عنوان پایان‌نامه
بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های کمرکولی جنگلی (Sittaeuropaea Linnaeus,۱۷۵۸) در ایران با استفاده از نشانگرmtDNA
- رشته تحصیلی
- مهندسی منابع طبیعی - محیط زیست
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 6702;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 72545
- تاریخ دفاع
- ۲۰ بهمن ۱۳۹۴
- دانشجو
- مسعود نظری زاده دهکردی
- استاد راهنما
- محمد کابلی
- چکیده
- کمرکولی جنگلی (Sitta europaea) در ناحیه اوراسیا با حدود 18 زیرگونه از گسترش وسیعی در جنگلهای کهنسال خزان کننده برخوردار است. در ایران 2 زیرگونه‌یS.e. rubiginosa و S.e. persica به ترتیب در زیستگاههای جنگلی رشته کوههای زاگرس و البزر شناسایی شده‌اند. هدف از این مطالعه بررسی تنوع، ساختار ژنتیکی و تعیین جایگاه تبارشناختی زیرگونه‌های کمرکولی جنگلی در مقایسه با کلادهای اروپایی (European)، آسیایی (Asian) و قفقازی (Caucasian) است. بدین منظور تعداد 19 فرد از چهار جمعیت در جنگلهای البزر (گلستان و گیلان) و زاگرس (کرمانشاه و یاسوج) با مجوز از سازمان حفاظت محیط زیست زنده¬گیری و نمونه¬های خون برداشت گردید. سپس تغییرات ژنتیکی با استفاده از توالی کامل ژن ND2 (1041جفت باز) مورد بررسی قرار گرفت.تحلیل¬های تبارشناسی با استفاده از مدل TRN +G و رسم درخت بیزین و حداکثر درست نمایی انجام گرفت. همچنین روابط بین هاپلوتایپها با استفاده منطق اتصال میانه نمایش داده شد. نتایج درخت تبارشناسی و شبکه‌ی هاپلوتایپی نشان داد که جمعیت‌های البزر از سایر کلادهای آسیا، قفقاز و اروپا جدا شده است در حالیکه جمعیت‌های زاگرس در کلاد قفقاز قرار گرفتند. آزمون آنالیز واریانس مولکولی (AMOVA) تغییرات ژنتیکی معنی داری را در بین جمعیت‌های کمرکولی جنگلی و کلادهای آسیا، اروپا، قفقاز و البزر نشان داد. همچنین این چهار گروه با 3 درصد واگرایی ژنتیکی از یکدیگر جدا شدند. در نهایت جمعیت مختلف کمرکولی جنگلی در اوراسیا را میتوان به چهار واحد حفاظتی مهم (CSU) در طرحهای حفاظت از تنوع زیستی طبقه‌بندی نمود.
- Abstract
- The Iranian Eurasian Nuthatch is a resident bird in the Alborz and Zagros deciduous forests. We investigated the phylogenetic relationships and the taxonomic position of the Iranian Eurasian Nuthatch among other separated lineages of Eurasia. In this study, 19 individuals belonging to four populations from Eastern and Western Alborz, as well as Northern and Southern Zagros forests were captured and blood samples were collected. Genetic variation was then analyzed using complete ND2 gene sequence (1041bp). Genealogical analysis was done using TRN+G model, Bayesian trees and maximum likelihood. Additionally, median-joining algorithm was applied to reveal the relationships among haplotypes. The results of the phylogenetic tree and haplotype network indicated that Iranian Eurasian Nuthatch haplotypes of the Alborz Mountains formed distinct lineages from the Asian, Caucasian and European haplotypes, while the Zagros populations remained part of the Caucasian clade. An analysis of molecular variance (AMOVA) detected significant genetic structure variations among the Asian, Alborz, Caucasian and European lineages. Moreover, these four groups diverged from one another by an uncorrected genetic distance of 3%. Consequently, by regarding each lineage as a Conservation Significant Unit (CSUs), the adaptive diversity could be maintained through managing the populations of each evolutionary unit, separately. Keywords: Eurasian Nuthatch, Phylogenetic relationship, mtDNA, Alborz and Zagros Mountains
