عمان را درگیر کرد. در این مطالعه از تعداد 33 ایزوله ویروسی عامل تلفات که طی سال های 1389 تا 1394 جمع آوری شده بود استفاده شد. پس از تایید تشخیص ایزوله ها به روش PCR، آنالیز توالی های بدست آمده در ناحیه تکرار شونده ORF 75 با استفاده از پرایمر اختصاصی ORF 75، تفاوت ژنومی بین ایزوله-ها و گروه های آنها در سه کلاستر مربوط به مناطق جغرافیایی نشان داده شد. آنالیز توالی ها، تعداد تنوع تکرارهای پشت سر هم (VNTRs) در نواحی کدگذاری شده ORF 75 در ایزوله های ویروس جدا شده از ایران، دو الگوی تکرار (RUs 11 و 5) با برخی سویه های ویروس جدا شده از هند مشابه بودند، در حالی که در یک واحد تکرار bp45 در الگوی تکرار توالی های ژنوم ایزوله های رفرنس از تایلند (با bp12) و کره جنوبی (باbp4) متفاوت بودند، بنابراین این موضوع را تایید می کند که هند را می توان به عنوان یکی از منابع اصلی ایزوله های ایران دانست یا اینکه حداقل با سویه های تایلند و یا کره جنوبی دارای منشا یکسان هستند که به دنبال واردات پست لاروهای زنده وارد کشور شده اند.
- Abstract
- White spot syndrome virus (WSSV) is a double-stranded DNA virus that causes the most serious losses to shrimp farmers worldwide. Since the first WSSV incidence in Iran in 2001, it has caused several outbreaks with high mortality and economic loss in the Iranian shrimp farming industry. During this study from 2010 to 2015, WSSV was also diagnosed as the causative agent of 10 of 33 unexplained mass mortality in farmed shrimp in four provinces along the coastal areas of the Persian Gulf and the Gulf of Oman, indicating the continues WSSV outbreaks in Khuzestan, Bushehr, and Sistan and Baluchestan provinces, as well as the first outbreak of the virus in Hormozgan province in Iran. Sequence analysis of the amplified region using OIE-recommended primer sets also shows genomic variation between the isolates, and grouped them in three clusters related to their geographic origins, suggesting the new sequence region and primer sets for Phylogenetic analysis of WSSV Sequence analysis of variable number of tandem repeats (VNTRs) within the coding regions of ORF75 of Iranian WSSV isolates was also revealed two repeat patterns (11 and 5 RUs) that were identical to some Indian isolates, while were differenced by deletion and insertion of one 45bp RUs from the repeat patterns of reference genomes from the Thailand (12 RUs) and South Korea (4 RUs), respectively suggesting the India as the main source or at least the same ancestor from Thailand and/or South Korea may be via importation of live post larvae.
