عنوان پایان‌نامه
بررسی حضور ژنهای مربوط به چسبندگی
- رشته تحصیلی
- میکروبیولوژی
- مقطع تحصیلی
- دکتری تخصصی PhD
- محل دفاع
- کتابخانه دانشکده دامپزشکی شماره ثبت: 488 ت;کتابخانه دانشکده دامپزشکی - مخزن مرد آباد شماره ثبت: 488 ت;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 53385
- تاریخ دفاع
- ۰۹ خرداد ۱۳۹۱
- دانشجو
- خاطره کفشدوزان
- استاد راهنما
- تقی زهرائی صالحی
- چکیده
- کلی باسیلوز یکی از بیماریهای بسیار شایع در صنعت طیور است که توسط گروهی از باکتریهای اشریشیاکلی بیماریزا در خارج از دستگاه گوارش ایجاد می شود. این بیماری بسته به حدت سویه، وضعیت میزبان و حضور انواع عوامل مستعد کننده باعث ایجاد عوارض متعددی در ارگانهای مختلف می شود. از عوارض مهم این بیماری می توان به سپتی سمی، پریکاردیت، پری هپاتیت، التهاب کیسه های هوایی، التهاب و عفونت مجاری تخمدان و سندروم کله بادی اشاره کرد. علیرغم مطالعات زیادی که در سالهای اخیر برای درک روند بیماریزایی این باکتری صورت گرفته است، هنوز تعریف دقیقی برای توصیف پاتوتیپ های بیماریزا در طیور وجود ندارد. از آنجاییکه اشریشیاکلی های بیماریزا در دستگاه ادراری انسان نیز جهت استقرار در محل عفونت با چالش های مشابه سویه های بیماریزای طیور مواجهند، در این مطالعه هشت ژن مرتبط با حدت این باکتری در 246 سویه جدا شده از دستگاه تنفس پرندگان مبتلا به کلی باسیلوز،53 سویه جدا شده از کلواک پرندگان به ظاهر سالم و 20 سویه جداشده از عفونت دستگاه ادراری انسان با دو روش واکنش زنجیره ای پلیمراز چندگانه وکلونی هیبریداسیون مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج حاصل از این تحقیق با آنالیز آماری مربع کای (05/0>p) نشان داد که تفاوت معنی داری در فراوانی ژن های iss, iroN, hly F و omp T در سویه های مرتیط با APEC و AFEC وجود دارد و احتمالا این ژنها در حدت و بیماریزایی این باکتری موثر هستند. مقایسه دو روش واکنش زنجیره ای پلیمراز و کلونی هیبریداسیون برای ژن های pap G II ,sfa s,afa نیز نشان داد، آزمون کلونی هیبریداسیون قادر به یافتن موارد مثبت بیشتری نسبت به واکنش زنجیره ای پلیمراز است. درمقایسه سویه های APEC و UPEC نیز نشان داده شد که فراوانی ژن های مورد مطالعه در پاتوتیپ APEC به طور معنی داری بیشتر از UPEC است و ارتباطی بین این دو پاتوتیپ مشاهده نگردید.
- Abstract
- Colibacillosis is one of the most prevalent diseases in the world of poultry industry that causes to multimillion dollar annual losses. Indeed of more studies on Escherichia coli isolated from poultry, there are no certain traits to define APEC pathotype. In order to evaluate molecular epidemiology of some virulence associated factors in E. coli, we investigated the presence of iut A, iss, hly F, omp T, iro N, afa, sfa(S) and pap G(II) by multiplex PCR assay and colony hybridization. Among 246 E.coli strain associated with colibacillosis and 53 AFEC strains, 85% of isolates were positive for at least one of virulence gene. The tree most prevalent gene in E.coli isolated from colibacillosis were hly F(77.3%), ompT(73%) and iss (68.2%). Iut A, iro N and pap G (II) were detected in (67.4%), (65.2%) and (17.6%) respectively. None of isolates harbored sfa (s) and afa gene. Several combination patterns of virulence genes were detected. Combination of hly F, omp T (70.8%) was the most prevalent pattern. With colony hybridization( 20.2%)pap G(II) and (1.2%) sfa(S) genes were detected and none of isolates harbored afa gene. The results showed colony hybridizaion is more sensitive to detect pap G(II) . The results of this study revealed colony hybridization is simpler and more sensitive than PCR assay. So, it is better to use as a useful technique in molecular epidemiologic studies.
