عنوان پایان‌نامه
بررسی میلوژنی کنه هیالوما آناتولیکوم
- رشته تحصیلی
- انگل شناسی دامپزشکی
- مقطع تحصیلی
- دکتری تخصصی PhD
- محل دفاع
- کتابخانه دانشکده دامپزشکی شماره ثبت: 436 ت;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 48104;کتابخانه دانشکده دامپزشکی - مخزن مرد آباد شماره ثبت: 436 ت
- تاریخ دفاع
- ۱۶ اسفند ۱۳۸۹
- دانشجو
- مریم گنجعلی
- چکیده
- کنه ها بند پایان خونخواری هستند که علاوه بر این که با ایجاد کاهش وزن و کاهش تولید باعث آسیب اقتصادی می شوند، ناقل پاتوژنهای مهم حیوانی و انسانیند. آنها به عنوان ناقل مهمی برای انتقال بسیاری از عوامل بیماری زای ویروسی، باکتریایی، انگلی و ریکتزیایی مطرح هستند. با توجه به نقش کنه هیالوما آناتولیکوم آناتولیکوم در انتقال عوامل پاتوژن از جمله تیلریا لستوکاردی در ایران، شناخت دقیق این کنه بسیار مفید است. هر چند کلید تشخیص های فراوانی برای شناسایی کنه ها از جمله برای تشخیص گونه های هیالوما وجود دارد، اما استفاده از کلید های شناسایی مورفولوژیک آسان نیست و نیاز به افراد متخصص دارد. معمولاً اشتباه در تشخیص گونه ها و تحت گونه های کنه ها خصوصاً هیالوماهای گروه اکسکاواتوم که کنه های شایع در ایرانند به وفور اتفاق می افتد. به عنوان مثال، هیالوما آناتولیکوم آناتولیکوم بسیار شبیه هیالوما آناتولیکوم اکسکاواتوم است و این مساله باعث شده در تشخیص آنها دچار سردرگمی شویم. برای حل این مشکل، در این مطالعه از واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) برای بررسی توالی نوکلئوتیدی ناحیه(ITS2) کنه هیالوما آناتولیکوم آناتولیکوم استفاده شده است. بر اساس یافته های ما اندازه ژن ITS2 به دست آمده 963bp بود. توالی نوکلئوتیدی هیالوما آناتولیکوم آناتولیکوم با آنچه درGenBank ثبت شده بود 93 درصد شباهت داشت (Accession no FJ593700.1). با توجه به الاین توالی ITS2، تفاوت در قسمت بالای ژن کمتر است (3 درصد، از نوکلئوتید 608- 1) و بیشتر مربوط به قطعه دوم ژن ITS2 است (6 درصد، از نوکلئوتید 936- 608 ). در مقایسه توالی نوکلئوتیدی ژن ITS2 (bp963) کنه هیالوما آناتولیکوم آناتولیکوم به دست آمده در این مطالعه ، با توالی ITS2 ثبت شده در GenBank مشخص شد که توالی مذکور با توالی ITS2سایر گونه ها تشابه کمی دارد: هیالوما ترونکاتوم 21درصد (Accession no AJ437394. 1)، هیالوما درومداری 21 درصد (Accession no AJ437371.1)، هیالوما مارژیناتوم 29 درصد (Accession no AY228234. 1)، ریپی سفالوس تورانیکوس 13درصد (Accession no DQ849268.1)، ریپی سفالوس بورسا 13درصد (Accession no FJ416323.1) و درماسنتور اندرسونی 11درصد (Accession no EU520395.1). علاوه بر این توالی ژنی کنه هیالوما آناتولیکوم آناتولیکوم دیگری هم با اندازه 540bp در این مطالعه به دست آمد، که با توالی ثبت شده درGen Bank ، 96 درصد شباهت داشت .(Accession no FJ593703.1) توالی های به دست آمده در GenBank با شماره دسترسی HQ123320 , HQ 123321 ثبت شدند. بر اساس این یافته ها می توان نتیجه گرفت که ژن ITS2 هیالوما آناتولیکوم آناتولیکوم دارای تنوع ژنتیکی است و احتمالاً تنوع ژنتیکی ITS2 هیالوما آناتولیکوم آناتولیکوم می تواند در نتیجه یک جریان ژنی (هیبرید شدن) بین گونه های هیالوما باشد. قطعه اول ژن ITS2 هیالوما آناتولیکوم آناتولیکوم که تنوع ژنتیکی کمتری دارد، می تواند برای تفریق تحت گونه های هیالوما آناتولیکوم آناتولیکوم در نظر گرفته شود. این مطالعه در واقع یک اقدام ابتدایی برای تشخیص ITS2 کنه هیالوما آناتولیکوم آناتولیکوم است و باید بررسی تنوع درون گونه ای ITS2 هیالوما آناتولیکوم آناتولیکوم انجام شود. از طرفی با تکیه بر مشکلات موجود در تشخیص هیالومای گروه اکسکاواتوم بر اساس مورفولوژی لازم است که در مطالعات آینده توالی ژن ITS2 هیالوما آناتولیکوم اکسکاواتوم و هیالوما آسیاتیکوم آسیاتیکوم نیز بررسی گردد، تا کاربرد ژن ITS2 برای تفریق تحت گونه های هیالومای گروه اکسکاواتوم مشخص شود.
