عنوان پایان‌نامه
ردیابی مولکولی کروناویروس سویه های پرندگان در پارکهای پرندگان در استان تهران
- رشته تحصیلی
- دامپزشکی
- مقطع تحصیلی
- دکتری عمومی
- محل دفاع
- کتابخانه دانشکده دامپزشکی شماره ثبت: 3608;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 70725;کتابخانه دانشکده دامپزشکی - مخزن مرد آباد شماره ثبت: 3608
- تاریخ دفاع
- ۳۱ شهریور ۱۳۹۴
- دانشجو
- حنانه یعقوبی
- استاد راهنما
- وحید کریمی, آرش قلیان چی لنگرودی
- چکیده
- بررسی وجود کرونا ویروس ها در همه حیوانات اهمیت بسیاری پیدا کرده است به خصوص درپرندگان که وجود کروناویروس، خواه با نشان دادن علایم درمانگاهی خواه بدون آن ثابت شده است. با توجه به فقدان اطلاعات مولکولی مستند هدف از این پایش ،ردیابی ملکولی کروناویروس در باغ های پرندگان استان تهران می باشد که برای اولین بار در ایران در سال های 94-1393 صورت گرفت . در این بررسی نمونه گیری به روش سواب کلواک انجام گردید. هر سه سواب در یک میکروتیوب قرارگرفت وعمل استخراج با استفاده از کیت استخراج شرکت Roche انجام شد. سپس RNA استخراج شده با کیت تک مرحله ای کیاژن و با استفاده از پرایمرهای ژن نوکلئوپروتئین(N) و ناحیه ی غیر قابل ترجمه(UTR) مورد تکثیر قرار گرفت و موارد مثبت آن ها توالی یابی گردید. از مجموع گونه های مورد بررسی، بلدرچین، قرقاول، کبک ، بوقلمون و مرغ بومی حاضر در باغ های پرندگان استان تهران، نمونه های مثبت ردیابی گردید. نتایج حاصل از این مطالعه حاکی از گردش ویروس در بین گونه های پرندگان می باشد و وجود ویروس در بین بسیاری از پرندگان و پستانداران محتمل است که که پیشنهاد می شود در مطالعات بعدی جداسازی ویروس و بررسی پاتوژنز ویروس های جدا شده و سایر ژن های کروناویروس از جمله ژن پروتئین اسپایکS)) صورت گیرد.
- Abstract
- Avian coronavirus molecular detection in birds gardens of Tehran Province The infectious bronchitis virus (IBV) is distributed worldwide. Chickens are the most important natural hosts of IB; all ages of chickens can be infected. IBV, or closely related coronaviruses have also been isolated from other species such as turkeys, pheasants, quail and partridges. There has been no molecular surveillance data to describe the epidemiology of coronaviruses in such birds in Iran. The aim of the present study was coronavirus detection in Tehran birds Gardens between 2015-2016. Cloacal swabs were taken and the viral RNA was extracted using Roche extraction kit. The RT-PCR carried out by QIAGEN one step RT-PCR kit using the primers targeting “UTR” and “N” genes. Coronavirus was detected in the quails, pheasants, turkeys and partridges. Nucleotide sequences of positive samples were determined and the phylogenetic tree was constructed. According to our results, coronaviruses are circulating in different bird types in Iran and further studies are needed to isolate these viruses and evaluate their pathogenesis.
