عنوان پایان‌نامه
بررسی نقش microRNA ها در تنظیم بیان ژنھای مرتبط با بیماری گلوکوم
- رشته تحصیلی
- بیوتکنولوژی
- مقطع تحصیلی
- دکتری تخصصی پیوسته
- محل دفاع
- کتابخانه پردیس علوم شماره ثبت: 5623;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 67887
- تاریخ دفاع
- ۱۹ مهر ۱۳۹۳
- دانشجو
- امیر بنائی اصفهانی
- استاد راهنما
- الهه الهی
- چکیده
- آب سیاه (glaucoma) اصطلاحی است برای گروهی از بیماری هایی چشمی، که با آسیب عصب بینایی مشخص می شوند. این بیماری بعد از آب مروارید (cataract) دومین علت کوری در سراسر جهان است. miRNA های خانواده ای از non-coding RNA ها می باشند که با ایجاد رابطه مکملی با رونوشت ژن های هدف خود، بیان آن ها را کاهش می دهند. در این پژوهش تلاش بر آن بود که اثر miRNA های مختلف که بوسیله محاسبات بیوانفورماتیکی به دست می آید را بر پنج ژن WDR36، RGS5، FGF2، CDH11 و CHI3L1 مورد ارزیابی قرار دهیم. WDR36، تنها ژنی از بین ژن های مذکور است که عامل بیماری آب سیاه محسوب می شود. از چهار ژن دیگر به عنوان ژن های مرتبط با بیماری آب سیاه، یاد می شود. نتایج این پژوهش، اثر مثبت و معنی دار miRNA های mir-204، mir-211، mir-23a، mir-23b، mir-27a و mir-27b را بر ناحیه 3 UTR ژن های مذکور نشان می دهد. امید است که نتایج این پژوهش گامی در راستای درک مکانیسم بیماری زایی این ژن ها باشد.
- Abstract
- Objective(s): An earlier meta-analysis on gene expression data derived from four microarray, two cDNA library, and one SAGE experiment had identified RGS5, FGF2, CHI3L1 and CDH11 as four of only ten non-housekeeping genes that were reported to be expressed in human trabecular meshwork (TM) cells by all studies. On the other hand WDR36 had been addressed as one of the causative genes of Glaucoma. The TM tissue is the route of aqueous fluid outflow, and is relevant to the pathology of glaucoma. MicroRNAs constitute the most recently identified components of the cellular machinery for gene regulation in eukaryotic cells. Given our long standing interest in glaucoma, we aimed to identify miRNAs that may target the mentioned genes. Materials and Methods: Eleven miRNAs were selected for study using bioinformatics tools and available data on miRNAs expressed in the eye. Their effects were assessed using the dual luciferase assay. 3'-UTR segments of the mentioned genes were cloned downstream of a luciferase coding gene in psiCHECK2 vectors, and these were co-transfected with each of the miRNAs into HEK293 cells. Results: The outcomes evidenced that CDH11, FGF2, RGS5 and WDR36 are in fact targeted at least by one of our selected microRNAs. Down regulations by the miRNAs were statistically significant. The effect of miR-204 is considered particularly important as this miRNA is well known to regulate eye development and to affect multiple ocular functions.