- Abstract
- Ticks are obligatory blood sucker arthropods which economically impact industry by reducing weight gain and production. Moreover, they are important vectors of human and animal pathogens. Ticks are considered as important vectors for transmission of many viral, bacterial, rickettsial and parasitical pathogens. Consideration the important role of Hyalomma anatolicum anatolicum in transmition of some pathogen as well as Theileria lestoquardi in Iran, accurate identification of this tick is very helpful. Although many identification keys are available for different species of ticks such as Hyalomma anatolicum anatolicum (koch 1844, Hoogstral and Kaiser 1959) but morphological identification is not so easy and always need experts. Usually, there are many misdiagnosis in morphological identification at the level of species and subspecies, specially for Hyalomma excavatum complex members which are prevalent ticks in Iran. For example Hyalomma anatolicum anatolicum is closely similar to Hyalomma anatolicum excavatum and this subject has caused some confusion in their identification. To dissolve this kind of difficulties, it has been decided to use polymerase chain reaction (PCR) for identification of Hyalomma anatolicum anatolicum. We have analyzed the nucleotide sequence of second Internal Transcribed Spacer (ITS2) of Hyalomma anatolicum anatolicum. The length of the ITS2 nucleotide sequence of Hyalomma anatolicum anatolicum was 963bp in our study. According our finding, nucleotide sequence of ITS2 region of Hyalomma anatolicum anatolicum in Iran has 93% homology to GenBank registered ITS2 sequence of this subspecies (FJ593700.1). When we compare the complete nucleotide sequence of ITS2 in Hyalomma anatolicum anatolicum determined in the present study with the sequences obtained from the GenBank, a nucleotide diversity of 7% could be observed. The sequence analysis showed that diversity occurred more in the down stream of the sequences (6%, from nucleotide 608 to 936) than in the upstream of the sequences (3%, from nucleotide 1 to nucleotide 607). Nucleotide sequence of Hyalomma anatolicum anatolicum showed less homology to the sequence of other tick species, for example 29% to Hyalomma marginatum (Accession no AY228234. 1), 21% to Hyalomma dromedarii (Accession no AJ437371.1), 21% to Hyalomma truncatum (Accession no AJ437394. 1), 13% to Rhipicephalus turanicus (Accession no DQ849268.1), 13% to Rhipicephalus bursa (Accession no FJ416323.1) and 11% to Dermacentor andersoni (Accession no EU520395.1). In addition we obtained another ITS2 nucleotide sequence (downstream region) from Hyalomma anatolicum anatolicum which is 540bp. It has 96% homology other in GenBank registered ITS2 sequence of this subspecies (Accession no FJ593703.1). The sequences of ITS2 region of rRNA gene from Hyalomma anatolicum anatolicum of Iran registered under accession no HQ123320 and HQ123321 by GenBank, respectively. When we compare these sequences we conclude that differences in nucleotide sequence of ITS2 region of Hyalomma anatolicum anatolicum can be understand as genetic variation of ITS2. It can be concluded that diversity in nucleotide sequence of ITS2 of Hyalomma anatolicum anatolicum in our study and previous registered in GenBank could be the result of a probably gene flow that exist with Hyalomma spp. in Iran. The common part of ITS2 (upstream region) could be considered as a target region for identification of Hyalomma anatolicum anatolicum, which is essential for studies on their ecology and on the transmission of tick borne disease. A polymorphism in nucleotide sequence of ITS2 could be detected by Hyalomma anatolicum anatolicum. This polymorphism should be analyzed in more sample of Hyalomma anatolicum anatolicum and other members of Hyalomma excavatum complex from different geographical parts of the country to determine the validity of ITS2 in Identification of These groups of ticks.
