عنوان پایان‌نامه
ارزیابی پلی مور فیسم ژن
- رشته تحصیلی
- بیماریهای طیور
- مقطع تحصیلی
- دکترای تخصصی
- محل دفاع
- کتابخانه دانشکده دامپزشکی شماره ثبت: 467 ت;کتابخانه دانشکده دامپزشکی - مخزن مرد آباد شماره ثبت: 467 ت;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 51197
- تاریخ دفاع
- ۱۹ آذر ۱۳۹۰
- دانشجو
- مسعود هاشم زاده اهرنجانی
- استاد راهنما
- وحید کریمی
- چکیده
- ویروس برونشیت عفونی در پرندگان جوان موبرونشیت عفونی در پرندگان جوان موجب عفونت دستگاه تنفسی، کاهش وزن‌گیری وعدم استفاده بهینه از دان مصرفی می باشد. این ویروس می‌تواند از عوامل مستعد کننده و آغازگر دیگر عفونت‌های ویروسی و باکتریایی که سبب بیماریهای تنفسی و سیستمیک می شوند به شمار رود. طبیعت قابل انتقال ویروس و ظهور سروتیپ‌های متعدد موجب گردیده است که کنترل این بیماری را علیرغم استفاده از واکسن‌ها امری پیچیده نماید. هدف از این مطالعه بررسی تعیین هویت ملکولی ژن S1 ویروس برونشیت عفونی پرندگان در نمونه‌های جدا شده از گله‌هایی با علائم سندرم تنفسی طی زمستان 88 و بهار 89 در ایران بود. در این مطلعه شجره شناسی و توالی اسیدهای نوکلئیک و اسید آمینه‌های متناظر قطعه‌ای از ژن S1 در چهار جدایه این مطالعه، Razi-HKM891 Razi-HKM894, Razi-HKM893, Razi-HKM892 و 19 جدایه استاندارد و وحشی ویروس برونشیت عفونی پرندگان از کشورهای مختلف، به عنوان نماینده سویه های آن کشور ها و 6 جدایه ایران که قبلاً در بانک ژن ثبت گردیده‌اند به عنوان نماینده جدایه‌های ایران و ده نوع واکسن رایج مورد مصرف در ایران و سایر کشورهای جهان بررسی و مورد مقایسه قرار گرفتند. جدایه Razi-HKM891 و Razi-HKM894 همخوان با سویه پاتوژن 91/4 بودند. اسیدهای آمینه جدایه Razi-HKM892 با جدایه Razi-HKM893 حدود 3/17 درصد با یکدیگر و با دو جدایه Razi-HK891 و Razi-HKM894 7/22 درصد اختلاف نشان دادند. این جدایه‌ها 1/23درصد با سویه پاتوژن 91/4 و با سویه ماساچوست (M41) به ترتیب دارای 1/23 و 1/27 درصد اختلاف داشتند. جدایه‌های Razi-HKM892 و Razi-HKM893 با جدایه‌هایی که قبلا در ایران شناخته و در بانک ژنی ثبت شده اند نیز متفاوت می باشند. جدایه Razi-HKM893 برای اولین بار در ایران گزارش می شود و با جدایه‌های کشورهای فلسطین اشغالی و عراق دارای همحوانی بسیار زیاد دارد.
- Abstract
- .Infectious bronchitis is an acute, highly contagious, viral disease of poultry with worldwide distribution, and is continuously evolving through point mutation and recombination of their genome; subsequently the emergence of IBV variants complicates disease control. The objective of this study was to investigate genetic characterization of new IBV variants isolated from commercial chicken flocks in Iran collected between 2009 and 2010. The partial S1 gene of the spike protein, covering a hypervariable and constant regions, was amplified and sequenced using conventional RT-PCR. Phylogenetic analysis revealed four viruses designated as Razi-HKM891, Razi-HKM892, Razi-HKM893 and Razi-HKM894. Deduced amino acid sequence comparison with other IBV genotypes, published in the GenBank database, indicated that the isolates Razi-HKM891 and Razi-HKM894 were placed into the pathogenic 4/91. However, the isolates Razi-HKM892 and Razi-HKM893 were different with previously described isolates in Iran. The Razi-HKM893 is closely related to recently published isolates from Occupied Palestine (IS/720/99, IS/885) and Iraq (Sul/01/ 09), 96.5 % and 97.7 % amino acid sequence identities respectively. These isolates, included in the nephropathogenic IBV strains, belong to a new genotype in Middle East and likely indigenous to Iran. Infectious bronchitis (IB); Phylogenetic analysis; Amino acid sequence; Variants.
