عنوان پایان‌نامه
جداسازی و تعیین خصوصیات مولکولی پارامیکسوویروس های تیپ ۱جداسازی شده از کبوترها
- رشته تحصیلی
- بیماریهای طیور
- مقطع تحصیلی
- دکترای تخصصی
- محل دفاع
- کتابخانه دانشکده دامپزشکی شماره ثبت: 657 ت;کتابخانه دانشکده دامپزشکی - مخزن مرد آباد شماره ثبت: 657 ت;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 75706;کتابخانه دانشکده دامپزشکی شماره ثبت: 657 ت;کتابخانه دانشکده دامپزشکی - مخزن مرد آباد شماره ثبت: 657 ت;
- تاریخ دفاع
- ۲۹ خرداد ۱۳۹۵
- دانشجو
- آریا رضایی فر
- استاد راهنما
- سیدمصطفی پیغمبری
- چکیده
- کبوترها به عنوان یکی از مخازن طبیعی مهم در همه¬گیر¬شناسی بیماری نیوکاسل مورد توجه هستند. در این مطالعه توالی بخشی از ژن پروتئین فیوژن در 17 جدایه ویروس بیماری نیوکاسل جداسازی شده در سال¬های 1391 و 1392 از موارد بیماری در کبوترهای ایران مورد مطالعه قرار گرفت. الگوی اسیدهای آمینه در محل شکاف پیش¬ساز پروتئین فیوژن (F) در تمامی جدایه¬ها بیانگر توان بیماریزایی آنها بود. الگوی اسیدهای آمینه مشاهده شده در دو جدایه این مطالعه 112RRQRRF117 بود که رایج¬ترین توالی در میان سویه¬های جداسازی شده سال¬های اخیر در ایران است. هر چند غالب جدایه¬های این مطالعه توالی 112RRQKRF117 را نشان می¬دادند که برای نخستین بار در ویروس¬های بیماری نیوکاسل جداسازی شده از ایران مشاهده شد. تحلیل فیلوژنی بر اساس توالی بخشی از ژن پروتئین F تمامی این 17 جدایه متنوع را در دو گروه ژنتیکی درون ژنوتیپ VI ویروس¬های رده II بیماری نیوکاسل قرار داد. بر این اساس 15 جدایه بدست¬آمده در این مطالعه بالاترین شباهت را به گروهی از ویروس¬های کمتر مطالعه شده و متعلق به تحت ژنوتیپ VIb/2 بویژه ویروس¬های بیماری نیوکاسل جداسازی شده از موارد بیماری در کبوترهای روسیه داشتند. دو جدایه دیگر این مطالعه تنوع ژنتیکی بالایی از دیگر ویروس¬ها داشتند و در گروهی جدا از اعضاء تحت ژنوتیپ VIb قرار گرفتند. بنابراین حداقل دو گروه ژنتیکی مختلف از اعضاء ژنوتیپ VI ویروس بیماری نیوکاسل مسئول رخداد بیماری نیوکاسل در کبوترهای ایران هستند و به طور همزمان با سویه¬های بیماریزای ژنوتیپ VII در جمعیت پرندگان ایران در حال چرخش هستند. چرخش ادامه¬دار گروهی از ویروس¬های بیماریزای بیماری نیوکاسل در جمعیت پرندگان گسترده¬ای مثل کبوترها خطر انتقال و رخداد بیماری ناشی از آن در گله¬های تجاری ماکیان و سایر طیور را بسیار محتمل می¬گرداند. بنابراین پایش مداوم و تعیین خصوصیات ویروس¬های بیماری نیوکاسل در حال چرخش در ایران بایستی در برنامه¬های کنترلی بیماری مورد توجه قرار گیرد.
- Abstract
- Pigeons are considered as one of the major natural reservoirs in the epidemiology of Newcastle Disease (ND). In this study, for the first time, the partial sequence of F gene in 17 pigeon-origin ND viruses isolated during 2012–2013 in Iran was analyzed. All of the studied isolates possessed virulent F0 protein cleavage site. The amino acid sequence of 112RRQKRF117 is the most common motif among Iranian ND viruses whereas 112KRQKRF117 has not been reported there before. Phylogenetic analysis revealed that all these diverse isolates were grouped in two distinct clusters within class II genotype VI. Based on the partial fusion protein gene sequence, 15/17 isolates have the highest genetic identity to the limited studied subgenotype VIb/2 on top of that, the Russian members. The other two isolates showed a high degree of genetic diversity from others and were placed in a cluster apart from the members of VIb. Based on the findings at least two distinct clusters in genotype VI have been causing ND outbreaks in pigeon population and are circulating simultaneously along with virulent NDVs of genotype VII in various species in Iran. The continuing circulation of a diverse group of vNDVs as an enzootic in a spread population like pigeon can cause outbreaks in commercial poultry flocks and also failure in controlling program. Therefore the constant monitoring and being aware of the virus characteristics should be considered in controlling program against ND in Iran. Keywords: Newcastle disease virus, PPMV-1, pigeon, Fusion protein, phylogenetic analysis, Iran
