عنوان پایان‌نامه
مطالعه نواحی کد کننده ژن BMP۱۵ در گوسفندان نژاد لری بختیاری، افشاری و آمیخته های آنها با رومانف
- رشته تحصیلی
- مهندسی کشاورزی - علوم دامی - اصلاح نژاد دام
- مقطع تحصیلی
- کارشناسی ارشد
- محل دفاع
- کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 6945;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 75372;کتابخانه مرکزی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی شماره ثبت: 6945;کتابخانه مرکزی -تالار اطلاع رسانی شماره ثبت: 75372
- تاریخ دفاع
- ۲۸ شهریور ۱۳۹۴
- دانشجو
- الهام ضامنی
- استاد راهنما
- مصطفی صادقی
- چکیده
- تنوع ژنتیکی نرخ تخمک ریزی در گوسفند بطور وسیع مورد مطالعه قرار گرفته است و نتایج تحقیقات نشان می-دهد که تفاوت های اساسی بین نژاد های مختلف گوسفند برای این صفت وجود دارد. دلیل این پدیده، وجود ژن-های با اثرات عمده گزارش شده است که میزان اثر سایر ژن ها را تحت تاثیر قرار می دهند. تا کنون سه ژن ALK6 ، GDF9 و BMP شناسایی شده است که بر رشد فولیکول ها و نرخ تخمک اندازی مؤثر هستند. از معروف ترین این ژن های عمده اثر در صفت چندقلوزایی گوسفند، ژن BMP15 می باشد که روی کروموزوم X واقع شده و شامل دو اگزون می باشد و توسط یک اینترون به طول 4/5 کیلوباز از هم جدا شده است. هدف از این تحقیق بررسی چندشکلی اگزون دو ژنBMP15 در گوسفندان لری بختیاری و افشاری و آمیخته این نژادها با نژاد رومانف بود. در این راستا از 227 راس گوسفند (44 راس نژاد لری بختیاری، 28 راس افشاری، 75 راس لری بختیاری رومانف ، 44 راس افشاری رومانف و 36 راس رومانف (شامل خون و اسپرم) خون گیری به عمل آمد و سپس DNA نمونه های خون با استفاده از روش بهینه یافته نمکی استخراج گردید. به منظور بررسی چندشکلی های موجود در اگزون یک و دو این ژن، از روش PCR-SSCP ، هضم آنزیمی و توالی-یابی استفاده شد. نتایج حاصل از PCR-SSCP و توالی یابی در اگزون یک، حذف سه نوکلئوتید را در تعدادی از نمونه های مورد بررسی در این جمعیت ها نشان داده و همچنین اگزون دو ژن BMP15 موردنظر فاقد هرگونه چندشکلی در بین تمام نمونه ها بوده است. پس ازتوالی یابی، هم ردیفی اگزون دو این ژن با توالی اگزون دو نژاد بلوچی پاکستان ثبت شده در پایگاه اطلاعاتی NCBI با شماره دسترسی JN655672.1 با استفاده از نرم افزار BioEdit 7.2 انجام گرفت و نتایج هم ردیفی نشان داد علی رغم عدم وجود چندشکلی در اگزون دو ژن BMP15در جمعیت های مورد مطالعه در این تحقیق، هشت جایگاه چندشکل در مقایسه با توالی ثبت شده برای نژاد بلوچی مشاهده شد که از این هشت SNP پنج مورد باعث تغییر اسیدآمینه در ساختار اول پروتئین شده اند.
- Abstract
- Litter size is an important economical trait in sheep breeding and reproduction. BMP15 is one of the most famous major genes in sheep breeding trait. This study was carried out to detect polymorphism in exon 2 of BMP15 gene in Lori-Bakhtiari and Afshari breed and their crossbred with Romanov sheep. Blood samples were taken from 227 sheep (44 Lori-Bakhtiari, 28 Afshari, 75 LoriBakhtiari-Romanov, 44 Afshari-Romanov and 36 Romanov) and blood samples DNA was extracted using salting out method. PCR-SSCP and sequencing method was applied for study about exon 1 and 2 of BMP15 gene. The results did not show any polymorphism at exon 2 but we have 3 nucleotide deletion at exon 1 . After sequencing, aligned exon 2 with the Balooch breed at NCBI data base with JN655672.1 accession number and the obtained result indicated that despite of no polymorphism in exon 2 of BMP15 gene at this society, eight SNP discovered after compared with Balooch breed sequence that five SNP related to change at first structure of protein.
