عنوان پایان‌نامه
نقشه یابی ارتباطی تحمل یخ‌زدگی در جو زراعی
- رشته تحصیلی
- علوم مرتع
- مقطع تحصیلی
- دکتری تخصصی PhD
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 7131;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 77351;کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 7131;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 77351
- تاریخ دفاع
- ۲۷ شهریور ۱۳۹۵
- دانشجو
- ایمان ناصح غفوری
- استاد راهنما
- منصور امیدی, محمدرضا بی همتا
- چکیده
- تحمل یخ‌زدگی و توانایی بقای گیاه در دماهای زیر صفر در جو یکی از صفات مهم زراعی جو به شمار می آید است. به منظور شناسایی نواحی ژنتیکی مسئول تحمل یخ‌زدگی، نقشه‌یابی ارتباطی در 100 واریته جو دوردیفه بر اساس پویش کل ژنوم انجام گرفت. خسارت‌های ناشی از یخ‌زدگی به وسیله ارزیابی فلورسانس کلروفیل II (Fv/Fm ) و بررسی پایداری غشای سلولی (تراوش یونی) انجام گرفت. ارزیابی ژنوتیپی با استفاده از 4171 نشانگر اس.ان.پی با فراوانی بیشتر از ده درصد و بر اساس مدل خطی مخلوط صورت پذیرفت. براساس نتایج نرم‌افزار استراکچر و تحلیل فیلوژنتیک براساس ترسیم دندوگرام، ارقام به دو زیرگروه، ارقام قدیمی و ارقام جدید تقسیم شدند. شاخص عدم تعادل نشان داد که کاهش میانگین عدم تعادل در جمعیت مورد بررسی در فاصله 3/8 سانتی مورگان بین نشانگرها سرعت گرفته و بیشترین تاثیر پیوستگی روی عدم تعادل در این نقطه است. با استفاده از مدل خطی مخلوط تعداد 9 کیو.تی.ال برای صفات ارزیابی کارایی فتوسیستم II و تراوش یونی غشا در برابر تحمل یخ‌زدگی شناسایی شد که می توان به ژن HvCBF3 در ناحیه ژنومی Fr-H2 و همچنین اس.ان.پی 30929(HvBM5A) هم مکان با ژن Fr-H1/Vrn-H1 اشاره کرد. در آزمایش دوم کارآیی نشانگرهای HvBM5A، HvCBF14، Zcct-H , SNF2P و HvCBF3 برای گزینش ارقام مقاوم به یخ‌زدگی در 22 رقم اصلاح شده جو ایرانی مورد مطالعه قرار گرفت و بر اساس ارزیابی های ژنوتیپی بر مبنای پلی‌مورفیسم نشانگرهای مرتبط با Vrn-H1/Vrn-H2و رتبه بندی ارقام بر اساس الل های دو ژنوتیپ مرجع Nure(A) و Tremois(B) و وجود اختلاف بسیار معنی‌داربر اساس نتایج آزمون T استیودنت بین میانگین گروه‌های A و B بر اساس صفات مورد بررسی نشانگر HvBM5Aدر بین سایر نشانگرهای مورد بررسی انتخاب شد.
- Abstract
- Frost tolerance and ability of plant to survive subfreezing is one of the important economic and agronomic trait. In the present work, a Genome-Wide Association mapping study has been performed, looking for the genetig determinants of frost tolerance on 100 genotypes of barley cultivars. Frost damage was evaluated by measuring chlorophyl II fluorescence (Fv/Fm) and membrane integrity (Electrolyte Leakage). Genetic association of the traits was sought with 4171 SNP markers with minor allele frequencies (MAFs) more than 10 percent using a mixed liner model approach. Based on phylogenic analysis and result of Structure software, population structure was determined and genotypes were divided into two groups insist of modern based on year of releases. Extent of LD showed that average LD was observed to decay at 3.8 CM and linkage have the greatest impact on linkage disequilibrium at this point. Using a mixed linear model with kinship for controlling spurious LD effects, we found 9 significant marker trait (chlorophyll II fluorescence and electrolyte leakage) associations that can be noted HvCBF3 gene in FR-H2 and SNP30929 (HvBM5A) that cosegregate with Fr-H1/Vrn-H1. In second experiment, efficiency of indicators HvBM5A, HvCBF14, Zcct-H, SNF2P and HvCBF3 were evaluated for the selection of resistant genotypes to frost in 22 Iranian barley cultivars. assessment of genotypic markers based on polymorphisms associated with Vrn-H1 / Vrn -H2 and ranking cultivars based on the alleles of two reference genotypes Nure (A) and Tremois (B) and existence of significant difference between A and B groups based on result of T student showed that HvBM5A marker is the best marker among other markers that were investigated in this study for marker-assisted selection of vernalization and frost tolerance
