عنوان پایان‌نامه
آنالیز ژنتیکی دو فاکتور اصلی حدت ژنهای F وHN درپارامیکسوویروس های سروتیپ ۱ جدا شده از مرغان بومی
- رشته تحصیلی
- بیماریهای طیور
- مقطع تحصیلی
- دکترای تخصصی
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 76841;کتابخانه دانشکده دامپزشکی - مخزن مرد آباد شماره ثبت: 658 ت;کتابخانه دانشکده دامپزشکی شماره ثبت: 658 ت;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 76841;کتابخانه دانشکده دامپزشکی - مخزن مرد آباد شماره ثبت
- تاریخ دفاع
- ۱۲ تیر ۱۳۹۵
- دانشجو
- فرشته صبوری
- استاد راهنما
- مهدی وصفی مرندی
- چکیده
- بیماری نیوکاسل (ND) یکی از بیماریهای بسیار مسری است که اکثر گونه‌های پرندگان را آلوده می‌کند و سبب مشکلات اقتصادی قابل توجه در صنعت طیور می‌گردد. طیور بومی اصلی‌ترین منبع تأمین غذا در مناطق روستایی اکثر کشورهای در حال توسعه می‌باشد و نقش مهمی را در اپیدمیولوژی ND بازی می‌کنند. با توجه به اطلاعات ما، تاکنون مطالعاتی در ارتباط با بررسی ژنتیکی و فیلوژنتیکی دو فاکتور اصلی حدت (ژن F و HN) در ویروس بیماری نیوکاسل (NDV) جداشده از طیور بومی انجام نشده است، لذا بررسی دقیق این ژن‌ها می‌تواند در افزایش شناخت ما در رابطه با خصوصیات ژنتیکی NDV در حال گردش و همچنین اتخاذ سیاست‌های کنترلی مفید واقع گردد. در این مطالعه، قسمت کدکننده دو ژن F و HN هشت NDV جدا شده (SMV-1-SMV-8) از طیور بومی در سال‌های 1392-1390 به‌طور کامل توالی‌یابی و مورد بررسی مولکولی و فیلوژنتیکی قرار گرفت. ژنهای F و HN این هشت جدایه بیشترین شباهت نوکلئوتیدی (به‌ترتیب حدود 97% و 96%) را به ویروس‌های ND جدا شده از پرندگان آبزی اهلی (غاز، اردک موسکوی و اردک) چین نشان دادند. این شباهت می‌تواند بیانگر این باشد که منبع این سویه‌ها ممکن است از چین باشد. براساس مطالعات فیلوژنتیکی ژنهای F و HN، هر هشت جدایه در یک تحت‌ژنوتیپ جدید از ژنوتیپ VII قرار گرفتند. جدایه‌های مورد بررسی دارای توالی 117G/R-R-R-Q-K-R?F111 مختص سویه‌های حاد بودند. ویروس‌های SMV-4 و SMV-5 در جایگاه اپی‌توپ نوترالیزان دارای موتاسیون Q153R بودند. موتاسیون در جایگاه‌های اپی‌توپ نوترالیزان ممکن است سبب ایجاد واریانت‌های آنتی‌ژنیک متفاوت گردد. ویروس‌های جداشده از طیور بومی دارای اسیدآمین? 347Q از جایگاه‌های مرتبط با اپی‌توپ نوترالیزان در گلیکوپروتئین HN درمقایسه با سایر ویروس‌های استخراج‌شده از بانک ژنی بودند. روش‌های پرورش طیور بومی احتمال تماس بین گونه‌های مختلف طیور و پرندگان وحشی را افزایش می‌دهد و متعاقباً سبب تکامل سویه‌های جدید و انتقال مابین آن‌ها می‌گردد. بنابراین، پایش مداوم NDV در گله‌های طیور جهت به‌دست آوردن اطلاعات در زمین? سیر تحول NDV و اصلاح استراتژی‌های کنترلی در طیور بومی کمک‌کننده می‌باشد.
- Abstract
- Newcastle disease (ND) is one of the most serious diseases amongst many species of birds and causes huge economic losses in poultry sector. Backyard poultry are the main source of food in rural areas of many developing countries and play crucial role in the epidemiology of ND. To our knowledge, genetic and phylogenetic study of two virulence factors (F and HN) of Newcastle disease virus (NDV) isolated from backyard poultry in Iran has not been done yet; therefore, molecular determination of these genes can increase our knowledge on genetic characteristic of NDV in circulating viruses and also provide useful guidelines for the control strategies. In this study, we sequenced the complete open reading frame of F and HN genes in eight viruses (SMV-1-SMV-8) that were isolated in 2011-2013. F and HN genes of all characterized NDVs had high similarities (approximately 97% and 96%, respectively) to Chinese strains isolated from domestic waterfowl (goose, Muscovy duck and duck). The phylogenetic analysis revealed that studied strains fell into genotype VII and grouped in a specific sub-genotype. All tested NDVs have cleavage site of 111G/RRRQKR?F117, representing that all of them belonged to velogenic strains. SMV-4 and SMV-5 displayed R153Q mutation in neutralizing epitopes of F protein. Substitution in these sites may cause to form antigenic variants. Sequence of HN protein revealed that all studied isolates have Q347 in neutralizing epitopes in comparison to other viruses obtained from GenBank. Rearing methods of backyard poultry increase the chance of contact between a variety of poultry and wild birds; subsequently, new strains evolve and transmit between them. Therefore, continuous monitoring of NDVs in backyard poultry would help to obtain more information about the evolution of NDVs and improve new control strategies in backyard poultry.
